進入20世紀90年代，一步成功的電影大大提升了斯皮爾伯格的影響，從此外界對他的評論也開始變化，這部電影就是《辛德勒的名單》。《辛德勒的名單》真實的再現了德國企業家奧斯卡·辛德勒在第二次世界大戰期間保護1200名猶太人免法西斯殺害的，真實的曆史事件。在該片中，流淌著猶太血液的斯皮爾伯格用史詩般的鏡頭把五十年前二次大戰中德國納粹屠殺六百萬猶太人的慘劇搬上了銀幕。斯皮爾伯格明知冷肅的題材、沉重的主題不被票房看好，但敢於冒險的他卻拋棄了最拿手的玩意兒——電影特技，而采用了黑白底片與手提式攝影機。
1993年，斯皮爾伯格帶領《辛德勒的名單》一片攝製組初抵波蘭，就在他們跨進二戰期間克拉科夫中營準備安營紮寨之時，突然收到全美猶太人協會從紐約發來的一封急電：“請勿驚擾亡魂，讓他們安息吧。”
斯皮爾伯格讀完這聊聊數語的電文，一言不發。他當即下令攝製組全體人員撤離克拉科夫集中營，轉移到幾十公裏以外，搭置布景拍攝。
與此同時，斯皮爾伯格獨自一人離開了攝製組，乘飛機直接飛往紐約。斯皮爾伯格不派代表，不借助電話、電報、電傳等迅速方便的現代化通訊工具而橫跨大西洋，親赴紐約向“猶協”致歉，他的謙遜和誠意令“猶協”全體成員無不動容。
《辛德勒的名單》上映了，頓時，它成為全球最矚目的影片，其思想的嚴肅性和非凡的藝術表現氣質都達到了幾乎令人難以超越的深度。它讓世界感到震驚，這部深刻揭露德國納粹屠殺猶太人恐怖罪行的電影，於1994年3月1日在德國法蘭克福首映，德國總統親自出席了影片的首映式。
當時，美國總統克林頓看過此片後印象很深，以至在一次新聞發布會上疾呼：“我迫切要求你們去看看這部影片。”
很多人認為該片將作為電影史上永恒的光輝而存在，它是電影史上一部經典的作品。斯蒂芬·斯皮爾伯格的名字也將與這部影片聯係在一起而永遠流傳下去。
《辛德勒的名單》成功了，斯皮爾伯格戰勝了挑戰，他以深沉的激情拍出了影片的真實感、曆史感與人道主義襟懷，影片不僅贏得了高票房，還與《侏羅紀公園》一起，真正實現了他追求已久的奧斯卡之夢。
1994年3月2日，第66屆奧斯卡頒獎晚會上，影片由斯皮爾伯格執導的《侏羅紀公園》和《辛德勒名單》一舉囊括了共九項獎項。當這兩部傑作的共同導演斯皮爾伯格登上領獎台時，全場起立，掌聲不息，在這個屬於斯皮爾伯格的夜晚，一向鎮定含蓄的他也不禁潸然淚下。
斯皮爾伯格並沒有停下他前進的腳步，當然前進中有輝煌，也有失敗。《侏羅紀公園》獲得成功後不久，他又再度創建了一個恐龍公園，隆重推出了他的又一力作，《侏羅紀公園》的續集《失落的世界》。
雖然此集中栩栩如生的畫麵鏡頭仍令觀眾有身臨其境之感，但此片整體質量大不如前作，上映之後甚至有媒體稱“這是斯伯有史以來最失敗的作品”，這樣的評論也直接導致斯皮爾伯格不再接任第三部《侏羅紀公園》的導演職位。
緊接著，斯皮爾伯格導演並推出了一部描寫100多年前黑人命運的史詩片《斷鎖怒潮》。該片由老牌黑人影星摩根·弗裏曼和奧斯卡影帝安東尼·霍普金斯擔當主演。但本片於97年12月上映後，被人控告剽竊他人小說作品，因此到最後票房成績並不十分理想。
然而，在經曆小低穀的斯皮爾伯格，在1998年卻拍攝了一部“戰爭電影中的最佳影片”，那就是《拯救大兵瑞恩》。該影片重現了50多年前驚天動地的諾曼底登陸戰的恢宏場麵，讓人驚駭的目睹了戰爭的激烈和殘酷。
影片用紀錄片的手法表現了腥風血雨的戰場，震撼人心。導演著重刻畫了戰爭中人的關係和人性的表現。斯皮爾伯格也因此第二次獲得了奧斯卡最佳導演獎。
進入21世紀後，斯皮爾伯格平均每年都有一部電影問世，其中包括《人工智能》、《逍遙法外》、《貓鼠遊戲》、《幸福終點站》等都是不錯的影片。
除了是成功導演外，斯皮爾伯格還是一名製片人。從20世紀80年代中期起，斯皮爾伯格就增加了一個身份電影製片人。那時他已經製作了幾部動畫片，包括《TinyTooures》、《Animaniacs》，以及在評論和商業上都獲得成功的《animatedfilm》和《TheLandBeforeTime》。
有一段時間，斯皮爾伯格也曾是一部長壽劇集《ER》的執行製片人。1989年，他將“TheDig“的遊戲創意帶入LucasArts公司，並一直鼎力支持這個項目直到1995年遊戲發布。他還同軟件開發商KnowledgeAdventure合作開發了多媒體遊戲“StevenSpielbergsDirectorsChair”，該遊戲於96年發布。斯皮爾伯格出現在遊戲中以指導遊戲者。
1993年，斯皮爾伯格成為一部被寄予厚望的電視劇集《aQuestDSV》的執行製片人，該科幻劇集類似於《TheGeion》，將故事背景設在“不久的將來”，由RoyScheider和JonathanBrandis主演，每周日晚上8點開始在NBC上播放。盡管該劇集第一季獲得了成功，但第二季則顯得大為遜色。斯皮爾伯格的名字不再出現在第三集中，該劇集也在第三季中途擱淺。