徐恩曾是“共黨問題專家”，他對共產黨的地下活動很了解。他在電台搜集情報、破譯電台密碼方麵有很高的造詣，他利用自己的這些特長建立了龐大的電台網絡，這更利於他更全麵係統地搜集情報。徐恩曾還有一個重要“貢獻”，那就是創建了龐大的特務組織：中統。中統雖然名氣不如軍統，但其手段殘忍、臭名昭著的程度是任何其他特務組織都無法匹敵的。對付共產黨人，徐恩曾有以下幾種辦法：
其一，利用黑幫，對共產黨進行滲透和破壞。不過這種方法，從黨務調查科成立之前就有了。早在陳立夫策劃的安慶、九江事件中，陳立夫就果斷地利用了兩個派別的黑道：一個是青幫，一個是洪幫。
青幫，也叫清幫。之所以也叫清幫，是因為它成立於清朝雍正四年，創始人是潘清、錢堅和翁岩。青幫也叫“糧船幫”，因為成立這個組織的初衷，就是對付朝廷，控製運載糧食等重要物資的船舶的水上運輸。青幫與洪幫、白蓮教的顯著區別是：青幫新人入會通常會拜師，由師傅教你青幫的規矩。青幫實行的是禪宗製度，完全是一個有信仰、有組織的“黑道組織”。後來，青幫與洪幫和白蓮教並列為“三教”，民間有“紅花綠葉白蓮藕，三教原來是一家”的說法。國有國法，幫有幫規，青幫的幫規是“十不準”，所謂“十不準”，即：“不準欺師滅祖，不準藐視前人，不準扒灰倒攏，不準奸邪淫盜，不準江湖亂道，不準引發代跳，不準擾亂幫規，不準以卑為尊，不準開閘放水，不準欺軟淩弱。”
清朝末期，中國的海運興起，內河運輸逐漸衰落，大量青幫分子紛紛轉行，從事其他行業。上海是當時青幫分子的聚集地，據說當年每兩個上海工人中就有一個是青幫分子，可見其數量之多，力量之大。當時，許多年輕才俊在投身革命之前都曾加入過青幫，其中包括陳其美、蔣介石和汪壽華等。近代青幫三大首領也是赫赫有名的，他們是黃金榮、杜月笙和張嘯林。後來，國民黨意識到青幫幫派規模巨大、影響力非常，所以想方設法拉攏青幫，讓青幫為“黨國”賣命。尤其在上海，國民黨發動的諸多事件都有青幫分子參與，比如“四一二政變”等。利用青幫分子搞破壞的也不僅僅隻有徐恩曾一人，戴笠也曾利用青幫分子在上海租界搜集情報。徐恩曾與上海青幫的三個大佬私交甚密，在青幫裏也能呼風喚雨。
洪幫，也稱洪門，即天地會。這個幫派成立於明末清初，據說是陳近南創辦的。洪幫與青幫的不同之處在於：洪幫總是打著反清複明的口號。洪幫遭到清朝政府的鎮壓之後，被迫轉移到海外，但是後來的洪幫分子繼續參加反清運動，有些還加入了孫中山的隊伍，為推翻清政府的統治立下了汗馬功勞。
辛亥革命領導人之一譚人鳳曾這樣說：“革命之成，實種於二百年前之洪門會黨。在運動之初，唯洪門兄弟能守秘密。發動之後，亦唯洪門兄弟能聽指揮。人無論遠近，事無論險夷，個個奮勇，個個當先，卒有武昌起義，各省響應，不數月而共和告成，軍隊之功，實亦洪門兄弟之功。”（選自譚人鳳《社團改進會意見書》）而孫中山則如此評價洪門：“洪門者，創設於明朝遺老，起於康熙時代。蓋康熙以前，明朝之忠烈士，多欲力圖恢複，誓不臣清，舍生赴義，屢起屢蹶，興虜拚命，然卒不能救明朝之亡。迨至康熙之世，清朝已盛，而明朝之忠烈，變殘廢殆盡。二三遺老，見大勢已去，無可挽回，乃欲以民族主義之根苗，流傳後代，故以反清複明的宗旨，結成團體，以待後有起者可藉為資助也。此殆洪門創設之本意。然其事必當極其秘密，乃可防政府之察覺也。夫政府之爪牙為官吏，而官吏之耳目為士紳，故凡所謂士大夫之類，皆所當忌而須嚴為杜絕者，然後其根株乃能保存，而潛滋暗長於異族專製政府之下。以此條件而立會，將以何道而後可？必也以能全群眾心理之事跡，而傳民族國家之思想。故洪門之拜會，則以演戲為之，蓋此最易動群眾之觀聽也。其傳布思想，以不平之心，複仇之事以表之，此最易使士大夫聞而生厭遠而避之者也。其固結團體，則以博愛施之，使彼此手足相顧，患難相扶，此最合乎江湖旅客無家遊子之需要也。而終乃傳以民族主義，以期達其反清複明之目的焉。”（選自《孫文學說》）可以說洪幫為了搞革命，出錢又出人，國民黨高官陳炯明、唐繼堯等人，都曾經加入洪門。就像多數幫派一樣，洪門也有自己的幫風，這種幫風類似於黑社會的左派。這種幫派一旦被壞人利用，必然會給社會造成極大的危害。
徐恩曾就曾經利用“洪幫”大做文章，把洪幫分子作為特務的眼線、耳線，向共產黨（包括國民黨左派）進行滲透，做了很多見不得人的事情。據大特務黃凱回憶，在他出任武漢特派員期間，徐恩曾曾給他發過一道密令，命令他們參加洪幫，隱藏身份，並且拜下山頭。後來黃凱還在洪幫內取得了一定的職位，而其他參加洪幫的特務也在洪幫內部抱成一團，成為洪幫中具有極大破壞性的一派。後來徐恩曾把黃凱調至上海，分配黃凱先做三件事：第一件事，拜見洪幫頭子楊虎；第二件事，拜見上海三大亨；第三件事，加入青幫！後來黃凱拜青幫首領徐朗西為師，一躍成為青幫的頭麵人物。
洪幫與青幫的性質其實是一樣的，都屬於秘密會黨。這兩個幫派沒有公開的身份，是屬於“黑社會”性質的，不能暴露在陽光之下的黨派。徐恩曾與這些幫派合作，既得不到蔣介石的經費支持，而且由於這些黨派的流動性比較大，所以與他們合作，比較容易暴露整體的行動計劃。所以，徐恩曾逐漸覺得“青洪幫”是根雞肋，利用價值不大，甚至有時候成事不足敗事有餘。於是，他最終還是選擇與憲兵隊和警察局合作對付共產黨人。
其二，與憲兵隊和警察局合作，對付共產黨人。前麵已經說過，徐恩曾在黨務調查科時，發現特務礙於“身份”，有時很難進行搜查和抓捕的行動，當他看到憲兵隊或者警察局可以堂而皇之地破門而入，進行搜查和抓捕後，便向上級打報告，積極運作與憲兵隊、警察局的“合作”事宜。
可以說，徐恩曾的這個方法非常行之有效，使得特務們最大限度地發揮了他們的破壞能力。特務們披上“警服”，搖身一變成了警察，這樣的變化也使地下黨們一度殫精竭慮、無法應對。可見徐恩曾做“特務”，還是非常有天賦的。當然，在最初開始從事特務工作時，徐恩曾不僅沒有“特務細胞”，而且從心眼裏瞧不起這個工作，他認為像自己這樣搞實業出身的工程師，去做特務簡直太屈才了。不過後來，徐恩曾在特務行中嚐到了甜頭，就開始努力發掘自身的潛力。
其三，建立無線電台，破譯共產黨的電台密碼，截獲共產黨的電台信息。電台是特務的重要設備，當時，很多軍事組織都通過電台發報、破譯密碼來傳遞情報，所謂的“雞毛信”和“飛鴿傳書”，比起電台發報簡直就是小兒科。徐恩曾是工程師，在電台方麵是專家，沒進黨務調查科前，徐恩曾就幫助國民黨安裝、調試了第一台電台。在電台的開幕慶典上，蔣介石還豎起大拇指說：“這東西一發威，可以頂三個師！”言外之意，他非常關注並且重視電台情報工作。在黨務調查科開展工作之後，發送情報的方法有兩種：第一種，靠秘密交通關係傳送情報（這需要人力和交通工具，不適於長距離傳送）；第二種，就是通過無線電台發射無線電報。無疑，第二種方法更加安全，更加迅速。所以包括黨務調查科在內的很多軍事組織，都以無線電台發射電報為主要的情報傳送方式。