隆美爾希望在英軍坦克突破時，他能夠把裝甲部隊調去攔截而不消耗太多的燃油。至於步兵部隊的部署，他把每個意大利部隊都配置在一個德國部隊附近，通過這種強弱交替部署的方法，他就抽調出足夠的德軍預備隊。
人算不如天算，在阿拉曼戰役即將開始時，隆美爾被迫離開了戰場。因為他的病情急劇惡化，9月19日，他將指揮權交給施圖姆。9月23日，乘飛機飛往羅馬。
施圖姆雖然是個坦克專家，曾在蘇聯戰場上指揮過一個軍，但他不熟悉沙漠戰，更不熟悉“非洲軍團”。不過，施圖姆很謹慎，他沒有改變“非洲軍團”防禦部隊的部署，尤其是裝甲部隊的部署。
在“捷足”計劃中，蒙哥馬利想突破隆美爾的防線，逼“非洲軍團”打一場坦克戰。具體說來，他想讓英第30軍從北麵主攻德軍防線的中部偏右處，從那裏打通兩條走廊。英第10軍隨後通過兩條走廊後，在德軍補給線兩側的重要地帶構築陣地。他認為，到時候德軍裝甲部隊一定會向英第10軍構築的陣地發起進攻，他希望將德軍坦克消滅在那裏……
施圖姆也認為蒙哥馬利將主攻防線中部，但他仍把預備隊——第90輕裝甲師和的裏雅斯特師保留在隆美爾部署的海岸地區。
雖然蒙哥馬利不想在左翼主攻，但他仍想在左翼發動一次佯攻以策應英第30軍從北麵發動的主攻。從左翼的佯攻將由英第13軍對德軍南部防線的兩個地雷帶進行，佯攻的目的有兩個：盡量具有威脅性，阻止德軍在南麵的部隊向北轉移；若佯攻順利，英軍將通過防線缺口，擾亂德軍的後方。不過，蒙哥馬利規定英第13軍不準出現重大傷亡，尤其是第7裝甲師必須保存實力，以便在主攻的方向突破後用來擴大戰果。
後來，蒙哥馬利又提出了一個完全不符合常理的進攻計劃。蒙哥馬利在軍事會議上說：“人們公認的進攻原則是，進攻應該首先消滅敵軍的裝甲部隊，一旦消滅敵軍的裝甲部隊，敵軍的步兵部隊就容易對付了。我卻偏要先消滅敵軍的步兵部隊。”
在加紮拉戰役中，隆美爾在考德倫地區所采用的正是這種“粉碎性”戰術。隆美爾的“粉碎性”戰術是建立在精確計算的基礎上的。盡早組織坦克屏護隊是“粉碎性”戰術的關鍵。蒙哥馬利學會了這種戰術，並決定發展這種戰術。
蒙哥馬利主張，英軍先不打德軍的裝甲師，留到以後再打。他建議把一個坦克群作為屏護隊向前推進，去堵住德軍地雷場通道的西部出口，並用“粉碎性”作戰行動來蠶食德軍防禦區內的步兵部隊，以此逼德軍坦克與英軍坦克決戰。蒙哥馬利認為德軍不會坐視步兵部隊被英軍殲滅。蒙哥馬利想刺激德軍用分散配置的裝甲師來進行緊急的反攻。
蒙哥馬利指出，以英軍的絕對優勢兵力，非常適合執行粉碎性作戰行動。蒙哥馬利甚至主張在地雷區的通道排雷完畢以前，就派英第10軍通過通道。他還建議：如果到總攻那天拂曉，工兵和步兵部隊沒有把通道打通，那麼各裝甲師要自己想辦法打開通道，衝進開闊地帶。
丘吉爾為即將開始的進攻而擔心，他早在9月23日就給亞曆山大司令發了電報：“發明坦克就是為了在敵軍火力的威脅下幫助步兵部隊打開通道。現在蒙哥馬利想用步兵為坦克開道，這個任務太艱巨了。”
英軍中的英籍將領們也反對蒙哥馬利的計劃，他們認為按照蒙哥馬利的計劃打，步兵部隊很可能無法完成任務，到時候裝甲部隊強行在地雷場上開道，那將帶來災難。
同樣，新西蘭師師長弗賴伯格、澳大利亞師師長莫斯黑德和南非師師長皮納爾也懷疑這個計劃。他們向第30軍軍長利斯報告說，他們都對坦克強行通過雷區缺乏信心。利斯將這一情況報告了蒙哥馬利。
蒙哥馬利不理睬這些人的反對意見，他認為部下們不好管理，對長官的命令提反對意見一向是沙漠部隊的壞習慣，在裝甲部隊中這種惡習更加明顯。
蒙哥馬利一向不準部下們隨便提反對意見，他相信一句諺語：“當人們對重大問題有疑問時，絕不能讓大多數人的意見占上風……在這種場合，大多數人的意見往往是錯誤的。”
10月6日，蒙哥馬利正式宣布廢除了第一個“捷足”計劃，修改後的“捷足”計劃作戰原則與原來大不相同。這個計劃就是在使德軍相信英軍的進攻方向在南部防線，並向南部防線增兵的同時，第8集團軍率先對德軍步兵部隊發動殲滅戰，並把德軍裝甲部隊拖住，使其無法前往救援，再用密集的裝甲部隊摧毀德軍裝甲部隊，將其徹底殲滅。
這個計劃是英軍沙漠戰術的大膽革新，蒙哥馬利改變了以前先用裝甲部隊擊敗敵軍的裝甲部隊，再殲滅暴露的敵軍步兵的傳統戰法，而把傳統戰法完全顛倒了。
這個計劃冒有很大的風險，一旦被德軍識破，戰局將很難控製，何況蒙哥馬利所運用的戰術正是隆美爾最擅長的“粉碎性”戰術！
蒙哥馬利認為，阿拉曼戰役能否取勝，關鍵就是不被隆美爾識破。為此，蒙哥馬利進行了代號為“伯特倫”的欺騙計劃。“伯特倫”計劃的主要目的，就是把準備從北麵發起進攻的部隊藏起來，不讓德軍發現，相應的，需要製造從南部防線進攻的假象。
10月15日，根據英國情報機關的報告，蒙哥馬利得知了“非洲軍團”的處境。這份報告說，德軍麵臨著的困難處境是無法想象的：食物隻夠吃3個星期，坦克的燃料隻夠用一個星期，運輸車輛、零件和彈藥都十分匱乏。兵力嚴重不足，在5萬名德軍和54000名意軍中，大多數是傷員。
另外，由於隆美爾向德國最高統師部抱怨軍需物資補給匱乏，以及表達了對非洲戰局的悲觀看法，致使希特勒十分不滿。希特勒認為隆美爾是個悲觀主義者，對隆美爾能否回來繼續統率“非洲軍團”表示疑慮，看來隆美爾已經失寵。
這份情報對英軍十分有利。然而，蒙哥馬利十分清楚阿拉曼“非洲軍團”的防禦體係，特別是幾十萬顆地雷鋪設的一係列雷區，使他顧慮重重。
在曠野沙漠，要讓擁有1000多輛坦克、1000多門大炮、幾千輛機動車、幾萬噸給養和81個步兵營的進攻部隊，通過視野廣闊的沙漠，而不被德軍發現，簡直太不可思議了。
每樣東西的偽裝和暴露，都事先經過了精心的策劃。蒙哥馬利下令用假車偽裝成坦克和其他車輛進行運動。
英軍在距離阿拉曼車站附近，偽裝了一個巨大的物資儲備場，從表麵上無法識破。另外，為了讓德軍相信威脅來自南部，早在9月27日，蒙哥馬利下令在南部鋪設了假輸油管道，修築了假油泵房、儲油罐和蓄水池。
一切做得十分隱秘，哪怕是最先進的德軍高空偵察機和高倍望遠鏡，也無法察覺出真假。這時，英軍情報機構的活動十分活躍，大力支援“伯特倫”計劃，故意露出一些假情報，以使德軍相信威脅來自南部。
10月21日，英軍的一切偽裝和欺騙手段都做好了，各種情況表明，德軍已經相信英軍將從阿拉曼防線以南發起進攻。
在此以前，英軍官兵們的休假和外出活動正常進行，以免露出馬腳，但在10月21日，蒙哥馬利下達命令，一切休假和外出活動都被禁止，所有離開部隊的人馬上回到部隊做好作戰準備。