到東漢末年，何進入宮誅宦官，宦官攜帝出逃，玉璽失蹤，後來孫堅攻入洛陽，得璽，複被袁術所奪，袁術得璽稱帝，兵敗而死，荊州刺史攜璽至許昌，曹操挾天子以令諸侯，傳國璽重歸漢室。
曹丕建魏篡漢，特意讓人在傳國玉璽肩部刻字‘大魏受漢傳國璽’，以證其非篡。
後司馬家又篡魏建亞，傳國璽歸亞。後趙石勒滅前趙，奪璽，於右側加刻‘天命石氏’四字。
可僅二十年，冉魏滅後趙，璽傳冉魏。
武悼天王冉憫以玉璽乞東晉救援，晉將以三百精騎連夜送回建康，傳國璽乃重歸晉朝司馬氏中，在此前，東晉立朝四十餘年，因沒有傳國璽，不被認為正統，稱為白板四十二年，得璽後，才被稱中原王朝正統。
此後，傳國璽曆經南朝宋齊梁陳四代，隋一統華夏，玉璽也收入隋宮。
楊廣被弑江都，蕭後攜璽遁逃漠北突厥，唐初李淵李世民父子無傳國璽，也隻得刻數方‘受命寶’，‘定命寶’等玉璽，聊以自慰。
直到貞觀四年，李靖率軍討伐突厥，將蕭後送歸中原，傳國璽乃歸於李唐。
唐末，群雄四起，朱溫廢唐帝，奪傳國璽建後梁，十六年後，李存勖滅後梁奪玉璽建後唐。
後唐末帝李從珂與皇太後自焚玄武樓，傳國玉璽失蹤。
後晉皇帝自製玉璽，受天明命，惟德允昌。
此後，後周朝也自製玉璽，內製國寶兩座，詔中書令馮道書寶文，其一以“皇帝承天受命之寶”為文，其一以“皇帝神寶”為文。
趙匡胤陳橋兵變，黃袍加身，受禪稱帝，傳此二寶，又製“大宋受命之寶“。至太宗，又別製“承天受命之寶“。
宋仁宗製“皇帝欽崇國祀之寶“。
直到宋哲宗時，有農夫耕田時發現傳國璽獻於朝廷，經十三位大學士多方考證，認定就是始皇帝所製傳國璽。
靖康元年，金兵破汴梁，徽欽二帝被掠，傳國璽被金國掠走，此後銷聲匿跡。
元朝忽必烈崩，傳國玉璽忽現於大都，叫賣於市，為權相伯顏搶購得到。後傳聞伯顏把蒙元收繳各國的曆代印璽統統磨平，分發給王公大臣刻製私人印章，有傳聞傳國玉璽也遭不測。
朱元璋南京稱帝，繼而北伐，徐達入漠北，窮追不舍，據說太祖給徐達一個重要任務，就是找到傳國玉璽，可都沒有找到。後來李文忠兩征漠北，俘虜了元後妃與諸王，得到了一些宋代元代的玉璽，卻仍沒找到傳國玉璽。
明孝宗時，有人進獻傳國玉璽，但證明是假的未采用。
皇太極滅蒙古林丹汗，其妻兒獻元朝傳國璽，但皇太極找人考證，才發現這根本不是秦傳國玉璽，而是當年漢朝命昭君出塞時賜給匈奴王的一顆羊脂玉璽而已，但皇太極仍對外宣稱他得到了傳國玉璽，並正式改國號為清。
朱以海手裏的這塊玉璽，並不是皇太極手裏那塊贗品，那塊其實在太子北伐滅虜後就得到了。
朱以海手裏這塊，是他在西巡的時候所得，說來也非常傳奇。
在漠北有一個牧羊人見一隻綿羊老用蹄子在地上刨土，他挖開後，發現下麵埋著一塊晶瑩碧透還鑲著黃金的玉璽，他將之獻給了黃金家族的外喀爾喀土謝圖汗。
土謝圖汗得到這塊玉璽後並沒有認出這就是真正的傳國玉璽，隻當一般玉璽收藏。
後來歸附大明，土謝圖汗送女和親，嫁給大明天子，賠嫁的嫁妝裏除了牛羊馬匹駱駝等，就還有一些珠寶金銀，這枚傳國玉璽就在其中。
朱以海在西域的時候，偶然在土謝圖汗的女兒薩仁的帳篷裏，看到了這枚玉璽，被薩仁當成一件學習書法的鎮紙。
一開始朱以海也不太相信這就是傳國玉璽，但後來越瞧越覺得像，找了許多人考證，最終確認這就是秦傳國玉璽，不僅那魚鳥篆字沒錯，而且是金鑲玉，特別是當年曹丕刻的大魏受漢傳國璽，後趙刻的天命石氏等字，也都有。
朱以海花了三年時間，確定了這是真正的秦傳國玉璽。
今天，在這個新皇的加冕大典上，他也正式將這枚有著無比意義的傳國玉璽，交到新皇手上。
失落三百多年的傳國玉璽，再次出現，還是在這樣的一個場合。
這對於中興的大明朝，對於受禪登基的新皇帝，無不都有著極大的意義，這可比一般的什麼祥瑞還要祥瑞萬倍。
東晉四十二年沒傳國璽，被稱為白板東晉，李世民即位初沒傳國璽，也被人稱為白板皇帝。
朱元璋一直想要從元朝手裏找到傳國玉璽，可惜始終沒能找到，大明十六帝相傳，二百八十餘年，這都是極大的遺憾。
而如今，新皇帝得太上皇朱以海退位禪讓，又得秦傳國玉璽。
這才是真正的受命於天，大明也必將既壽永昌。
整個奉天殿都爆炸般震撼了，看著皇帝將那枚金鑲玉傳國璽鄭重的送到新皇手裏，殿中所有臣子全都跪下了。
“吾皇萬歲萬歲萬萬歲！”
山呼萬歲，經久不息。
“日月山河永在，大明江山永在！”新皇雙手高捧傳國玉璽，激動的也是滿臉通紅。
朱以海握著新皇帝的手，“受命於天，既壽永昌！”