見李定國連勝清軍，孫可望也想露一手。
岔路口之戰，孫可望遭到重創，被清軍打得大敗，奔返貴陽。清軍大掠靖州、辰州、沅州等地，殺死平民數十萬人，千裏丘墟。至此，孫可望再不敢與清軍爭勝，隻想保持割據一方的地位。
四川方麵，孫可望派去的劉文秀一軍在永曆六年秋天連連取勝，最終把吳三桂等數部清軍打得退守閬中。當時清廷已經下令，決定讓清軍放棄全川，退回陝西漢中一帶，全保陝地。
可惜的是，劉文秀不知“窮寇莫追”之說，死纏爛打保寧城內的清軍，孤城之下犯險，最終反被吳三桂孤注一擲的決死戰法擊敗。結果，數萬明軍被殺，清軍死裏逃生不說，還實現了全麵大翻盤，劉文秀率殘軍退回貴州。
本來就恨劉文秀與李定國穿一條褲子，孫可望抓住機會，削奪劉文秀兵權，把他發回昆明軟禁。
保寧戰鬥結束後，身經百戰的吳三桂感歎：“我生平交戰無數，平生未遇如此勁敵！”富貴險中求，吳三桂為清朝又立全取四川的大功。
安龍方麵，孫可望對永曆君臣一直嚴加注意。其間，本為永曆帝親信的馬吉翔，一直向孫可望投懷送抱。
馬吉翔是北京大興人，市井出身，本性狡黠，是個知書識字的高級地痞。他年輕時在北京給宮內太監家中當仆人，後為書辦（太監的文字秘書），在太監圈子裏人緣很好。後來，他跟隨太監高起潛出外監軍，竄入錦衣衛籍，獲得都司之職，開始有了政治發跡的本錢，送銀送物之下，被外派為廣東都司。所以，北京甲申之變時馬吉翔正在廣東，逃過一劫。隆武帝在福建繼位，馬吉翔自陳原本是錦衣衛世家出身，獲授錦衣衛指揮，冒升為皇帝身邊的禁衛軍高級首領。他奉命到湖南等地巡視時，玩命地巴結當地諸將，隻要有雞毛蒜皮的功勞，就要在奏表中放入自己的名字，於是連連升官，很快做到“總兵”。永曆帝繼位，馬吉翔給新皇身邊的人廣送厚禮，得封文安侯。
由於馬吉翔自小行走於太監門下，他深知巴結皇帝身邊宦官的重要性，成日以小恩小惠刻意結交打點，使得宦官們心甘情願為他當耳目。所以，永曆帝的一舉一動，他無不預知。由於善於迎合，十分乖巧，永曆帝與其母特別喜歡這位馬侯爺，認定他忠勤無比，讓他掌握朝廷軍政大權。
到了安龍，永曆帝落地鳳凰不如雞，馬吉翔自然要另攀高枝，遂與掌管禁衛軍的太監龐天壽交結孫可望，想逼永曆帝禪位孫可望，謀求大富貴。為此，他持白綾一幅以及數錠金元寶，找到善畫的武選司郎中古其品畫一幅《堯舜禪讓圖》，準備獻給孫可望。
古其品人格高尚，憤怒拒絕。馬吉翔為此向孫可望偷偷告狀，古其品被孫可望抓去貴陽，活活打死。
為了凸顯馬吉翔和龐天壽二人的威權，孫可望特意向安龍發來指令，表示說朝廷大小機務，一概由二人秉持。如果有大臣“犯法”，也由二人全權處理。
永曆帝漸知馬吉翔對自己不忠，很想殺掉他與太監龐天壽，但懾於孫可望的勢力，不敢輕易下手。馬吉翔與孫可望手下大臣方於宣等人密切勾結，想改國號為“後明”，立孫可望為帝。
憂急之下，永曆帝對親信內監張福祿說：“孫可望無人臣之禮，奸臣馬吉翔、龐天壽為其耳目，朕寢食不安。聽說李定國精忠報國，軍聲大振，希望你們能把朕的密敕交予他，讓他來救朕脫身虎口，脫離孫可望控製。”
內監張福祿對永曆帝說，徐極、林青陽、胡士端等人一直疏劾馬吉翔，可讓他們想辦法聯係李定國。於是，林青陽以請假回家奔喪為名，前往李定國處聯絡。
馬吉翔不久得知此事，即刻派人密告孫可望，說永曆君臣已經聯係李定國，準備“謀反”。孫可望大怒，立刻派親信鄭國率兵到安龍問罪。最後，牽引勾連，包括大學士吳貞毓在內，十八個大臣被盡數逮捕，判罪“欺君誤國，盜寶矯詔”，皆處以死刑。
永曆帝憂憤至極，也救不得人，眼睜睜看著十八個大臣被孫可望軍人處死，這就是南明的“十八忠臣案”。
這些人雖然都是文士，皆慷慨悲歌，與朝臣紛紛賦詩作別，勉勵說：“我們就這樣去了，中興大業，交與諸位。希望諸位忠於朝廷，切不可像馬吉翔、龐天壽那樣賣主求榮。能如此，我們雖死猶生！”言畢，諸忠臣引頸受戮。
十八忠臣既死，永曆朝廷大權盡歸馬吉翔、龐天壽，完全成為貴陽孫可望的傀儡附庸。