6月4日，南宋朝廷撥銀5萬兩，犒賞李璮軍隊。並派青陽夢炎率兵救援。但青陽夢炎剛到山東，就因畏懼蒙古而不敢再進。
本月，賈似道的大仇人、前首相吳潛在廣南東路的循州暴卒。
7月，忽必烈命宋子貞前往濟南府參議軍事。宋子貞對史天澤說“李璮坐守孤城。宜增築外城，防其奔突。彼糧盡援絕之日，當不攻自破”20日，濟南府已被圍兩個月，李璮知道再也守不下去了，不得已手刃妻妾，一個人乘船出城，欲投大明湖自盡沒成功，被蒙古兵生擒，押到史天澤麵前。嚴忠範首先問“為何造反”李璮說“你們與我相約，為何不來”嚴忠範立馬在李璮肋下刺了一刀。史天澤再問“忽必烈是不是對不起你”李璮說“你有文書約我起兵，為何背信棄義”史天澤馬上命人將李璮拖出處死。
次日，蒙古軍繼續向東，往李璮的老巢、山東東路的首府益都府而去。還沒到，益都已開城投降。忽必烈任命董文炳為經略使，負責安定山東。當時李璮軍隊還有沂、漣兩軍2萬餘人。哈必赤打算將其分配到諸軍中，由各將領將其偷偷殺光。董文炳被分到要殺二千人。董文炳當即來見哈必赤“此輩為李璮所脅。你要盡殺，可想過天子有仁聖之意”哈必赤這才罷手，然被殺者已眾…
李璮之變，給蒙古統治者敲響了警鍾，更是大大加深了他們的民族猜忌情緒！這事要從成吉思汗攻金說起。當時，蒙古統治者要征服金國，在中原地區建立長久穩固的統治，就不能不依靠中原地主階級的力量。木華黎受命專征中原後，更注重對漢人地主武裝的爭取，封了許多世襲的漢人世侯。如真定史天澤、西京劉黑馬、順天張柔、濟南張榮、東平嚴實、大名王珍、河東李守賢、鞏昌汪世顯、太原郝和尚拔都、益都李璮等大大小小40多個割據一方的勢力。
現在的李璮叛亂便是當年實行漢人世侯政策的最直接惡果！因大籓子弟盡專兵民大權而發生！最大的勢力李璮已死，那麼現在還剩下那麼多人，該怎麼辦？為了贖擅殺李璮滅口之罪，也為表示對忽必烈的忠誠，蒙古漢姓的第一大家史天澤就帶頭交出兵權“罷大籓子弟盡專兵民之權，請自臣家始”史家子弟當天交出兵權者就有17人。接著。第二大家張柔、第三大家嚴忠濟、第四大家張榮也紛紛上書，要求交出兵權！忽必烈則表示既往不咎，並寬宏大量的繼續把他們當成漢人地主階級的代表。這樣做，既收了地方軍閥的兵權，消除了分裂叛亂的隱患；同時也使漢人官僚不疑神疑鬼，保持了蒙漢統治階級聯合專政的穩定。
忽必烈更乘平定李璮叛亂的機會，在打敗阿裏不哥、坐穩了大汗寶座之後，加速了政治改革的步伐。主要措施包括：1削弱私家勢力。除本人外，其兄弟子侄的官職一律罷免。同時除真定董氏外，其餘地方軍權全部收回中央。雖然後來在滅南宋的戰爭中。史、張等人又分別擔任將軍，但軍隊已不再是他們自己的親信。2嚴格執行地方上兵、民分治的製度。3取消世襲製。4將軍不獨占兵權。5設立萬戶府監督軍隊、以宿衛監視漢人軍隊。6取消漢人官僚的封地。7重用蒙古人與回回人。
不僅對地方上握有軍權的漢人開始猜忌，就是隻掌握民權的漢人官僚也受到了牽連。趙璧以李璮叛亂與朝中王文統專權有聯係為由，上奏“王文統之進，由廉希憲、張易所薦引，遂至大用。且關中形勝之地，希憲得民心，有商挺、趙良弼為之輔，此事宜關聖慮”還好忽必烈還算清醒“希憲自幼事朕。朕知其心。挺、良弼皆正士，何慮焉”
24日，禦史範純彈劾前四川製置使俞興罷職的處罰太輕，應徹底貶為平民以息眾怒。宋理宗下詔遵行。