先是南宋的著名史學家李燾寫了一本《續資治通鑒長編》的書，書中有意識地揭秘了宋太宗謀殺太祖父子的蛛絲馬跡，讓其流傳後世。孝宗知道自己是太祖的後代，也理解民間一直的同情太祖子孫的心理，所以他在親自審閱書稿時對李燾的記載抱著支持與認可的態度。作為太宗的後代，已經當了太上皇的趙構當然心裏不高興，但他也不便明說，因為一旦明說，就會引起爭論，會把宋太宗的那些醜事揭得越多，反而更加不好，所以，他隻能隱忍不發。
再後來是孝宗要替嶽飛平反。孝宗一心主張抗金，對嶽飛非常推崇，據說他在少年的時候曾經見過嶽飛，跟嶽飛有過一次交談，還引起過高宗的懷疑。嶽飛被害時，他才14歲，心裏非常不滿，但當時他連太子的名分都沒定，當然也不敢有什麼說法。而對於秦檜，他就不客氣了，經常在議事的時候嗬斥這位自以為是的宰相。秦檜當然也把他看作眼中釘，幾次三番想阻撓他當太子，把這個接班人拉下馬，但終於未能成功。孝宗當了皇帝後，秦檜也早已經死了，而金主完顏亮又撕毀和約，大舉南侵。孝宗決定替嶽飛平反，以此振奮士氣。他在接見嶽飛的兒子嶽雷時，親自從禦座上走下來，撫著痛哭流涕的嶽雷的背脊，對他說：“卿家冤枉，朕悉知之”——你們家受的冤枉，我都知道！
替嶽飛平反就麵臨著對高宗評價的問題，事實上，殺嶽飛的決策是由高宗最後拍板的，高宗甚至還把嶽飛的長子嶽雲的判決由二年徒刑改為了處斬，但把矛頭直指太上皇顯然是有違孝道的，也會造成大臣們之間不必要的分裂，所以，孝宗做得很聰明，把一切罪過都推在了秦檜身上，反而宣稱是奉了太上皇的旨意替嶽飛平反。趙構當然也知道嶽飛是冤枉的，在輿論呼聲高漲的時候，他也不便強行反對，但心裏的不舒服卻是兩人大打肚皮官司的又一項重要內容。
除了政治主張的不同，孝宗在其他方麵對高宗這個太上皇克盡孝道，仁至義盡。南宋人周密的《齊東野語》記載了一個故事：孝宗守高宗之喪，吃完一百天的素後，還叫禦廚繼續給他準備素膳。吳妃見孝宗消瘦了很多，怕他身體吃不消，就偷偷到禦廚對尚食內侍說：“皇上吃了那麼久的素，比以前瘦多了，你們也想想辦法呀！”尚食內侍便熬了雞汁加入素饌中，端給孝宗吃。孝宗一吃，覺察出味道有異，便詢問內侍，內侍不敢隱瞞，據實相告。孝宗竟把吳妃休了，那些尚食內侍也全都遭到降職的處分。可見，孝宗的孝還真是純孝！
但遺憾的是，他自己卻沒有這樣的好福氣。孝宗當了27年皇帝，有誌抗戰，卻無力恢複，幾次北伐都以失敗而告終，他也漸漸地疲倦了，於是就學高宗的榜樣，在63歲的時候提前退休，禪位給了光宗。
光宗是孝宗的親生兒子，但他卻不像他的父親那麼孝順。說起來當然也是有原因的：光宗即位的時候已經43歲，他早就想著當皇帝了，幾次三番托他的祖母，也就是高宗的皇後去跟他老爸說，希望老爸像祖父一樣早點把皇位讓出來，可孝宗卻認為太子還太年輕，光宗當時就很不高興，說：“我頭發都白了，還拿我當小孩子。當年爺爺早就傳位給他了。”
孝宗、光宗這對親生父子關係不好的另一個原因是因為一個女人。這個女人當然是光宗的老婆了。光宗的老婆在當太子妃的時候就醋勁很大，經常大鬧後宮。孝宗看不下去，就警告兒媳婦：“再吵再鬧，就廢掉你！”沒想到，兒媳婦記著仇呢！這一對夫妻當了皇帝、皇後，他老爸孝宗退休後的苦日子就來了。
當孝宗病危的時候，大臣們請求光宗去孝宗的病床前看望服侍，光宗本來也答應了，卻被他的皇後硬生生阻止，隻派了自己的兒子去問候。後來，光宗甚至連父親的最後一麵都沒去見。孝宗去世後，光宗居然也借口有病，不肯主持父親的喪禮。宰相上前去哭著拉住光宗的衣袖，把衣服都拉破了，但仍然無濟於事，以致連孝宗的國葬禮式都無法正常進行，最後，隻得由高宗的皇後、已經八十高齡的太皇太後代為主持。
帝王的家事其實也跟老百姓家一樣，家家有本難念的經，但帝王家的那本經不念好，影響的不隻是一家而已。南宋的衰落，也正是從光宗這一朝開始。