對中關係問題
日本政府自岸信介以來，對中國問題一直奉行著“兩個中國，一中一台”的原則，中國大陸方麵一直對日本這種態度表示敵視，不願意與日本恢複邦交。
佐藤榮作上台後，他一直想要通過自己的努力恢複與中國邦交的正常化。但是，台灣和中國大陸都主張一個中國的原則，但都認為自己才是真正合法的政體，對外具有法人效力。佐藤榮作如果想和中國大陸建立外交關係，就必須否認台灣政府的合法性，從而與台灣政府斷交。
佐藤深知，受日本迫害最深的中國，在日本戰敗後，蔣介石政府卻沒有對窮困潦倒的日本窮追猛打，除了要求遠東法庭嚴懲二戰戰犯外，幾乎沒有提出過什麼賠償要求。蔣介石對日本有恩，這點佐藤榮作銘記在心，而佐藤一向注重情意，所以要日本與台灣斷絕邦交，這讓佐藤根本無法下這樣的決心。
1971年9月，聯合國通過了恢複中國代表權問題的決議，中國回到了聯合國的懷抱中，但是問題隨之而來，聯合國中台灣算什麼？聯合國是隻有主權國家才能參加的國際聯盟，這個決定讓台灣政府的處境十分尷尬。
此時，佐藤榮作的“哥們義氣”上來了，日本在聯合國大會上公然抵製將台灣逐出聯合國。他還派自己的親信鬆野到台灣去，闡明了日本的態度，日本是個知恩圖報的國家，我們會本著信義優先的原則，他們會在將台灣逐出聯合國的重要決議中投反對票，並且會拉著美國一起反對。
這個舉動讓中國大陸對佐藤內閣有了一種充分的不信任感，雖然佐藤一直致力於摸索著與中國大陸改善關係，比如他曾經派過東京都知事美濃部為密使與中國大陸接觸。但是中國大陸對佐藤內閣的強烈懷疑，使得佐藤所做的這些努力徹底泡湯，最終失去了與中國改善雙邊關係的機會。
而美國總統的尼克鬆卻早於日本行動，並且大大方方地發表一係列講話，希望緩和中美關係。這樣坦誠的向中國大陸拋出了橄欖枝，受到了中國政府和人民的歡迎。
佐藤榮作一向喜歡秘密從事的風格卻成為了這件事外交大事的障礙，不能和中國邦交正常化這無疑是佐藤榮作政治生涯中最遺憾的一件事情了。