邠州節度使守侍中兼中書令王行瑜向昭宗請求作尚書令，昭宗身邊的宰相韋昭度密奏昭宗說：“太宗皇帝以尚書令執政，遂登大寶，自此這個職位不再授人臣。唯有郭子儀以大功拜尚書令，而郭子儀終生不敢自稱這個官諱。王行瑜怎敢這樣要求呢？”昭宗李曄就沒有答應封王行瑜為尚書令，封了他一個太師頭銜，並賜號尚父及鐵券。
昭宗李曄身邊另一位宰相崔昭緯暗結王行瑜、李茂貞、韓建，他派人告訴王行瑜：“前次皇帝已經同意任命你為尚書令，由於韋昭度的阻止，才沒能通過。現在韋昭度又和李溪勾結，熒惑聖聽，恐怕他們要做杜讓能以前做過的事。”在崔昭緯的挑唆下，王行瑜、李茂貞上表給昭宗要求罷免韋昭度和李溪官職。昭宗李曄開始不同意，他說：“行軍打仗朕與藩鎮軍帥商量，任命宰相不關你們的事。”但最後李曄還是迫於壓力讓了步，罷免了李溪的宰相，而任命他為太子太師。
王珂與王珙兵戎相見，爭當河中地區統帥，王行瑜、李茂貞、韓建都向昭宗上表要求皇帝李曄封王珙為護國節度使。李曄因為先已經答應了李克用的請求，於是便駁回了王行瑜等的表章。這一下惹惱了王、李、韓三帥，王珙又派人對他們說：“王珂是李克用的女婿，他占領河中，必與諸公不利。請諸位出兵討伐王珂。”王行瑜對這件事最積極，他馬上派弟弟匡國節度使王行約帶兵去打王珂，王珂則求救於李克用。
王行瑜、李茂貞和韓建感覺這件事小皇帝李曄太不聽話，竟敢駁他們麵子，於是決定到長安見見皇帝，講講理。
昭宗乾寧二年（公元895年）五月，農曆初八，王行瑜、李茂貞、韓建各帶數千士兵進入長安，驚得京城百姓四散奔逃。昭宗李曄隻好戰戰兢兢上安福門來見這三位軍帥，上了城樓，昭宗隻見樓下密密麻麻排滿了軍隊，前麵騎在馬上的正是王行瑜、李茂貞和韓建。城樓上當值太監向下喊道：“天子駕到，三位將軍還不下馬參駕？”王行瑜等三人見到昭宗，也隻好下馬行禮山呼萬歲。昭宗李曄壯起膽子問道：“三位卿家，沒有朕的宣召帶兵入京意欲何為？如果你們不想跟朕幹了，我就派別人代替你們。”王行瑜等三人這時並沒有商定要推翻李曄另立新君，他們隻想挾天子而令諸侯，昭宗這樣一問，他們倒不知怎樣回答。還是韓建口才好點，於是就把王珂不是王從盈的親兒子，不應作護國軍節度使的話當著李曄地麵再說一遍。李曄見他們還承認他這個皇帝也放下了一顆懸著的心。
昭宗李曄也不想得罪王行瑜等三人，於是就在皇宮擺宴請王、李、韓三帥赴宴。在宴會上，三人又提出：“南北司互有朋黨，惑亂朝政。韋昭度討西川失策，李溪作相不合眾心。”請昭宗把兩位宰相處死。這麼無禮的要求李曄怎麼能答應呢？王行瑜等三人可不管皇帝李曄答應不答應，他們要殺雞給猴看。宴會後他們立即派兵在都亭驛殺掉了韋昭度和李溪，接著又殺了樞密使康尚弼和幾個宮中的太監。這一下昭宗李曄老實了，隻好答應了他們的讓王珙當河中節度使，王行約去陝州，王珂去同州的要求。