同治三年（公元1864年）六月十六日中午，隨著一聲山崩地裂的巨響，太平門城牆被炸塌二十多丈，磚石如雨點般紛紛墜落，一時間煙塵蔽日，即使麵對麵在瞬間都看不清對方的麵目，湘軍趁亂蜂擁入城。太平軍紛紛用槍炮還擊，雖然給湘軍造成重大傷亡，但依然沒能擋住湘軍的攻勢。與此同時，湘軍水師各營會同陸師奪取了水西、旱西兩門。
激戰到傍晚時分，天京九門全被攻破。天京城內守軍與入城湘軍展開巷戰，都戰死在城內，十多萬人沒有一個投降的。也許在他們被湘軍砍掉腦袋的一瞬間，是笑著的，因為他們終於可以魂歸天國，享受那沒有壓迫，沒有剝削，平等、博愛的幸福生活了。
死對戰敗的將士來說，是最好的解脫，當然也包括兵敗的太平軍。
湘軍進入天京後，見人就殺，見財物就搶，見婦女就奸淫。直殺得天京城內血流成河，哀嚎遍野，屍體湧進長江後，幾乎使江水不流。湘軍在搶光、殺光以後，還不解氣，又一把火把天京城燒了。這樣，原本一個繁華的天京城，在湘軍的鐵蹄踐踏下，成了血與火的人間地獄。
據曾國藩記載，湘軍“分段搜殺，三日之間斃賊共十餘萬人。秦淮長河，屍首如麻”。清人記載：“天京之役，伏屍百萬，秦淮盡赤；號哭之聲，震動四野。”所謂伏屍百萬，顯然有些誇張，不過從側麵反應了這次屠城和對城市的毀壞程度居曆史之冠。
這次屠殺是曆來南京災難中最慘烈的一次。屠城、焚燒城後，天京連一棵完整的樹都找不到了，更別說是找個活著的人了。
無疑，在湘軍的這次屠城之中，最遭殃的莫過於平民百姓。許多平民在這次浩劫中都丟掉了性命。
據載，當時金陵城“屍骸塞路，臭不可聞”。湘軍見人就砍，老弱病殘也不在話下，隻要是喘氣的，就一個也不放過。
在這場浩劫中，最受苦的就數女人了，在光天化日之下，她們不僅被撕扯掉所有的衣服，還會被湘軍奸淫至死。曾國荃的部下李臣典最熱衷於奸淫婦女，就是一個最好的反麵例子。
李臣典當年27歲，風華正茂，他在攻破天京以後大肆強奸婦女，10天之後，竟然因為體力不支而一命嗚呼了，真是天下醜聞。而那些僥幸活下來的女子，大多也都被運回了湖南，成了湘軍的私有財產。
六月二十一日，全城火勢漸漸地熄滅了。昔日繁華的古都，在無情的戰火中被毀壞的不堪入目，隻剩下滿目的斷壁殘垣。
可見，曾國藩對於自己一手訓練的湘軍，是鼓勵他們縱火殺人的。那麼對於搶劫呢？他也是默許的。
早在鹹豐十一年，當曾國荃攻破安慶，運送了大量的戰利品到家裏的時候，曾國藩就對這種行為不聞不問。
天京就這樣陷落了，太平天國運動徹底失敗了。
同治三年（公元1864年）六月十六日中午，隨著一聲山崩地裂的巨響，太平門城牆被炸塌二十多丈，磚石如雨點般紛紛墜落，一時間煙塵蔽日，即使麵對麵在瞬間都看不清對方的麵目，湘軍趁亂蜂擁入城。太平軍紛紛用槍炮還擊，雖然給湘軍造成重大傷亡，但依然沒能擋住湘軍的攻勢。與此同時，湘軍水師各營會同陸師奪取了水西、旱西兩門。