原來鐵木真在進攻金國時接到報信，知道紮合敢不叛亂，因此立刻回兵。
這時紮合敢不和他的四個兒子，五個孫子己率軍襲擊蒙古的營地。幸好蒙古在不兒罕山邊築好了城，在耶律楚材和沈白的指揮下，大部份牧民、老弱婦幼都及時躲進了城裏。同時下令，拿得動兵器的老人孩子，以及身體強壯的婦女全都上城來防守。
紮合敢不的人馬都是騎軍，沒有攻城的器具，平均還不足兩丈高的城牆就將凶悍的草原勇士擋住，也無計可施。隻能圍著城牆幹轉圈，然後向城上放箭。但城牆上都有擋箭的垛口，城上的守軍也以弓箭還擊，因此紮合敢不連攻了七八天， 也沒能攻入城去。
而這時鐵木真回援的先鋒人馬以經趕到，是由哲別和速不台率領的五千騎軍，雙方就在城下展開了大戰。
隨紮合敢不反叛的人馬並不多，一共隻有六千餘人，屈出律的哈喇契丹大軍還在阿勒坦山以西的地方，遠隔著數千裏。而紮合敢不的人馬連攻了七八天都攻不進城去，士氣早己消磨殆盡了，蒙古軍雖然是遠路而來，但是為了救援自己的親人，因此人人奮勇，加上哲別和速不台都是猛將，一陣猛衝，紮合敢不那裏是蒙古軍的對手，頓時被打得大敗，六千人馬隻剩不足兩千。連紮合敢不也身中三箭，差一點沒命了。而他的四個兒子中，兩個戰死，一個被擒，隻跑出來一個人。五個孫子更是三死二擒，一個都沒跑了。
劄合敢不這時也是年過六十的人了，身受重傷，又傷痛子孫傷亡，心裏自然是又氣又急，跑到翰爾罕河附近時，終於也支持不住，一命嗚呼了。而他唯一的兒子也被部下所殺，帶著他們父子的人頭去投降鐵木真。
等鐵木真率領大軍趕回營地時，紮合敢不的叛亂以經被基本平定下來。而這一次叛亂並未造戌大的傷亡，完全是蒙古修築的城牆起了關建性的作用，因此鐵朩真對提倡築城的耶律楚材大加讚賞，而許多先前對築城持反對意見的人也改變了態度。對耶律楚材也更加佩服了。同時也對鐵朩真主張將城牆加高到三丈，也都全力支持。
紮合敢不的叛亂雖然以經平定下來，但乃蠻王子屈出律依舊是一個重大的麻煩。但鐵木真也陷入了深深的兩難取舍中。連日來都聚集大將商議，但也沒有議論出一個結果來。
按說，鐵木真應該立刻出動大軍，去迎擊屈出律的哈喇契丹大軍，因為屈出律是昔曰乃蠻的王子，乃蠻汗位的唯一繼承人，雖然他為人粗暴，性格急燥，但在乃蠻人中還是有很大的號招力。如果放任不管，恐怕整個杭愛山以西的地方都會被屈出律重新奪回去。因此這一次不僅要打敗屈出律，最好還能夠滅掉哈喇契丹，徹底根除後患。
但乃蠻在大漠的最西端，從不兒罕山出發，到達乃蠻的駐地阿勒坦山至少要行軍一月之久，而哈喇契丹還在乃蠻以西，輻原之廣闊，據說不在蒙古草原之下，那麼一去一回，至少也要大半年的時間。現在蒙古以經和金國以經徹底撕破了臉，一但蒙古大軍去迎戰屈出律的大軍，金國知道以後，一定會出兵進犯草原，那麼到那時鐵木真連回兵都來不及。
因此主兒扯歹、哲別、速不台、忽必來等大將紛紛請令，要求由自己帶領一支人馬，去迎戰屈出律，鐵木真則繼續坐鎮不兒罕山的城中，準備迎擊金國的進攻。
但讓一員大將帶少許人馬出擊，並不足以滅掉整個哈喇契丹，最多隻能擊退屈出律，而等蒙古軍退了之後，屈出律又可以卷土重來。想要徹底滅掉哈喇契丹這樣的大國，蒙古必須出動大半人馬，而這樣龐大的兵力，雖然都是自己的老部下，但鐵木真仍然決不放心隨便交給那一個人來統帶，還是掌握在自己手中，才能夠放心。
就在十餘天以後，草原西邊傳來消息，屈出律率領著十萬哈喇契丹大軍，以經在攻打阿勒坦山了。顯然這時以經不能再猶豫不決，鐵木真聽從了耶律楚材的建議，先派哲別、速不台兩人先率領二萬蒙古軍，去阿勒坦山拒敵屈出律。然後又派人去打探金國和南宋的動靜，然後再做決定。
就這樣又等了兩個多月，哲別和速不台的人馬趕到阿勒坦山之後，立刻就穩定住了戰局。麵對著是自己五倍的大軍，哲別和速不台果然下令，將蒙古軍分為十支，分頭出擊，從四麵八方向哈喇契丹大軍發動了猛攻。屈出律一時間也被弄得手足無措，顧此失彼，也不知道蒙古軍到底發來了多少人馬，結果雙方連戰六場，蒙古軍五勝一敗，殺死了哈喇契丹軍兩萬多人。