哪一幢樓，不分晝夜，總是燈火通明。”
731部隊設施還有一個特點，就是建築物的麵積和房間設計比較寬敞。
樓內各層的天花板都很高。本部大樓（“口”字樓)等雖說是三層樓，但整個建築物的高度都相當於現在的五層樓左右。“口”字樓的外壁，是在混凝土構造上，又鑲上乳白色的瓷磚。從哈爾濱市內乘公共汽車駛近這一地區時，給人這樣一種感覺：在遼闊的平原上突然出現了一幢被土牆包圍著的白色建築。
在三層的“口”字樓裏，設有手動式電梯，可以一直通往樓頂。
教育部大樓是一幢磚樓，但宿舍卻全部是堅固的混凝土建築。
關押“馬魯太”的特設監獄，是一幢被“口”字樓包圍起來的二層建築，修建得特別堅固。設計是特殊的，隻要一扳動閥門，整個獄內就會充滿氰酸瓦斯。部隊人員說：“一旦有事時，扳動隊長室裏的閥門，‘馬魯太’就會全部死掉。”
總部大樓“口”字樓的一層都叫“地下”。在一層走廊正中間，鋪設一圈供小型四輪手推車用的滑軌（軌距50公分）。柄澤班把大量製造好的細菌裝在一種特殊容器之中，由“工廠”運往細菌倉庫收藏。這種金屬製的特殊容器很重，所以才設計了這種手推車，並在走廊中鋪設手推車用的鐵軌。
731部隊這種盡善盡美的設施，存在著一個難以解決的問題：那就是有一股十分厲害的刺鼻的腐臭氣味，籠罩著整個總部大樓，有時甚至飄到院外。
籠罩著731部隊的令人作嘔的腐臭氣味，使人們真正“嗅”到了這支部隊整個設施的性質。這股腐臭氣味究竟來自哪裏呢？
腐臭氣味的元凶
籠罩著731部隊的腐臭氣味，主要是“瓊膠‘’①的爛臭味。
①瓊膠也稱”寒天“，是一種細苗培養基。——譯者
731部隊”口“字樓的整個一層，全部被第四部屬下的柄澤班所占用。柄澤班負責主持細菌製造工廠。臭味就是來自這裏。
731部隊製造細菌是使用石井四郎親自發明的細菌培養器（加壓式培養器）來進行的。這是為了在短時間內大量培養和繁殖細菌的一種創造發明。其原理很簡單。
細菌喜歡肉汁、糖分等營養豐富的東西。利用這些東西製造出無菌的培養基，這是利用瓊膠和腖①繁殖細菌的基礎，然後隻要保持一定的溫度和暗度，細菌就會迅速繁殖起來，並聚集在細菌培養基的表麵上。通常細菌是看不到的微小生物，但是，經過多次繁殖後，最後瓊膠上呈現一種糊狀乳白色的薄層，這就是製造出的細菌群體。
①腖（Peptone）：是一種用來分解蛋白質的物質。——譯者
第四部的柄澤班利用特殊的傳送帶自動回收使鼠疫菌、霍亂菌等繁殖的細菌培養基，再利用特殊的刮取器把細菌刮取下來，然後把瓊膠培養基收集起來，放入高壓滅菌器中。
再向細菌刮取完畢的瓊膠培養基通入高壓蒸氣，使它的表麵恢複無菌狀態，以便再次用來製造細菌。
收入高壓滅菌器後，細菌培養基散發出十分厲害的臭氣，它像果醬變質後的臭味，充滿了整個731部隊總部大樓，隨著風向的變化，有時也被吹到旁邊的大禮堂去。
731部隊還有一個”臭氣來源“：那就是解剖室及其附近的焚屍爐。
每兩天”消費“三名”馬魯太“，他們的屍體就在這裏火化。731部隊為了消除戰爭犯罪的一切痕跡，所有屍體都在焚屍爐中燒掉，剩下的骨頭全部扔入叫”骨墳“的大坑裏。焚屍爐的煙囪雖然很高，而且采用高溫焚燒方式，排煙較少，但是，由於風向的關係仍然散發出惡臭味。”馬魯太“的屍體一般都是這樣處理的。但是，也有例外情況。那就是1945年8月9日731部隊撤退時，對”馬魯太“的處理並未能這樣做。關於這件事將在後麵加以敘述。