與此同時，王陽明下令押解寧王及一眾偽官，兼程前進，趕去向明武宗獻俘。
王陽明還盡量勸說明武宗寵信的張永說：“江西百姓久遭宸濠的毒害，又經曆一場這麼大的禍亂，加上遇到罕見的旱災，生活十分困苦；為了供奉勤王軍的軍餉，更是雪上加霜。若有大軍再度入境，哪有供奉的力量？必然逃竄山穀，聚眾為亂。一旦地方糜爛，形成土崩之勢。再想興兵定亂就難了。”
張永頗有良知，默然良久，歎道：“我此次前來，是為了保護皇上，不是為了爭功。皇上身邊宵小環顧，進言很難，倘若順著皇上的意思，或可挽回一些；若逆意而行，隻會給宵小留下攻擊的把柄，無補於天下之大計。”
王陽明看出張永的誠意，於是將朱宸濠交給他，然後靜觀其變。
明武宗執意要放朱宸濠，再打一仗，於是派一個錦衣衛官員來找王陽明追取朱宸濠。王陽明不肯出迎，部下怕他惹麻煩，苦苦相勸。王陽明正色道：“兒子對於父母的亂命，如果可以說話就要涕泣相勸。我不能做阿諛之人。”部下又問打發錦衣衛多少酬勞，王陽明說：“隻給五兩銀子。”錦衣衛一看錢這麼少，好像打發叫花子似的，心裏發怒，拒不接受。次日，錦衣衛辭行，王陽明卻又拉著他的手，熱情地說：“我曾被關錦衣衛的監獄很久，從未見像您這樣輕財重義的。昨天的薄禮隻是聊表心意，您不要，令我很惶愧。我別無長處，隻會作文。他日當撰文記述此事，讓大家知道錦衣衛還有像您這樣的義士。”那個錦衣衛被弄得哭笑不得，隻好灰溜溜地走了。
王陽明所做的工作，使新的平叛戰爭終於沒有打起來，而明武宗對王陽明也無好感，不想封其功，反倒想治其過。
大學士楊廷和忌恨王陽明的功勞，趁機順著明武宗，想陷害王陽明。宦官張忠也進讒說：“王守仁在杭州，竟敢不來南京，陛下試召之，必不來，他眼中就根本沒有皇帝。”隻有張永敬佩王陽明的為人，在明武宗麵前盡述王陽明的忠誠，終使明武宗不忍對王陽明下手。
此時王陽明的處境很微妙，他立有大功，可能受重賞；可他惹得皇上和寵臣們不高興，也可能有大禍，他並不以一身得失為念，隻是由著良知去做。張忠、許泰以清查寧王餘黨的名義，領大兵進駐南昌，弄得雞飛狗跳，王陽明為免百姓受到騷擾，讓城區百姓出城避難，隻留下老年人看門。又親自勞軍，安撫北軍，以感化他們，保持紀律。
對張忠和許泰，王陽明當然知道，如果卑躬與之結交，對前途大有好處；得罪了他們，則可能有隱禍。王陽明不管這些，每次召開會議，必定居中而坐，從不謙讓。張忠、許泰心中不快，有意讓王陽明出醜，他們以為王陽明隻是文人，不懂武藝，於是在校場上，要求他表演射箭。王陽明不慌不忙，三箭全中，贏得了北軍的陣陣喝彩。張忠、許泰見此計不成，心裏更是不快。
大軍在江西攪擾一番後，因確實無仗可打，明武宗隻好下令班師回朝。張忠等人尚不罷休，開始積極詆毀王陽明，給他總結與寧王朱宸濠勾結的多條罪狀，企圖將他功臣變成罪臣。王陽明知道他們的小動作，卻一笑置之。他們無非怕他憑功勞爭奪權勢，可他又何嚐想爭奪權勢？真是“以小人之心度君子之腹”。他倒是想立即辭官，退歸田園，奉養老父。
後來，明武宗迫於輿論壓力，不得不封賞王陽明。王陽明淡然受之，仍是一心清淨。
按政治家的標準，王陽明在處理官場關係，確實不夠精明，甚至還很“嫩”，明明對自己有好處的事，他認為不該做便堅決不做；明明可能惹麻煩的事，他認為該做還是堅決去做。這便是“按良心辦事”，不一定能做出對自己最有利的事，卻可以做一個幹幹淨淨的人。