靠著小黑靈敏的嗅覺追蹤，以及山間小道留下的馬蹄印，陳麗娘等人逃奔至幹水磨一帶時被趙教所率領的明軍擒獲。他們最終沒能逃到朵甘思，用另一種方式去開啟新的人生。
趙教命人快馬加鞭地將消息傳回四川承宣布政使司，布政使蔡思侃大喜過望，親筆上書，派人八百裏加急奏請當今皇帝朱祁鈺。
朱祁鈺收到蔡思侃的奏疏，特意在早朝對眾大臣提出：“朕昨日收到四川承宣布政使蔡思侃的奏疏，得知龍州薛兆乾伏誅，其母及其家眷、同黨共計二十二人被擒獲，龍州薛氏叛亂得以平定，朕深感欣慰。對於薛兆乾其母及其家眷、同黨，眾卿家認為朕該如何處置，才能昭告天下臣民，以儆效尤呢？”
兵部尚書於謙上前一步，向朱祁鈺諫言：“恭喜皇上，賀喜皇上，龍州平叛，實乃皇上的福澤恩賜。龍州薛氏犯上作亂，薛兆乾雖已伏誅，但其率家眷、同黨犯下十惡不赦的謀反大罪，理應籍沒家產，其母及其同黨二十二人皆以同謀論斬。”
俞士悅作為刑部尚書，從刑罰的角度出發，接著說：“啟稟皇上，若是為了警示後人，懲一儆百，進而推動改土歸流政策順利推行的話，微臣認為須當嚴厲懲處。叛臣賊子薛兆乾雖已伏誅，但就地掩埋其屍身未免太便宜他了，依照《大明律》，謀反之主謀應當用鐵汁在其葬身之處鑄成鐵丘墳，取永世不得翻身之意，以示天下。同時，還須將其直係家眷除去皆以同盟論斬之外，餘者全部貶為庶民百姓，流放貧困邊遠的深山之中。待此案完結之後，再請皇上下旨昭告天下，以正綱紀，讓大明臣子們汲取教訓，心生敬畏，不敢以身試法，從此一心一意效忠皇上，效忠大明。”
工部尚書江淵有不同意見：“皇上，龍州薛氏謀反一案，理應誅九族。但微臣鬥膽請皇上仁愛，不要趕盡殺絕。薛兆乾畢竟是河東堂忠勇之後，還請皇上念在薛氏先祖曾力助太祖打下大明江山有功，請皇上恩澤薛氏一絲血脈存世，以免薛氏旁支他日惡意中傷皇上殘暴不仁。”
內閣大臣商輅附議道：“回皇上，此番龍州薛兆乾謀反一案中，薛兆芝作為薛兆乾同父異母之弟，並未參與謀反，主動積極配合四川承宣布政使司追捕薛兆乾。可見薛兆芝心係朝廷，不願與其兄薛兆乾同流合汙。還請皇上明察秋毫，獨留薛兆芝一條性命，保薛氏血脈得以延後，以示天下皇上深仁厚澤，賞罰分明。”
江淵和商輅此話一出，誰都聽得出來他們多半與龍州薛氏土司有一定往來，但誰也沒有站出來反駁。於謙不傻，皇帝朱祁鈺也不傻，大家都懂有些事情隻能見好就收，若是不斷擴大化，極有可能收不了口子。到時候不再隻是地方土司的問題，而是整個大明政壇的重新洗牌。
朱祁鈺一臉嚴肅地說：“幾位卿家都言之有理。刑一而正百，殺一而慎萬，隻有對大明不忠的罪人加以重處，才可使眾臣子從中吸取教訓，由此遵紀守法，行事慎重，大明社稷方可長治久安。至於龍州薛氏保留血脈一事，四川承宣布政使蔡思侃的奏疏朕已看過，確也提及薛兆芝主動積極配合追捕薛兆乾。姑且就先留薛兆芝一命吧，給龍州薛氏留一絲血脈。若是日後薛氏再有謀反之心，休怪朕沒有給過機會。”
見朱祁鈺願意給龍州薛氏保留一絲血脈，江淵感激地說：“皇上仁愛，實乃大明之幸啊！”
朱祁鈺端坐在龍椅上，威嚴地俯視著朝堂上的眾大臣，拋出他想說的重點：“龍州宣撫使薛氏謀反一案，相信眾愛卿已經看到土司製度對大明江山社稷的危害，這是在倒逼朕推行改土歸流的新政啊！朕若是再不推行改土歸流政策，及時廢除積弊已久的土司製度，祖宗傳下來的基業豈不是要被這些亂臣賊子毀於一旦？”
說罷，朱祁鈺憤慨地一甩龍袍衣袖，嚇得朝堂上的大臣們紛紛跪下，齊聲呼喊：“皇上英明！吾皇萬歲萬歲萬萬歲！大明江山，萬古基業，千秋萬代！”