（1）培養料的配製：袋裝黑木耳的培養料來源廣泛，一般是就地取材。現在介紹幾種配方：①木屑培養料配方：闊葉樹粗木屑78%、麥麩20%、石膏粉1%、蔗糖1%。②複合培養料配方：玉米芯40%、木屑28%、碎稻草20%、麥麩10%、石膏1%、蔗糖1%。③玉米芯培養料配方：玉米芯60%、木屑28%、麥麩10%、石膏1%、蔗糖1%。
上述配方麥鼓可以用米糠或玉米麵代替，料水比為1：1.3~1.4。
配製培養料時，第一拌料力求均勻。配料時，先按配方的比例稱好主料與輔料，在水泥地麵上拌料，先把主料堆成小山狀，然後把其他輔料一樣樣從堆頂尖撒下，混拌均勻，再把蔗糖溶於水裏潑入料中，反複攪拌均勻。第二，嚴格控製含水量。培養料適宜的含水量為60%左右，經驗判斷適當的含水量指標為用力握料，過一會兒，指縫間有水滲出但不滴下，伸開手指料在手中成團，一碰即散。第三，在配製培養料的過程中要杜絕汙染源，要選擇無黴變的培養料，配料前置於烈日下曝曬幾日；晴天拌料；拌料後及時裝袋。
（2）裝袋：塑料袋的大小以17厘米×33厘米為宜。常壓滅菌者用聚乙烯袋，高壓滅菌者用聚丙烯袋。裝袋時要求鬆緊適當。裝得鬆保水性差，培養過程塑料袋變形嚴重；太緊則透氣性差，菌絲不易延伸。裝到離袋口6厘米處用撕裂膜將袋紮緊。裝袋後特別要注意輕拿輕放，放在鋪有塑料膜的地方，防止料袋被沙粒等雜物刺破引起汙染。
（3）料袋滅菌：滅菌方法可采用高壓滅菌法，也可采用常壓蒸汽滅菌法。下麵僅介紹常壓蒸汽滅菌的關鍵技術：
常壓蒸汽滅菌的工具是常壓滅菌鍋，料袋裝人滅菌鍋後要用旺火猛燒，要求在3~4個小時將鍋燒開，要保持連續8~10小時，滅菌才能徹底。一些栽培農戶，往往在這一環節出問題，有的麻痹大意，有的圖節省加溫能源，造成滅菌不徹底，致使雜菌嚴重汙染，導致失敗。常壓滅菌操作過程中要防止中途停火降溫，如果鍋內達不到連續保持的100℃，在規定的時間內就達不到消毒的目的；防止燒幹鍋；防止存在滅菌死角，如鍋內受熱部位不勻、鍋蓋僅從一處漏氣、鍋內料袋采縫疊放、滅菌灶內容積大而鍋小等都可造成滅菌死角。
（4）接菌種：經滅菌後的料袋，待料溫降到30℃以下時，搬人接種室或接種箱進行接種。接種前要對接種室或接種箱進行消毒滅菌。具體方法是，每立方米空間用5克高錳酸鉀和10毫升福爾馬林（又叫做甲醛）熏蒸滅菌至少1個小時後才可接種（將高錳酸鉀倒在福爾馬林溶液中）。用不鏽鋼長把湯匙（經過消毒滅菌）在料袋兩頭接種，每瓶二級種可接15袋左右。
（5）發菌階段的管理：一般將接種後的料袋稱為菌袋，菌袋培育期需40~50天，這期間管理內容如下：①菌袋搬人培養室內培養（空房或塑料大棚均可當培養室，室內應事先消毒滅菌），菌袋可采取臥倒一層層牆式擺放，也可“井”字形交叉重疊擺放。早春接種，氣溫低，可把菌袋集中堆放，上蓋草簾發菌3~4天，促使袋溫增高，加快菌絲定植，然後再分開擺放。②調節到適宜的溫濕度。黑木耳菌絲生長最適溫度為20~30℃，相對濕度在65%左右為宜。室內宜遮光（黑暗）通風增氧，促進菌絲生長。
（6）往稻田行間放袋出耳：將發好的菌袋放在水稻行間，在上側用刀片（消毒過的）劃“V”字形口兩排，每排8~9個口，10天後即可采耳。