送走薛兆芝，幾日後土通判李胤實也自捐己資，拿出三千兩白銀幫助王鑒修建報恩寺，共祝當今皇上聖壽，同祈大明太平盛世。王鑒對雪中送炭的李胤實十分感激，再三致謝後收下了這筆錢。龍安府本地的正知、普恩、海祥等僧侶，以及其他士紳商賈紛紛捐資捐物、出資出力，共同幫助王鑒繼續修建完善報恩寺，令王鑒著實感動。資金一到位，華嚴藏、羅漢堂、萬佛閣的工程建設得以繼續。
經過三年的修建，華嚴藏裏的轉輪藏、鎏金壁畫、天花藻井等終於一應俱全。羅漢殿裏的塑像和壁畫也得到了完善。雄偉的萬佛閣拔地而起，其中的若幹塑像、鎏金壁畫、天花藻井等一係列工程相繼完工。
華嚴殿與大悲殿南北相對，其麵積和建築結構與大悲殿相同。殿內正置轉輪經藏一座，係一木結構塔形器，用於藏經和供佛，可左右旋轉，故稱轉輪藏。轉輪藏通高33尺，係用楠木製作，橫截麵為八角形，外觀八棱四層，實際七層，下大上小，逐層向內遞收，形似七級佛塔。經藏分為四層，第一層為經藏座，下設圓形踏板；中層藏身施腰簷平座；第三層為天宮樓閣，最上為八角攢尖頂。其構造為經藏中心用一根立軸，上端套入殿梁，下端立於圓形地坑中央的鑄鐵砧上。立軸的八麵各穿橫豎木枋，將橫豎木方榫卯連接，構成一個八角形框架。框架外表安裝木板，設置柱子、平座、屋簷、副階、欄杆，嵌造天宮樓閣，雕繪龍鳳花草，安置佛像經典。轉輪藏通體雕繪諸天佛聖、龍鳳花草。
轉輪藏周圍的四根大柱上，各有一條長約21尺的泥塑神龍。該轉輪藏雖高為33尺，直徑為21尺，重為10000斤，僅一個人的力量就可以轉動。這座轉輪藏不僅結構複雜，製作奇特，工藝精巧，雕飾繁雜，既是精致的建築模型，又是出色的工藝品。藏體上各種神像、木雕彩繪、佛像經典，令人歎為觀止。轉輪藏前置石香爐一座，高約6尺，分爐鬥、爐身、爐座三層。爐身透雕流雲，爐座束腰部分浮雕“唐三藏西天取經”的神話故事。右麵雕刻“孫悟空三打白骨精”，左麵雕刻“巧過火焰山”，正麵一組刻的是“取經歸來”。設計獨到，雕鏤精巧，有極強的立體感。轉輪經藏周圍的四根大柱，各懸泥塑神龍一條，龍身長約21尺，遍體金甲耀目，筋骨突露，造型各異。有的張牙舞爪，怒目而視；有的引頸長鳴，氣勢逼人；有的齜牙咧嘴，奮擊長空。宛如活龍再現，大有離柱騰飛之勢。
羅漢殿是報恩寺裏第三進院落裏南北兩側的回廊。東起華嚴殿、大悲殿，西至萬佛閣，軸線兩側以34間回廊圍繞起來，構成廊屋周匝的總體布局。北回廊與大悲殿在一個水平麵上，南回廊與華嚴殿在一個水平麵上。二廊建立在石砌台基上，麵寬17間計約9丈，進深兩間計約15尺，麵積約1458平方尺。為五檁木架，穿鬥式梁架結構，單簷懸山式建築。廊的左、右、後三麵以竹編泥牆封護。塑像和壁畫裝飾精美，回廊寬敞明亮，簷下柱額間安置雕花雀替，額枋上均繪有絢麗的建築彩畫。
萬佛閣建在羅漢殿的盡頭，在報恩寺中軸線上的末端，高72尺，三重簷，五開間計74尺，進深三間51尺。總麵積約為3800平方尺。在這座裝飾華麗、巍峨雄壯的閣樓，鬥拱的花樣和出跳極其講究。拾級入閣，萬佛閣底樓長長的佛壇正中彩塑如來佛祖講經說法像一尊。蓮台通高約17尺，左右的“十大弟子”兩手合掌，侍立兩旁。造型生動，姿態各異，有的笑容可掬，慈祥親切；有的怒目而視，威嚴凶猛；有的合眸默思，深謀遠慮。因性格年齡的不同，神態各不一致，多數平易近人，個別不怒自威。個個形神入妙，栩栩如生，呼之欲出。
在如來佛祖像前麵兩側，豎立著王璽和王鑒的塑像。這兩尊造像高約9尺，頭戴官帽，身著官服，五官端正，神情虔誠，兩手抱拳，聆聽傳經。正所謂修佛之人清心寡欲，王鑒此舉意在向皇帝表丹誠，以顯示王家忠君愛國，一心向佛，絕無半點謀逆之心。世人在拜佛時，在佛祖像前麵兩側的王璽父子也能一並被跪拜，沾沾佛祖福蔭，永享人間香火。王鑒還特意請匠人在殿中雕刻了一座設計精巧、造型獨特的石雕香爐，高約6尺，分六層以上鏤空透雕的作法製成。香爐上雕刻有手持各種器樂的樂伎，有千層百瓣的花卉，有生動嬉戲的群獅，還有張牙舞爪的雲龍，無不各盡其妙。
萬佛閣底樓右側有一樓梯，可扶梯而上，到達樓座。樓的後部神龕上供有七尊木雕佛像，佛經上稱它們為“七佛”，即釋迦牟尼還未成佛之前就已有六位佛，加上釋迦牟尼佛，即為過去在娑婆世界渡眾的“七佛”。閣內除佛像外，樓上樓下的27平方丈的滿牆壁畫精美絕倫，妙筆生花，栩栩如生，畫麵上有身材高大、情態肅穆的帝王君主；有手捧貢品、端莊秀麗的天神玉女；有體形彪悍、麵目猙獰的天王力士；還有雙手合十、神情謙恭的寺廟僧侶。各種人物畫像高達9尺，高低錯落，左右顧盼，周圍襯以流雲仙氣，與閣內供奉的金身佛像有如眾星拱月，前後呼應，動靜相襯，生動地構成了一幅莊嚴的護法圖。這些壁畫，融合佛家和道家之精髓，構圖生動，筆法精煉，線條流暢，色澤豔麗，窮工極態，出神入化。