至於現在的幾哨人馬，肖天健則采納了部分高肅的建議，同時也根據目前的情況再一次對他們進行了整編，將新兵營基本上結束訓練的那些新兵，打散補充到了各哨之中，但是卻將原來的五哨戰兵重新打散整合成了三個營，除了閻重喜那一哨戰兵直接擴編成為一營之外，其餘的四哨兵將則整合成了兩個營，每個營滿編兵員一千二百五十人左右，設正副營將各一名，每個營五哨戰兵，設正副哨將各一名，每哨戰兵五個戰兵隊，設正副隊將各一名，每個隊五小隊，每小隊設什長一名，伍長兩名，正式采用了五五建製，最基礎的組織是以每五個人為一個建製。
而每個營之中暫定編製為七百長槍兵，三百火銃手，三百刀牌手，以後鳥銃生產的數量增加之後，火銃手的數量也會逐步增加，這個要看雙峰寨那邊匠作營的生產情況來定，剩下的幾十個名額則是軍官以及隨軍醫護兵和馬夫、火頭兵等雜役。
而對於這三個營的軍將安排，則是一營營將由閻重喜擔綱，副營將由新近因為戰功卓著而躥升起來的那個刁正擔綱，二營營將由羅立擔綱，副營將由趙二驢擔綱，三營營將由李栓柱擔綱，副營將由蔣成擔綱，至於各營的哨將，也都是從原來各哨之中的隊將之中的驍勇善戰的人員之中提拔起來的，這裏就不一一表述了。
而原來的炮隊，則也進行了擴編，兵力擴編到四百五十人左右，分做三哨，每哨一百五十人，除了現在刑天軍自造的三磅炮之外，幾戰之下繳獲的各種中口徑弗朗機炮挑選出其中好的十二門，改造了炮架之後，劃歸炮隊使用，另外還在炮隊之中編入了三十們虎蹲炮，騾馬二百匹，一般情況下集中使用，必要的時候，可以給每個戰兵營各配屬一哨炮隊，使得戰兵營可以擁有獨立作戰的能力，編製方麵也提升了一格升格為炮營，傷愈歸隊之後的黃生強繼續留任充當營將。
至於淘汰下來的那些碗口銃和舊虎蹲炮、纓子炮之類的雜亂火炮，則都分配到了各個刑天軍的要地布置到了寨牆上麵，作為守禦之用，即減少了後勤的壓力，也增強了各個要地的防守能力。
同時肖天健還擴編了護兵隊，在原來的一百多名護兵的基礎上從軍中又挑出一批功夫比較好，而且悍勇忠誠的兵卒擴編為三百人，改稱為近衛隊，交由鐵頭負責統帶和調整，平時肖天健身邊留下五十名近衛，其餘的近衛則由鐵頭統一調配，分別將他們配備到各個軍官身邊，負責保護哨將以上的軍官的安全，同時也照料他們的起居生活，說白了就是警衛員，不占原有戰兵營的編製，不過這個近衛卻隻對鐵頭負責，聽從鐵頭的安排，每隔一段時間便進行調換，實質上還起著監控諸將的職責，將軍隊的控製權牢牢的掌握在肖天健的手中。
對於近衛這件事上，軍中諸將也都不是傻子，想得明白這是為什麼，不過大家夥倒也不太介意這件事，畢竟他們都是被肖天健一手提拔起來的，肖天健這麼做他們也沒什麼好說的，而且肖天健自始至終都不許軍官們組建隸屬於他們自己的家丁，原因給大家也說的明白，就是家丁製度將會慢慢的破壞掉整個軍隊的構架，所以對此即便是不滿，也沒人敢說。
除了三個戰兵營之外，劉寶的新兵營被繼續得以保留，新兵營的新兵數量暫時也和其它戰兵營一樣，編製為一千二百人左右，所有戰兵營的兵員補充，全部都要出自新兵營之中，而不得各戰兵營自行招兵買馬，這麼一來除了可以保證各戰兵營的兵員素質之外，始終可以保證刑天軍戰兵的戰鬥力不會因為補充新兵，而造成大幅度的下降，同時也避免了刑天軍之中諸將形成自己的小集團的危險。
輜兵營同樣也得以保留，不過輜兵已經不再是以前的老弱之兵了，通過連續的調整之後，輜兵中的老弱現如今也基本上都已經徹底被淘汰掉，外放到地方要麼務農，要麼充任保長之職，留下的也都是青壯之士，不過兵力上卻隻有六百人，分做三哨，裝備一百兩大車，四百頭騾馬，而且還將數次作戰之中繳獲的幾十門小弗朗機炮和十幾杆九頭鳥大抬槍配備到了輜兵營之中，必要的時候這些輜兵營的大車還可以充當戰車使用，這還不算，肖天健還大手筆的給輜兵營配備了一百杆鳥銃，而且以後還會給他們繼續增加鳥銃的配備量，這些大車和騾馬一次運送的糧秣之物，便可供刑天軍吃上十天以上，而且戰鬥力同樣也不容小覷。
不過值得一提的是這一次整編之中，肖天健介於以前的經驗教訓，在刑天軍之中專門成立了一個二百人左右的工兵隊，工兵隊的人員主要由木匠和礦工組成，他們不屬於戰兵序列，專職工作就是在行軍打仗的時候，為戰兵隊提供支援，逢山開路遇水架橋，戰事還可以為戰兵隊臨時打造比如盾車、長梯等攻守器械，特別是在通過垣曲縣攻打謝家莊一戰之後，肖天健更是體驗到了工兵隊的重要性，在目前的攻堅戰之中，掘地攻堅是一個相當不錯的辦法，有了這支工兵隊之後，以後刑天軍的攻堅能力便會得到很大的提高，於是這才促成了這次肖天健組建工兵隊的想法。