楚國的出爾反爾，惹惱了參加合縱的其他各國。公元前304年，齊、韓、魏三國因楚國違背縱約而攻打楚國，楚國向秦國求救，還把太子送到秦國做人質。於是，秦國出兵，三國也就退兵了。公元前303年，留在秦國做人質的楚太子因殺了一個和他發生衝突的秦國大夫，逃回楚國。秦以此為借口，聯合齊、韓、魏攻楚，殺了楚將唐昧，占領楚國的重丘。這時，昏庸的楚懷王才又想起齊楚聯盟的重要性，讓太子到齊國做人質以求齊楚聯盟反秦。公元前299年，秦又一次攻楚，取楚八城，秦昭王趁勢“邀請”楚懷王去武關會盟。
屈原此時已從流放地返回，他和昭雎等力勸楚懷王不要赴會，可子蘭怕失去秦昭王歡心，竭力慫恿楚懷王前去。結果楚懷王一入武關，就被秦軍扣留，秦國要挾他割讓巫郡和黔中郡。楚懷王不肯，就被押往鹹陽軟禁起來，此時他才後悔沒聽屈原的忠告，但為時已晚。楚懷王在鹹陽被軟禁了一年多，其間幾次逃跑都沒有成功，最終氣惱成疾，死在了秦國。
屈原聽到這個消息，悲憤交加，又寫了《招魂》一詩來抒發自己的感情。
楚懷王被扣於秦國之際，楚國立太子橫為國君，即頃襄王。頃襄王也是個昏君，他讓子蘭代昭雎當令尹，整日被奸臣的讒言包圍，隻顧享樂，不問政事。不久，秦又發兵攻楚，大敗楚軍，奪取楚國15城。屈原見朝廷如此腐敗，國家命運危在旦夕，不禁憂心如焚。但他仍寄希望於國君，連寫了幾篇奏章，勸頃襄王親賢遠佞，革新內政，以報仇雪恥。但這些奏章卻落到了子蘭等人的手裏，他們更嫉恨屈原，於是又陷害屈原，使屈原被流放到南方的荒僻之地。
在流放中，屈原仍時刻心係楚國的命運，希望頃襄王能召他回去，挽救國家命運。然而，一年又一年，他盼來的隻是絕望。
流亡期間，屈原有更多的機會接觸百姓，了解他們的生活，又寫出了《九歌》《九章》等優秀詩篇。
與此同時，楚國的形勢越來越危急。不久，秦將白起率軍攻破楚國的郢都，毀壞楚先王的陵墓，頃襄王外逃，楚國已朝不保夕。屈原不忍心看到自己的國家淪亡，在悲憤交加中，於這年的農曆五月初五，自沉汨羅江，以身殉了自己的理想。這年他62歲。
當地百姓聽到這一噩耗悲痛萬分，爭先恐後去打撈他的遺體。雖費盡周折，卻仍一無所獲。有人就用葦葉包了粽子，投進江中，祭祀屈原（一說是擔心屈原的遺體被魚吃掉）。這種活動流傳下來，逐漸成為一種風俗。直到今天，每逢農曆五月初五端午節這天，民間還有包粽子、賽龍舟的習俗。