8月23日，蔣介石第二次從台北飛抵廣州，會晤李宗仁，部署“廣州保衛戰”，他聲稱這是“決定黨國最後成敗的一戰”。但對當時廣東籍將領中出現的反蔣情緒，蔣介石保持了極大的警惕。為消弭兩廣將領可能發生的反抗，蔣介石對廣東籍將領采取直接威脅打壓的政策。他在召見餘漢謀、薛嶽、李漢魂等廣東籍高級將領時，就廣州市由特別市改為省轄市一事大發雷霆，厲聲訓斥道：“你們以為你們可以反對我咯？誰反對我，我就叫誰死在我之前！”經蔣厲聲訓斥一番後，廣東籍將領頓時沒有了底氣。餘漢謀本來就有點三心二意，經蔣訓斥後更是心灰意冷，表示不再擔任即將成立的華南軍政長官。對於在幕後策劃兩廣合作的內政部長李漢魂，蔣介石更是欲得而甘心，閻錫山甚至私下裏悄悄告訴李漢魂，他如果不快點離開廣州，就會有生命危險。隻有那位人稱“莽張飛”的張發奎以及有“南天王”之稱的陳濟棠膽量要大些，他們不怕蔣的訛詐，甚至建議李宗仁：“把蔣扣起來！”但李宗仁曆來缺乏乾坤一擲的魄力和勇氣，而張發奎等人手中又無兵權，所謂把蔣扣起來也隻能是一句空話。
9月5日，李宗仁召集白崇禧、餘漢謀、薛嶽、李漢魂等商量保衛廣東計劃，決定由華南軍政長官（8月31日，廣東“綏靖”公署改為華南軍政長官公署）餘漢謀統一指揮廣東境內的部隊。同時，白崇禧部“設法移入廣東，俾與餘（漢謀）部力圖配合”。
9月8日，蔣介石還致電參謀總長顧祝同，聲稱“應集中現有駐粵兵力，保衛廣州革命根據地，為目前‘剿共’軍事革命戰略之最高指導原則。如有餘力，則可擴大範圍，以期保衛華南……故對現駐粵中之第50、第39、第63、第109軍之建製，切莫再分割使用，以免陷於被動，為匪各個擊破。今後一切部署，均應準此原則實施，切莫舉棋不定，俾確保革命基地”雲雲，好像是要守華南的樣子，但實際不然。
為使白崇禧所部能夠調入廣東，李宗仁特托賈景德（閻錫山的軍師）、鄒魯（廣東籍國民黨元老）出麵勸閻錫山自動辭去國防部長兼職，以白崇禧接替。不料閻錫山卻十分強硬地回答：“我不辭國防部長兼職，如代總統令免，我行政院長不副署。”閻還揚言：“雖手槍嚇我，我也不辭。”擺出一副與李宗仁對抗到底的姿態。
蔣介石為何誓死反對白崇禧擔任國防部長？原來，蔣係勢力認為，白崇禧如果擔任國防部長，那麼，李宗仁、白崇禧必然利用這個職位來謀取派係利益，可以名正言順地免去蔣介石嫡係胡宗南（西安“綏靖”公署主任）、湯恩伯（福州“綏靖”公署主任）、陳誠（東南軍政長官），甚至蔣介石“如抗令不交代，竟下令通緝蔣，以爭取正統，皆能做到”。因為，在蔣係勢力看來，白崇禧出任國防部長與否，是關係到蔣係勢力生死存亡的根本問題，決不可以在這個問題上讓步。
對蔣介石來說，他還擔心李宗仁效法傅作義，在兩廣搞局部和平。9月12日，蔣介石接到國防部保密局特務的一份情報說：中共中央“已將解放廣州責任交與華南局負責，力謀以政治方式使廣州和平易手”。中共“認為此線局部和平之進行，頗有成就，桂係將來亦必走上局部和平之路”。這是蔣極力要避免的，他揚言：“必不令此等事件之發生。”
9月22日下午4時，蔣介石從昆明飛抵廣州，這是他第三次來廣州。當即召集軍政委員會會議，宣布放棄廣東，退保瓊崖（即海南島）。
蔣介石為拆散李宗仁、白崇禧這對搭檔，特對握有兵權的白崇禧做了多方的拉攏說服工作。10月1日，蔣在黃埔軍校單獨召見白崇禧，兩人密談達二三小時之久。蔣以最誠懇的態度對白說：“對於北伐、抗日及過去的清黨‘剿共’時期，每多特為借重、精誠共濟的例證，值此國家多難，尤望開誠合作。”蔣的誠懇態度，使白崇禧“大為感動”。白認為李宗仁臨大事畏首畏尾，沒有乾坤一擲的氣魄，“不足以擔當一國大事”。在蔣介石的刻意拉攏下，白崇禧產生了“與其跟李宗仁站班，不如跟蔣介石站班的念頭”，當即向蔣表示不再堅持守粵，“決守湘南”。
在會談中，針對李宗仁以往屢次提出要白崇禧出任國防部長強烈要求，蔣不惜假惺惺地繼續忽悠白氏說：“過去君曾公開反對長官，今若遽長國防，恐將領群起效尤，不如成立軍事委員會，由我主持，君任參謀長如何？過一段時期，以使將領知君我已合作，然後再由君全權負責。”取得白崇禧的同意後，蔣當即決定在“非常委員會”下設立軍事、財政、外交三個小組，蔣自任軍事小組召集人，以閻錫山、顧祝同、白崇禧為委員。次日，蔣並告白崇禧：“俟華中戰事告一段落，可歸任國防部長。”
蔣介石就這樣，通過一打一拉，成功地破壞了李宗仁精心策劃的兩廣部隊合作保衛華南的計劃。