席間，格瓦拉又介紹了古巴革命的情況、古巴目前的狀況，以及古巴麵臨的來自美國的威脅。格瓦拉還總結了中國革命和古巴革命有兩點相似。他說：“你們革命的時候，蔣介石向你們進攻，說是‘圍剿’。我們那裏的反動派對我們也用這兩個字，甚至在策略上也是一樣的。”“另外一個相似點是，開始的時候，你們的革命在城市，有的人不願意到農村。我們也是一些人在打遊擊，在山區；另一部分人在城市搞罷工，但結果搞罷工的失敗了。”格瓦拉的這個總結得到毛澤東的肯定。
會見和宴請結束了，格瓦拉依依不舍地與毛澤東告別。毛澤東堅持走到勤政殿院外，送格瓦拉登車離去。
在隨後的時間裏，李先念副總理與格瓦拉就中古兩國經濟合作進行了會談，簽署了兩國政府的經濟合作協定、1961年度的貿易和科技合作兩個議定書，商定中國在1961年至1965年間給古貸款6000萬美元，援建一些工業項目，並在1961年度買古巴100萬噸糖及5000噸鎳、銅等。格瓦拉的中國之行取得了巨大成功。
魅力長存的理想主義傳奇戰士
古巴革命勝利後，中古關係十分密切，來往頻繁。中國誠心實意、盡其所能地援助古巴。中國以高出國際市場的價格購買古巴蔗糖，又把低於國際市場價格的大米和日用百貨源源不斷地運往古巴。
在格瓦拉訪華期間，李先念副總理與格瓦拉會談時甚至說：“格瓦拉少校，你們放心好了，我們願意保證你們的任何1個比索都不會打水漂兒。你想吃虧，我也不會讓你吃虧。”
但隨著中蘇論戰的展開和兩國關係的惡化，遠在加勒比海的古巴領導人，被逼到了一個十分困難、十分尷尬的位置。古巴國小力單，又有虎視眈眈的強鄰美國隔岸威脅。中蘇對立使卡斯特羅不得不作出痛苦的選擇。盡管中國誠心實意、盡其所能地援助古巴，但中國的實力畢竟不如蘇聯，古巴每年軋糖、發電以及汽車所需的1500萬噸石油，要靠蘇聯供應；古巴軍隊的武器裝備全靠蘇聯提供，蘇聯大批軍事人員駐紮在古巴。最終，卡斯特羅不得已倒向蘇聯。卡斯特羅作出最後抉擇花了將近兩年時間，可以說是一步一回首。在這段時間裏，他盡可能在中蘇之間做說和工作。1964年10月赫魯曉夫下台後，他又做了最後的努力。
1964年11月下旬，卡斯特羅召集拉丁美洲地區共產黨領導人到哈瓦那開會，討論國際共產主義運動和中蘇兩黨分歧問題。12月5日至22日，由古巴黨領導人羅德裏格斯率領拉美九國代表團訪問蘇聯、中國，調解中蘇兩黨分歧，結果無功而返。拉美九國代表團在華期間，毛澤東、劉少奇於12月14日還與來訪的代表團就國際共運問題舉行了會談，然而分歧未能消除。
正是在這種背景下，格瓦拉於1965年2月再次訪問了中國。
2月3日，格瓦拉暫時中斷了對非洲的訪問抵達北京，古黨政治局委員、書記處書記阿拉貢內斯隨行，此訪目的是進一步闡明古巴黨的立場並澄清一些問題。從2月4日起，中古雙方一共舉行了四次會談，劉少奇、周恩來、鄧小平等中國領導人都與格瓦拉見了麵。格瓦拉主張同蘇聯停止論戰，但他的建議未被接受，他也沒見到毛澤東。2月9日，格瓦拉帶著憂鬱匆匆離京，趕到阿爾及利亞去參加亞非團結組織第二屆會議。
值得一提的是，格瓦拉對毛澤東的崇敬之情猶在，在中古兩黨齟齬的年代，他沒有像拉丁美洲許多老牌共產黨領導人那樣發表過指責中國共產黨或毛澤東主席的言論。而且1965年2月在阿爾及利亞發表了震驚整個社會主義陣營的著名演講，幾乎公開抨擊蘇聯。
1965年4月，格瓦拉辭去在古巴擔任的黨、政、軍一切領導職務，並放棄古巴國籍，離開他心愛的妻子阿萊達及年幼的子女，“到帝國主義存在的一切地方去為反對帝國主義而鬥爭”。
格瓦拉首先帶領一批來自多國的戰士，去了非洲的剛果（利）東部，指導當地的左派遊擊隊。但他感到當地人不願認真打仗，失敗無法挽回，幾個月後，他失望地回到古巴。經過一係列準備之後，又於1966年11月率50多名革命者前往玻利維亞，因為他早就宣布要把革命之火燃燒到南美洲去。但是，格瓦拉的遊擊隊沒能與玻利維亞當地群眾融為一體，沒能得到當地老百姓的支持，因此，在玻利維亞軍隊和美國特工的打擊之下，不僅沒能發展，而且人員損失日益嚴重。
1967年10月8日在最後一次與敵軍遭遇時，格瓦拉右腿嚴重受傷，不幸被敵人生俘，9日上午被敵人槍殺。格瓦拉光榮地走完他戰鬥的一生。
格瓦拉渴望用遊擊戰方式繼續推進拉丁美洲的革命鬥爭。他學習過中國的遊擊戰理論，他提出的“遊擊中心論”卻又有一些不同之處，其中特別強調少數精英的作用，認為到處遊擊示範便可讓民眾一湧而起推翻反動政府。
格瓦拉取得古巴國籍後隻呆了六年，便拋棄古巴優裕且安寧的城市生活，再次進入毒蛇蚊蟲出沒的南美叢林。這對從小便患哮喘病的格瓦拉絕非易事，但他以解放整個拉丁美洲為己任，為了理想義無反顧。“遊擊中心論”隨著格瓦拉的犧牲而終結，但他忘我的人格魅力卻長存人間。西方對他冠以“紅色羅賓漢”、“共產主義的堂·吉訶德”等稱號，法國大哲學家薩特稱這位為了崇高的理想不惜舍棄黨和國家領導職務、遠赴異國他鄉苦心奮鬥的遊擊戰英雄是“我們時代最完善的人”。對於格瓦拉為什麼出走，多年來傳統意見是，他想擺脫國際共運的分歧，在南美洲再樹立起一個革命榜樣。從近年來發掘出的格瓦拉當年的一些文件筆記中看，格瓦拉其實有更深層次的想法，他對社會主義建設道路有諸多疑問，想另辟一條新路。