在東京審判之後，以美國為首的盟國和日本簽訂了《舊金山條約》，1952年開始生效。這項和約的第11條中明文規定：“日本接受遠東國際軍事法庭和其在日本境內或境外之盟國戰罪法庭之判決，並 將 執 行 各 該 法 庭 所 科 予 現 被 監 禁 於 日本境內之日本國民之處刑。對此等人犯赦免、減刑與假釋之權，除由每一案件科刑之一政府或數個政府之決定並由日本建議之外，不得行使。如該項人犯係由遠東國際軍事法庭所判決，該項權利除由參加該法庭之多數政府之決定並由日本之建議外，不得行使。”日本簽署了這個條約，就 表 示 它已經向其他的締約國家，承認了遠東軍事法庭的審判結果，並且也接受了這個結局，而且還要承擔他們的國際義務。因為在國際公法和日本憲法中，都有著明確的規定：“締約國須忠實履行其締結的國際條約，而且國際法庭審判本身，對當事國也具有約束力。”
東 京 審 判 是 第 二 次世界大戰之後對日本戰犯最重要的一次審判。正是因為日本接受了這次東京審判，否定了戰前的軍國主義，日本在戰後才走上了和平的軌道，才有如今的發展。事實證明，東京審判對製止戰爭、促進和平起到了一定的積極作用。當然，東京審判也有其不徹底的一麵。日本的天皇製度是世襲的，1889年公布的《大日本帝國憲法》中規定：天皇“作為國家之首，總攬統治權”。 天 皇 在 戰前是日本的最高統治者，也是日本軍隊的最高統帥。同時，天皇還號稱自己是創造日本國家之神的萬世一係的子孫，是神權的化身。
如果沒有天皇這種最高力量的命令和統帥，那日本也就不會發動那樣的一場戰爭。從1931年的“九·一八”事變到1945年宣布終戰詔書，裕仁天皇推動指導了一連串的侵略戰爭。可以說裕仁天皇是日本最大的戰犯，也是侵略戰爭的罪魁禍首。在日本宣布投降之後，不 僅 中國和亞洲國家強烈要求追究裕仁天皇的戰爭責任，就 連 國 際 輿 論 甚 至日本本國的一些人士，也覺得日本天皇是罪惡戰爭中的最高責任者。可是，美國掌握著東京審判的大權，而他們考慮到自身政治上的需求，居然沒有追究天皇的責任。於是“天皇是日本國的象征，是日本國民統一的象征”，就被寫入了日本的新憲法中，保留了天皇原有的世襲君主的地位。天皇再次成為了保護各種戰犯的後盾，給極右勢力的複辟找到了依靠和借口。
對於日本帝國主義來說，假如沒有日本壟斷財閥的支持，也不能進行侵略戰爭，因為軍事實力是以經濟實力作基礎的，可是很遺憾，對於這些幫凶們的罪行，東京審判中也沒有顧及到。
有“國策公司”之稱的“滿鐵”， 當時不僅給關東軍提供了從事軍事政治謀略和奪取經濟命脈的力量，而且還全力地充當了關東軍的超級後勤部。早在1905年日俄戰爭後，日本從俄國手中奪取了中國東北地區的東清鐵路南滿洲支線長春以南路權，之後日本設立的“南滿洲鐵道株式會社”。 表 麵上這是一家股份公司，實際上是日本的侵華大本營，它的曆任總裁都是由日本政府直接任命的。“ 九 一 八 ” 事 變時，日本的關東軍隻有1萬多人，他們在4個多月的時間裏，就占領了東三省。假如沒有實力雄厚的“滿鐵”的參與、配合和支持，那關東軍是難逞其凶的。
“滿鐵”的首任總裁、外交大臣鬆岡洋右稱：“發動‘滿洲事變’是關東軍和‘滿鐵’的共同行動。”“ 滿 鐵 ”在1931年時已經擁有了4.4億的資本、1100公裏的鐵路、480平方公裏的鐵路附屬地，還有將近4萬名職工和50多個關係會社。根據“滿鐵”統計，1931年9月到1932年的3月之間，“ 滿 鐵 ” 共 編 發 了軍運列車4056次，平均每小時有1列軍車編成並投入到運行中。另外，“ 滿 鐵 ” 還 在1年 多 的 時間 裏，向社外線派遣了軍運人員47萬多人次，給關東軍快速占領東北各地提供了交通工具。
在“九·一八事變”以後，“ 滿 鐵 ”的各個部門組織了數十個擔當侵略任務的專門機構。“ 滿 鐵 ”的職工有4 萬人，因為參加事變而立功的人就有22254人，占了社員總人數的60%。關東軍的政治工作機構也是“滿鐵”包辦的，就連關東軍特務部門的工作人員，也基本上來自“滿鐵”。
在 偽 滿 洲 國 成立之後，偽自治指導部派往各縣旗的參事官，也多為“滿鐵”派出的人。也就是說，“ 滿 鐵 ”在關東軍對東北侵略的罪行中，要承擔一半的責任。可是，在戰後的審判中卻沒有對“滿鐵”這種以國家資本和財閥資本相結合的產物追究其戰爭的責任。日本在戰敗之後，根據聯合國軍總司令部的命令，隻是解散了幾個大財團而已，小財團並沒有任何變化，大財團的變化也隻是分化成了一些小財團，而且這些財團再次成為了日本右翼勢力重新掌握國家政權的經濟基礎。除了經濟上對中國的掠奪，日本在侵華期間給中國製造的無數慘案同樣令人發指。日本在侵華戰爭中，大量地使用了細菌化學武器是眾所周知的。731部隊和100部隊用活人做試驗，3000多名被捕的抗日人民，最終成為了細菌試驗的犧牲品。據不完全統計，日本軍隊在各地實施的細菌戰裏，死在日軍細菌戰中的中國民眾，至 少 也 有 20萬人。516、525都是日軍的化學部隊，他們為了配合731部隊拿活人做毒氣試驗，在中國的戰場上大量地使用了化學武器，保守統計至少2000次以上，受到傷害的人數達到10萬人以上。在日本戰敗之後，他們在中國遺棄的化學炮彈就達200萬枚，這些炮彈再次使2000多人受到了傷害。