朱玫和李昌符的軍隊追趕聖駕，在寶雞附近的潘氏與護駕的神策軍打了一仗，神策軍指揮使楊晟大敗而歸，戰鼓的聲音行宮中都能聽到。田令孜趕緊帶著李儇離開寶雞繼續逃跑，留一部分禁軍守石鼻以拒來兵，還派感義軍和楊晟把守散關（位於寶雞市南郊秦嶺北麓）。
僖宗逃離寶雞時，逃難的老百姓和官兵壅塞道路，多虧神策軍將領王建和晉暉仗長劍左右保護，開出道路，僖宗才得以通過。熹宗讓王建背著傳國玉璽，扶掖著他爬過了大散嶺。這時李昌符的軍隊已經點火燒下山的閣道，王建扶掖僖宗冒煙通過。僖宗等夜宿板下，枕王建膝而眠，醒來才得到飲食。僖宗非常感激王建，脫下身上的錦袍送給王建，說：“這錦袍之上可是有我的眼淚啊！”。
僖宗剛剛離開寶雞，朱玫就領兵包圍了寶雞。朱玫的軍隊打敗了守石鼻的禁軍，但沒能攻克大散關，隻好回兵鳳翔。朱玫途中路過遵途驛遇見了正在驛中養病的襄王李煴。李煴是唐肅宗的玄孫，因為有病沒趕上聖駕，在驛館內養病，朱玫就把他也帶回了鳳翔。
光啟二年（公元886年`）二月份僖宗皇帝李儇車駕來到興元，李克用也回到太原。朱玫沒有能追回僖宗李儇，就起了再擁立一個皇帝的想法。他向宰相蕭遘說：“將士們征戰六年，才光複了京城，而皇上不辨是非，把大權給了閹豎，使亂綱紀，騷擾藩鎮，至生禍亂。我去迎駕，不能得到皇帝信任，好像我要劫持聖駕似的。我們的報國之心，戰賊之力都用盡了，可我們怎能俯首帖耳於閽人之下！李氏子孫多著呢，我們另立一個怎麼樣？”蕭遘不同意說：“僖宗皇帝執政十年，沒有什麼大過錯。主要是田令孜專權所致，將軍應該引兵還鎮，上表請回鑾駕。至於廢立之事，伊尹、霍光都做不到，遘不敢與聞。”
朱玫一意孤行，於公元886年四月在鳳翔威逼群臣立李煴為權監軍國事，朱玫自封為左右神策軍十軍使，挾持在鳳翔的官員回到長安。回到長安後，朱玫承製封拜百官。封鄭昌圖同平章事、判支度、鹽鐵、戶部，給他在三司配了副職，一應事務都由他去辦。封中書侍郎，同平章事蕭遘為太子太保。加裴澈判支度；自己又加封自己侍中、諸道鹽、鐵轉運使等。以淮南節度使高駢為中書令充淮南東道鹽鐵轉運使、諸道行營兵馬都統；和州刺史呂用之為嶺南東道節度使；大行封拜各路軍閥，以取悅藩鎮。全國十之六、七的藩鎮接受了李煴的偽命。而蕭遘卻稱病回永樂不再上朝。李昌符雖然也同朱玫一起擁立了李煴，但看到朱玫專權非常氣憤，他不受李煴封的官而轉向僖宗李儇上表，表示效忠。李儇加封他為校檢司徒，讓他相機剿滅朱玫。
襄王李煴派人給李克用下詔說：“上至半途，六軍變擾，滄黃宴駕，吾為藩鎮所推，今已受冊。”李玫也寫了書信，讓李克用歸順新朝。李克用看完詔書大怒，皇帝明明還在興元，好好的，怎麼說他宴駕了呢？李克用手下大將蓋寓對李克用說：“皇帝西逃，天下人都歸罪於我們，如果不殺李玫，罷黜李煴，我們就洗不清罪名。”李克用聽從了蓋寓的話，焚掉詔書，扣押了來使，傳檄鄰道要共討朱玫。
朱溫也收到了與李克用同樣的詔書，他看過以後，當著眾文武的麵，扯碎了詔說：“這是偽命偽詔，我決不做不忠之事。”但朱溫此時與秦宗權激戰正酣，暫時還顧不上僖宗皇帝的事。
五月下旬，秦宗權手下大將攻擊汴州，朱溫打敗了蔡州軍，接著派都將郭言帶步騎三萬去攻擊蔡州。
大太監田令孜幹了這麼多壞事，知道將為眾人所不容，主動推薦楊複恭為左神策軍中尉，觀軍容使，自己要求到四川去監軍，依附兄弟陳敬瑄。田令孜一走，楊複恭就將田令孜的手下都趕出了朝廷，他調王建為利州（今四川廣元市西北）刺史；晉暉為集州（在今巴中境內）刺史；張造為萬州刺史；李師太為忠州（今四川忠縣）刺史，為自專朝政做準備。
六月份，楊複恭派出扈蹕都將楊守亮帶兵二萬出金州，會合王重榮、李克用討伐朱玫，楊守亮本姓訾，是楊複光的幹兒子，所以改名為楊守亮。
七月份朱玫派大將王行瑜進攻興州，感義軍節度使楊晟敗守文州。僖宗派保鑾都將李鋋、扈蹕都將李茂貞、陳佩屯大唐峰抵擋。李茂貞是博野人，本名宋文通，因為屢立軍功，因此僖宗賜名為李茂貞。
九月份，朱玫大將張行實攻擊大唐峰，被擊敗。接著金吾將軍滿存與朱玫的邠州軍戰，朱玫軍隊又吃了敗仗，唐軍奪回興州。
十月份，在朱玫的帶領下，百官向李煴勸進。李煴即皇帝位，改元建貞，遙尊李儇為太上皇。