馬寧請皇帝先回宮，自己還要安排一下護國軍的後續事宜，還要去看看鍾繇奉旨為自己安排的府邸，如今入住長安城，有數不盡的事情等著馬寧去做呢。
馬寧隻留下了陷陣營和護國軍第一騎兵團和第一步兵團，這三支隊伍駐守長安城，和中央禁軍一起擔負長安城的防務，其餘軍隊都返回霸陵大營。
中央禁軍，接下來也要進行改編，按照護國軍的編製和訓練方法進行操練整改，馬寧可不想放過這麼一支精銳之師。
如今關中三輔盡入馬寧之手，成為了安全的大後方，馬寧已經派人去給臧霸送信，可以把安定老營的家眷、馬鈞的匠作營，南匈奴的貴族高層等等都搬遷到長安來。
漢獻帝在未央宮設下晚宴，在朝的文武百官作陪，馬寧率領護國軍所有軍司馬以上的軍官，甚至包括馬騰，李傕等人一起赴宴，隻有張遼被安排留守霸陵大營。
宴會開始之前，漢獻帝劉協便當眾宣布馬寧這一次進京救駕居功至偉，晉封馬寧為大將軍，錄尚書事，開府，假節，授爵安定侯。
同時賜予馬寧三大特權，“入朝不趨，讚拜不名，劍履上殿”，這當初可是董卓逼著朝廷賜給自己的特權，而且漢獻帝還將北宮也就是明光宮，賜予馬寧，做為大將軍府邸，真正是寵愛有加，無上榮光。
到了此刻，馬寧已經真正的做到了位極人臣，一人之下萬人之上，也可以看做“狹天子以令諸侯”大戰略的正式開始。
漢獻帝劉協允許馬寧提供一份有功人員的獎勵名單，他會遵照執行，另外馬寧以大將軍身份錄尚書事之後，就是實際上的總領朝政，朝中文武大臣的重新任免也就由馬寧一言而決。
劉協通過短暫的接觸，就已經認定馬寧不是普通人，簡直無所不能，對自己也很不錯，遠非董卓之輩可比，印象極好，至於馬寧大權獨攬，漢獻帝早已習慣和麻木，他雖然年紀不大卻能認清現狀。
而且他身邊的宦官早已被李肅收買，經過十常侍之亂，現在的這些宦官，哪裏還敢得罪馬寧這樣的權臣，隻要有足夠的好處，自然是在皇帝耳邊淨說馬寧的好話了。
馬寧入主長安朝廷之後，提出的第一項議程就是大赦天下，此提議最早就是漢獻帝自己提出來的，所以順利通過。
馬寧的第二項議程就是此次長安護駕的有功人員封賞名單，同時也包括了新的朝廷文武官員任命，當然僅限於三公九卿這個級別的，太低的職位還用不到馬寧來操心。
大將軍自然由馬寧來擔任，開府，錄尚書事，總領朝政。
太尉一職就由馬寧的老上司皇甫嵩來擔任，皇甫嵩可是現在長安朝廷眾人之中，資曆最深，戰功最卓著之人，擔任太尉，也是理所應當。
司徒由馬寧救下來的老臣盧植擔任，盧植德高望重，他正在從安定來長安的路上，司空則由一直在長安的老臣楊彪擔任。
不過現在的三公並無多大實權，長安朝廷如今隻有馬寧一人錄尚書事，三公隻是大義名分而已。
以賈詡為侍中，兼大將軍府長史，守尚書令，掌管官吏任免和宮中機要，最是位高權重，掌握中央實權，隻需要對馬寧一人負責。