中鳳陽的失陷對朝精神打擊極為沉，兵尚書張鳳翼“驚怖欲仆”而崇禎帝聽聞祖墳被焚幾欲驚死，他素服避殿詔罪己又哭告祖廟。雷霆震怒的崇禎帝殺心令處決鳳陽巡撫楊一鵬，巡按鳳陽禦史吳振纓遣戍，守陵太監楊澤畏罪自殺。崇禎帝對農民軍的仇恨簡深刻入骨，他瘋似地調兵遣將征兵討賊，又京、省、帑金一百萬兩充作軍餉，且立限規六個月內務必農民義全蕩。皇嚴嚴殺氣森森，可軍仍阻止不了農民軍迅猛的態勢。攻鳳陽高迎祥、李自成與張獻忠再分兵兩出擊，張獻忠於安徽、江蘇、湖北、河南、陝西地千裏轉戰，而高迎祥、李自成二人則西趨歸德（今河南商丘）。間大批中饑民紛紛歸附繼續壯大農民軍隊伍，高迎祥、李自成趁勢引軍十萬大舉進犯中鎮洛陽，與對陣的是有著“戰神”美譽的名將盧升。軍兵力遠不農民軍，盧升農民軍雖眾卻是烏眾，要打垮農民軍中為精悍的李自成便穩操勝券。故而盧升以兩千弓箭手布於洛陽城，待李自成衝鋒時即以猛烈弓弩箭矢對壓。見李自成進攻受挫盧升再以數千精騎猛攻，一舉擊敗李自成。誠如盧升李自成退敗引致農民軍頓時心生怯怠，在軍進攻農民軍快轉為全麵潰敗。農民軍在洛陽輸了一仗元氣尚在仍於處轉戰，在會羅汝才（號曹操）、惠登（號過星）農民軍，高迎祥、李自成率領大隊人馬複入陝西。月，高迎祥與農民軍會師陝西，兵二十萬逼西安。史載，農民軍連營十裏烽火照西京聲勢浩大。幸駐守西安軍防守嚴密而農民軍缺乏足夠的攻堅作戰力，於是農民軍撤離西安轉而分兵進攻鳳翔、涼。農民軍忽東忽西出不的戰著實讓軍防不勝防，就連洪承疇這樣的名帥被農民軍避實就虛處開花策略，折騰首尾難顧狼狽不堪。著不適應農民軍戰，這段時裏在與農民軍激烈追逐和圍剿中軍連連遭至敗績損失慘。
崇禎八（元1635）六月，洪承疇將副總兵艾萬、劉成功、柳國鎮在寧州(今甘肅寧縣)遭農民軍伏擊。戰軍大敗艾萬被擒殺，柳國鎮被擊斃，軍戰死千餘。勇將曹文詔敗報瞋目大罵拔刀砍地，他憤帥洪承疇堅決請戰。當時幾經分兵洪承疇手中剩兵力已有限，既不足以進擊不夠援應。考慮到曹文詔氣盛可用且來悍勇異每每夠以少擊以寡敵眾。故而洪承疇允準出擊還高興地說，“不是曹將軍，沒人消滅這股賊兵”，“將軍出以，我會從涇陽趕到淳做的盾”（《史》記載，“文詔聞，瞋目大罵，亟詣承疇請行。承疇喜曰：‘非將軍不足辦。顧吾兵已分，無可策應。將軍行，吾將涇陽趨淳，以為將軍勁’”）。於是曹文詔帶千軍從寧州出擊，行至真寧(今寧縣)的湫頭鎮時突與農民軍遭遇。曹文詔當即引軍殺，一陣砍瓜切菜斬敵首百又狂追十裏，戰心切的曹文詔萬萬沒到他中了農民軍誘敵深入的詭計。突間伏兵飛矢蝟集，數萬農民軍騎兵將曹文詔團團圍住。被圍的是曹文詔農民軍大喜圍攻益急。陷入圍的曹文詔手刃數十農民軍自無脫身毅遂拔刀自刎而死。見勁敵已死農民軍無不歡呼雀躍，救援不的洪承疇聞消息如折一臂痛捶胸大哭。
農民軍番入陝會師不僅擊敗軍，數規模急劇膨脹。當地生無望的饑民紛紛踴躍入，史稱“從賊如歸市”。學認為，農民軍總人數應已突破百萬以上，可陝西地區連饑荒又屢遭戰火塗炭，無供數目愈龐大的農民軍必需資給養。於是崇禎八秋，除李自成為數不的幾支農民軍繼續留在陝西，高迎祥、張獻忠農民軍約數十萬眾浩浩蕩蕩東出潼關再入河南。據《史紀末》記載，“大隊東行，塵埃漲，闊十裏，絡繹百裏，老弱居中，精騎居”。當時將左良玉與祖寬欲在寶靈阻截見農民軍氣勢盛，東西隔七十裏的左祖兩軍為避鋒芒於山頭遙望終未敢邀擊。
著農民軍不斷壯大，而軍自己卻連番戰敗著實讓朝大為光火，尤勇將曹文詔的敗亡更讓朝方麵心中陣陣作痛。而朝廷罕見地未予苛責洪承疇，倒認為省總督洪承疇統轄範圍太廣過大，致難以兼顧窮於應付。崇禎八（元1635）八月，崇禎帝以盧升為省總，賜尚方劍，統轄隸、河南、山東、川、湖廣軍剿匪。另調關猛將祖寬、祖大樂屬關寧兵馬歸盧升調遣。而省總督洪承疇則專心負責陝甘地區的寇宜。於是朝方麵成“洪承疇督剿西北”，“盧升督剿東南”的格局署。