隨著袁崇煥死去朝與後金的戰略持旋破。雙方實力消彼長朝在與後金對抗中越發居於劣勢。大好局麵破敗至，腐朽黑暗的朝又能去怪誰，這就叫自作孽不可。
當朝方麵忙著平定孔有德、耿仲叛亂時後金方麵也沒閑著。皇太極發動了對察哈爾蒙古林丹汗的征討，是為皇太極二征察哈爾林丹汗。在雄才大略的皇太極來，四年前女金朝對宋的戰爭所以會陷入僵局。一個非要因就是在大舉進軍中之前，金朝沒能掃平蒙古高這個後顧之憂。後來是來自蒙古高方的羈絆與牽製，才使得金朝無法全力下去滅亡宋。不僅如對蒙古、對宋兩條戰線的長僵持，讓金朝顧失彼首尾難顧，且不說白白空耗許多國力也加了自身衰落。可以說金朝後滅亡和它起初未能蕩平蒙古草諸部的戰略失誤有著關。有前車之鑒皇太極可不蹈金朝疲於兩線奔而亡的覆轍。為掃平入主中的後顧之憂，同時也為服蒙古部眾為己所用。皇太極決心集中全部力量消滅後金在蒙古高方的死敵，察哈爾蒙古部林丹汗。崇禎年、後金天聰年（元1632年）三月，皇太極“遣使諭歸降蒙古諸貝勒，令以所部兵來與大軍會”。得皇太極興師征察哈爾部，前飽林丹汗苦毒的蒙古部紛紛響應踴躍從征。土默、喀喇嗔、伊蘇、紮魯、敖漢、奈曼、科爾沁、阿魯科爾沁等部，均遵奉皇太極旨前來會師。四月十日，後金蒙古部聯軍舉行誓師。皇太極在後金、蒙古部諸貝勒大臣申軍紀後，親自統帥後金蒙古部十萬聯軍浩浩蕩蕩林丹汗殺來。
林丹汗率領察哈爾蒙古本部遷，其是為兼右翼蒙古諸部繼而振汗廷。遷結卻未遂林丹汗所願，其處境倒越來越孤立窘困起來。林丹汗當時麵臨的危機主要有三：
其一、同朝化友為敵。林丹汗所以會選擇遷，一個要因就是奪朝輸給右翼蒙古的貢互市之。出乎林丹汗崇禎帝後“盡革其賞”，連林丹汗派去索賞的大臣貴英恰也朝殺了。崇禎元年（元1628年）月，林丹汗為能逼迫朝恢複互市，大舉入寇邊鎮大同殺死朝軍民數萬人，間還差點兒攻陷大同。吃虧的朝不肯就罷休望聯合右翼蒙古同抵抗林丹汗，可沒到林丹汗太過剛猛，剛到年底就平定了右翼蒙古。本為朝的右翼蒙古諸部跑的跑，降的降實在太不爭氣。出於羈縻外藩考慮，朝還是於年恢複同林丹汗的貢互市。這本是一難得機會理應好好珍惜，可令智昏的林丹汗沒有見好就倒嫌棄朝讓太少。為能敲詐多經濟益，崇禎四年、年，林丹汗連年大舉侵犯邊。崇禎君臣還挺有骨氣，後未服過軟堅決同林丹汗硬死磕到底。就這樣因著蒙雙方高統的短視和不智，曾經抗後金的蒙聯盟徹底走決裂。
其二、蒙古諸部眾叛親離。林丹汗處事蠻橫來對從屬部施行鐵腕統。加上林丹汗為統一左右兩翼而四處攻伐，使得漠諸部無不怨聲載。尤其遷以來那些林丹汗得抱頭鼠竄的右翼王貴族們，對林丹汗的無比忿恨簡深入骨髓。漠諸部中普遍彌漫著對林丹汗的烈仇視緒。影響當後金進蒙古地區發勢力時，漠諸部紛紛投奔歸附。不止漠諸部，漠諸部也林丹汗得罪了。其實要統一全蒙古，林丹汗佳策略應是遠近伐，對於尚未臣屬自己的漠外喀爾喀蒙古理應努力拉攏與其緩和關。顯然林丹汗沒有覺悟到這點且還過高估計了自身實力，凡不臣屬自己的蒙古部他都一味暴對待。
崇禎四年（元1631年）十一月，林丹汗引軍東征至拉木倫河，攻投靠後金的阿魯科爾沁達賚楚琥爾牧地，間擄走塞棱阿巴部眾。皇太極聞警親自率兩千精騎馳援可惜為時已晚，林丹汗早就越過興嶺走遠了。小占便宜不說還成功躲開皇太極的林丹汗，也算是在二人較量中扳一分。然而快林丹汗幹了極其愚蠢的事，他殺了漠外喀爾喀諸部派到右翼蒙古的使。事令漠諸部大為震動，可震動之餘漠王貴族們沒有屈服於林丹汗淫威，而加團結一致堅定站在林丹汗對立麵上。就這樣苗紅的“大元帝裔”、“蒙古主”林丹汗，無地把漠漠部統統得罪個遍，從成為孤家寡人。
當皇太極征討察哈爾蒙古時，大漠的蒙古王貴族（尤其漠蒙古）大都積極起兵響應。於是就有了一群蒙古王甘願追隨後金異族，合力征討蒙古人主林丹汗的一幕。
其三、察哈爾蒙古遭災嚴。察哈爾蒙古遷過中連得一列似輝煌的勝，還占右翼蒙古大片富庶牧場。右翼諸部的不停抵抗還是讓林丹汗付出不菲傷亡價。況且曆經戰火犁庭草剃大草上畜牧嚴匱乏，廣大牧民全都陷於赤貧和離失所中，使獲勝的察哈爾部也不外。若僅是戰火荼毒好生休養個十年八載倒也能恢複元氣，不幸的是林丹汗遷後，蒙古高上包括右翼在內的大片地區連續多年遭遇“霜旱凍害”。史稱，“顆粒無兼厲疫盛行”（《崇禎長篇》）。就連右翼地區農業生產為發達，素有“塞上小江”之稱的豐州灘地區也是村村有病死戶戶有哀聲。當地漢族農民還能有逃難生的機會，可留在災區的蒙古牧民就能在饑荒疾疫中苦苦掙紮奄奄待斃了，這其中屬察哈爾部災。《崇禎長編》記載，“插(察哈爾部)之疲甚、餓甚、窮甚”。麵對如嚴峻災，察哈爾部出現非嚴的人員損失。史載，就連察哈爾汗廷所在本部都已不足萬部眾（《崇禎長編》記載，“插有馬約備僅四萬，插眾不滿萬”）。屬汗廷的本部都破敗至，這場大災對整個察哈爾部擊之大，創傷之深可而！林丹汗曾希望朝能賒銷些麥穀豆黍幫助他渡過這場可怕天災。可在崇禎君臣眼中察哈爾部是和後金等同的邊關巨患，崇禎帝天天祈盼著察哈爾蒙古能早日自行驟滅，幸災樂禍都還來不又怎可能會出手救。