幕府的當權派德川齋昭和阿部正弘在和美國人的幾次接觸後，深深明白這個道理，他們知道目前的形勢下隻有開國，隻是鑒於幕府所處的微妙地位，不能明言罷了。習慣了隻手遮天的幕府沒有料到，這次會談竟也造成了其統治的危機。阿部並沒有對藩主們各執一詞的狀況做好準備，事情似乎越來越難以解決，大家一天不能就“ 開 國”達成一致，幕府就一天不能做出決定。而藩主們又似乎看穿了幕府想要主和的心思，支持“攘夷”的越來越多，他們故意和幕府作對，幕府逐漸被拉入國家權利的鬥爭中。與此同時，阿部也沒有被動地為藩主們的意見左右，盡管當時睜眼看世界的日本人寥寥無幾，但在阿部的麾下中，卻也有幾名頭腦清醒並已經開始研究海外形勢的幕僚，他們反複提醒阿部絕不能和美國開戰。他們認為，戰爭是關係著國家生死存亡的大事，一定不能輕率決定，為了最後的勝利，可以暫時忍耐，等到兵強國富之時，再討回尊嚴為時不晚，因此，美國的要求答應無妨。對各國軍備較為了解的幕僚高島秋帆更是一針見血，他指出，如果美國人要進駐日本，日本沒有半點力量可以抵擋，但通商本是互通有無的事，日本也能從中獲利。
阿部最終下定決心開國。美國人的到來也讓他意識到日本軍事上的疲弱，他 開始著手強兵，修炮台，造大船，並募集民間資金加固海防，就連一直不問國事的京都朝廷也派人詢問江戶的狀況。
佩裏回來了，比幕府預計得還要快，1854年2月，佩裏的艦隊出現在日本海域，正如他之前承諾的那樣，他果然帶來了更多的艦艇，蘇絲可哈納號、南安普敦、萊克星敦號、馬其頓號、萬達利亞號、密西西比號、文森尼斯號、波哈坦號，頗為壯觀地向浦賀前進。這些艦艇上共有250門大炮，士兵1600人，應對和日本的海戰綽綽有餘。2月13日，艦隊到達小柴衝，再行進20裏便抵達浦賀。雖然對美國艦艇的到來早有準備，幕府還是為這出乎意料的龐大艦隊震懾。浦賀官員黑川嘉兵衛連忙趕來與波哈坦號的艦長亞當斯進行交涉，希望他能將艦隊停靠到浦賀，但亞當斯表示，佩裏這次不打算進駐浦賀，而是要立即會見日本官員，如果日本方麵不能做到，那他們就調轉船頭直奔不遠處的江戶。
得到這一消息，阿部正弘隻得立刻組建代表團接待佩裏，代表團由以林大學頭、大目付井戶對馬守以及目付鵜殿民部少輔為首的8名幕府官員組成，臨行之前，阿部叮囑他們，一定要謹慎行事，切忌辱沒日本尊嚴。
接待佩裏的地點依舊是久裏濱，日方在久裏濱為美國人臨時建立了會場。1854年3月8日，從神奈川起航的日本官員登上了滿目荒涼的橫濱，忐忑不安地等待著佩裏。不久，在一片禮炮聲中，佩裏和他的500多名隨從趾高氣揚地登陸日本，在佩裏眼中林大學頭待人接物彬彬有禮，其他的官員也溫文爾雅。第一天的談判就在緊張又平靜的氛圍中拉開了序幕，佩裏將《日美通商條約草案》和已經在中國生效多時的《美清通商條約》一並交給了日本官員。
談判比預想中的要順利得多，幾天接觸下來，小心翼翼的日本官員逐漸發現，佩裏並不像他們想象中的那般可怕，緊張的氣氛逐漸緩和下來，佩裏還代表美國向日本獻上禮物：火車頭和鐵軌模型、2台電報機、4束電線。這些在今天看來不值得大驚小怪的東西是當時西方世界科技文明最高水平的象征。興致勃勃的佩裏還命手下士兵當場向滿臉驚奇之色的日本人演示了電話的使用。讓日本官員在感慨西方科技先進的同時，也暗暗心痛自己的落後。在每小時可行70多裏的火車、20幾日便可從加利福尼亞抵達日本的黑船麵前，他們這才知自己曾經堅持的“攘夷”是多麼可笑。和機器工業文明的接觸震撼了到場的每一個日本人，他們在佩裏的邀請下踏上了神秘陌生的“黑船”，並在那裏第一次看到了推動黑船運轉的蒸汽機，了解了美國士兵身上步槍的強大威力。一些人開始懷疑，在這些令人吃驚的西方人麵前，天照大神是不是依然可以像從前那樣庇佑日本。
多年之後，日本人用“開國的恩人”稱呼佩裏，對日本意義重大的海濱小鎮久裏濱，在今天看來安靜平凡，沒有一絲曆史名跡的霸氣，而在當時，卻是日本人看世界的第一扇窗口，日本最早的近代工業出現的地方。與其說是帶著200多大炮的蒸汽黑船征服了日本，不如說是西方先進的近代文明讓日本人歎服。佩裏登陸日本後不到20年，明治天皇掌權，日本上上下下都開始轟轟烈烈地學習西學。
受儒家思想影響至深的日本講究禮尚往來，第二天，日本代表們回贈美方象征東方世界的禮物：漆金的書架、文房四寶以及體現著日本式唯美的香爐、花瓶。為了在美國人麵前一展有尚武傳統的日本人的力量，70多個日本彪形大漢背負著200斤米四處奔跑。日本人送給美國人的禮物，除了日本貨幣和象征日本武士道精神的日本刀外，還有百多年前從葡萄牙人那裏學會製造的火繩槍。這在日本人看來殺傷力巨大的危險武器，在美國人眼中無異於曆史文物。
日本終於同意了佩裏的要求，將下田和箱館二地開放。3月27日，波哈坦號上舉辦了盛大的招待會，一位日本官員情不自禁地將手搭在佩裏肩上，大呼“日美同心”， 這一 舉 動 在 後 來 頻頻出現在日本的外交活動中，但在當時卻是史無前例。3月31日，所有的開國外交活動都結束了，用日、英、荷三種語言寫成的條約書分放到日美雙方麵前，代表們毫不猶疑地在上麵簽了字。
條約的字裏行間都流露出友好的意味，其第一條就這樣寫道：“日本與合眾國，其人民結為永世不朽的和親，無地域及人品的差別。”但 和 日本人相處甚為愉快的佩裏，在離 開 日本之前也有些憂心忡忡，兩次來日的經曆，讓他加深了對日本人的了解，他曾感歎道，日本這個國家必會對歐美構成威脅。果然，佩裏走後不久，德川幕府就垮台了，通過明治維新迅速崛起的日本，在 劫 掠 起他國上比不可一世的西方列強還要張狂，它 侵略 了 中國，打敗了俄國，在開國後的第 97年，偷襲了美國的珍珠港……這實在是對“永世不朽的和親”的最大諷刺。