後在十月初九日（11月29日），一聽到有清軍炮彈落在都督府，便頓想依從左右小人的建議，移到武昌之東數十英裏的“葛店”去辦公。甘績熙怕他這一走，影響民心、軍心，特地來到都督府陪他，晝夜不離（夜間也睡在都督府）。這樣，總算把他留下，留到了十月十一日（12月1日）的早晨，都督府又中了幾顆炮彈，打死了兩個工友。兩個工友既死，雖甘績熙也終於留黎元洪不住了，而且也不敢再留他，因為萬一黎元洪被炮彈打死，全軍與整個軍政府失了首領，影響革命前途太大。
黎元洪匆忙乘了轎子離開武昌，向葛店方向走去。
留在武昌主持防務的是蔣翊武。黃興辭職以後，黎元洪任命萬廷獻為“代理戰時總司令官”，萬廷獻不就（他當過南京陸軍中學的總辦）。於是，便任命了蔣翊武為“護理戰時總司令”，設總司令部於洪山寶通寺。都督府參謀部部長楊開甲辭職，副部長楊璽章陣亡，黎元洪任命了吳兆麟為參謀部部長，姚金鏞為副部長。此外，孫武、張振武、劉公（仲文）都留在武昌。
十月初九，晚間九點鍾，蔣翊武下令各部隊，對他們分別指定防區：
第一協，協統蔣肇鑒，右翼與第四協連絡，左翼至吉祥賓館附近。
第二協（欠兩營），協統何錫藩，防禦武昌城。
第三協，協統竇秉鈞，防禦鳳凰山經青山至兩望北端一帶。
第四協，協繞張廷輔，防禦右翼，與工程營連絡。
第五協，協統熊秉坤，防禦兩望至磚瓦廠一帶。
第六協，協統揚載雄，防禦左翼，至大堤口附近，與第五協連絡。
第七協（欠第十四標），協統鄧玉麟，防禦武昌城沿江一帶，與第六協連絡。第十四標，標統黃申薌，防禦東湖及沙子嶺附近，並向東搜索。
第八協。協統羅洪升，防禦金口附近，與第一協連絡。馬隊第一標，標統王祥發，在寶通寺集合候命。馬隊第二標，標統劉國佐，在鯰魚套集合候命。
工程第一營，管帶李占魁，防禦鯰魚套。工程第二營，管帶楊金龍，防禦造紙廠附近，與第七協連絡。
其餘各部隊為總隊預備隊，在洪山南麓候命。
《細說民國創立》六三、停戰
十月十一日黎元洪走了不久，當天，英國商人盤恩，受了英國駐漢口領事的委托，到洪山蔣翊武的總司令部，轉達清軍的停戰要求。
主動作停戰的提議的，是袁世凱。中間人是英國駐華公使朱爾典。朱爾典命令英國駐漢口領事某人對革命軍作停戰的試探，這領事找出盤恩，任奔走之勞。
袁世凱認為，拿到了漢口、漢陽，已經夠資格對革命軍談判；留下武昌不攻，既可以對革命軍表示好感，也可以用來威脅清室，篡竊大位。事實上，各省已經紛紛獨立，張勳也絕對守不住南京，袁世凱的精兵被吸住在湖北與山西，袁世凱不想停戰也得停戰。
第一次停戰的條件很簡單：期限僅有三天，革命軍停駛軍艦，清軍停止用火車運兵。
蔣翊武與孫武、張振武等商議結果，決定接受停戰的要求，派萬奇去追黎元洪，取都督大印，加蓋在停戰議定書之上。（萬奇這時候是蔣翊武的參謀。）萬奇騎馬過了王家店兩三裏，才把黎元洪追到，勸黎回王家店真武廟。黎說：“都督大印已經送到葛店。”萬奇說：“請都督折回真武廟，容我去葛店取印。”萬奇又走了一陣，遇到秘書陳邦振迎麵捧印而來。陳邦振是在黎、萬交談之時，已經自動先去葛店。萬奇於是把印帶回洪山，蔣、孫、張等人卻已另行刻了一顆大印，蓋在停戰議定書之上了。