在大舉鎮壓陝西農民軍時，朝在著手派兵進剿流竄至山西的農民軍。山西是陝西農民軍轉戰的一個戰場，早在崇禎（元1631），為躲避洪承疇殘酷圍剿大批農民軍已紛紛避入山西，中當屬王嘉胤農民軍實力強。首舉義旗的王二死，王嘉胤繼承展了王二留的義隊伍。盛時王嘉胤擁眾萬餘，高迎祥、李自、張獻忠末義風雲人曾是王嘉胤。可王嘉胤非常倒黴，剛一渡河入晉便迎頭撞上軍勇將曹文詔。時為副總兵的曹文詔是朝陣營中一員極為難良將悍將，以致民間流傳“軍中有一曹，流賊聞心膽跳”的說。清乾隆帝曾讚譽曹文詔“秉資驍猛”，清臣張廷玉亦誇頌為“萬人敵”。當五月，王嘉胤農民軍進晉東南的沁水、陽城一帶，曹文詔率軍尾隨追擊而至。農民軍數太“賊勢甚眾”曹文詔一時不取勝，王嘉胤仍舊被軍困河曲達六個月久。待王嘉胤農民軍轉戰至陽城曹文詔始終死死咬住不放，王嘉胤被曹文詔派的奸細張立位及叛徒王國忠謀暗殺。王嘉胤農民軍被曹文詔打大敗人員損失極為慘。王嘉胤遇害曹文詔升任臨洮總兵率進入陝西，在洪承疇指揮，勇將曹文詔又繼誅滅點燈子、李老柴、一條龍、掃王一批農民軍隊伍。
了陝西遍的農民軍，崇禎五（元1632）十二月，朝又調臨洮總兵曹文詔及將馬科、曹變蛟，率領千五百名“逐一挑選”、“屢經戰陣”的軍精銳，從甘肅慶陽經潼關渡黃河返山西戰場。崇禎帝特授予曹文詔“節秦，晉諸將”大權，寄望曹文詔會鎮軍一舉蕩除尚存山西的農民軍。而這一回朝未再如願，不僅山西農民軍沒有剿除精盡，倒是農民軍力觸底彈展壯大來。以會現這況，有二：一、農民軍走協聯。曆經數次慘敗單打獨鬥的農民軍，終識聯協的。王嘉胤將，綽號紫金梁的農民軍首領王自用聯高迎祥、李自、張獻忠、羅汝才、馬守應首領，將支農民軍隊伍抱一團統一協戰。番聚眾聯的農民軍隊伍號稱共十六營，達二十餘萬。二、流動戰。農民軍充吸取沉痛教訓視敵手的強大實力，不再與軍力展開麵較。轉而以避實虛策略，過流動戰方式不斷與鏖集而來的軍周旋。農民軍采取流動戰方式取了大功，顯頹勢的農民軍快便聲勢複振，繼攻克寧鄉、石樓、稷山、聞喜、河澗諸州縣。
該階段總而言，朝時尚有較強實力而農民軍在整上仍弱軍。王自用率領農民軍處不斷轉戰大還和軍互有勝負，當農民軍進至無險可據的華北大時。朝調集方力予以堵截，力有不逮的農民軍終不敵又轉回至太行山區。段時期軍陣營中又有一位傑將領橫空世，縱橫馳騁間農民軍殺棄甲曳兵屍橫遍野，這是有著末“戰神”美譽的常勝將軍盧象升。盧象升為大名知府大名隨著民變蜂擁迭，盧象升大名、廣、順德府一帶招募壯丁整軍練兵，組了末大軍一的“雄軍”。崇禎六（元1633）月，農民軍馬回回、混王東太行進至京畿腹順德、真一帶，朝大驚。為保京師安全朝急調州、昌、保軍精銳，配與大名兵備盧象升指揮盧象升與山西軍夾剿農民軍。與農民軍戰時盧象升每戰必身先士卒，親自上陣廝殺不說還異常神勇。別農民軍人勢眾卻真心敵不住兵精將猛的盧象升。
根據盧象升書記載，當時山西進入畿輔的“流寇（農民軍）已至數萬矣。西山一帶，布滿山穀，沙河、臨洺、邯鄲亦時時被焚略”，初八日，盧象升率馬步兵一千六百人進至黃寺時與股農民軍遭遇，沒過久農民軍大批力勢頭洶洶趕來參戰。麵對十數倍乃至數十倍己的農民軍，兵力絕對劣勢的軍將士“恐懼甚，鹹思散逃”。當危急關頭盧象升全無一絲慌亂退縮，而以犀的手段立斬逃兵一人功穩住軍心和陣腳。而盧象升親自督戰，率領迎敵而上生生打退農民軍。又據《史·盧象升傳》記載，一次近身肉搏中盧象升坐騎被農民軍砍殺。盧象升毫不在繼續馬步戰硬農民軍逐逼至危崖，陷入絕境的農民軍真急了轉身與盧象升決死一戰。盧象升盔額中一箭，的貼身仆夫中箭墜馬而死，可這一切沒有讓盧象升心生半點怯卻刀愈戰愈勇。為盧象升神勇氣勢撼，嚇破了膽的農民軍驚駭中潰走互告誡：“盧廉（象升）遇即死，不可犯”。另據彭孫貽的《流寇誌》記載，這次惡戰農民軍對盧象升極為忌憚，懼稱為“盧閻王”。這樣在盧象升悍勇力戰，軍先在臨城的西山、石城、青龍岡、武安接連大破農民軍。斬殺農民軍頭目十一人、殲俘農民軍及屬二萬，農民軍數遭挫敗被迫落荒離。