大多數忍者的實踐知識可用“通感”或“意識”來代替。這種知識在常規教育體係或書本中找不到，所以忍術家族依賴口頭教學和一些有益的經驗來傳遞先輩的知識。
基於忍者遠不及有嚴格榮譽，禮儀準則的武士的高貴地位，忍者可以自由運用他們遺產中的自然主義。忍術哲學強調宇宙萬物相互聯係，同為一元。由於人們不能一眼看到整個世界，哲學解釋展現在人們眼前的無數的宇宙部分為“萬物”或每個事物都是獨立存在的。透視這個景象，所有事物都可歸類為陰、陽或肯定、否定。例：明暗、天地、男女、強弱、幹濕、分集以及無數兩極對。
陰陽分類法不隻是簡單的對立物組合，他給了忍者一種認知，使他們擺脫把事物分為對錯，好壞，公平與不公平的局限，他們認為相同質的不同現象相互關聯。對西方人有時接受甚至理解這種不嚴格的倫理或規律都是困難的。確實，這種伸縮性的概念和許多當代武術體係哲學理論相駁。忍者的生活觀著重整個畫麵，不斷變化的結果重於實現的方式。
忍者最重要的政治貢獻是維持社會的平衡和協調。如果勇敢的千軍萬馬的衝鋒是戰爭的正麵，那秘密截獲敵電或抓獲敵長官本人就是戰爭的一個否定或和緩、協調。敵人稱做為“欺騙、膽小、變節”忍者則稱之為“策略、狡猾、機智。”
忍者學習運用忍術的根本目的不僅是為了獲得登峰造極的暴力和毀滅手段，而且要培養個人同周圍環境的協調，從而產生一種使生來具有道德 人類知道並跟隨這種穿越宇宙總綱行動的直覺。
忍術，又名隱術，即隱身術。日本十七世紀的日本幕府時代，隨著日本宮廷追捕，武術階級勢力的上升及間諜工作的需要，出現了越來越多的忍術高手——“忍者”，忍術也日漸盛行，德川幕府時發展到頂峰。但長期以來，忍術僅為忍者家族世代秘傳，外界則很難知其詳貌。忍術強調精神上的修煉，並將其整個的訓練體係，建立在超乎想象的精神修煉基礎上，可以說，強大的精神力量，是忍術之所以無堅不摧的真正原因。
在戰國時代，忍術得到了進一步的發展，並且形成了很多的派別。其中以伊賀與甲賀兩地為本。其它的有青森中川流、山形羽黑流、新瀉上杉流、加治流、長野甲陽流、芥川流等。這是一個非常需要忍術的時代。忍者的生命不屬於自己，而是屬於他們的主人，或者某個組織。為了主人他們可以隨時作出犧牲。對他們而言，生命的意義隻在於那刺殺的一瞬，就像櫻花一樣，綻開最絢麗的時候也是它凋謝的時候，這也是日本民族心底深處對於"死"的詮釋。因此忍者的身份地位雖然有待爭議甚至有人認為其身份地位並不高，卻依然是日本文化中一個非常重要的組成部分。
戰國時代中，雖然同為大名服務，不過忍者和武士的身份分別可謂是台前和幕後，誇張的一些甚至是天上地下如忍者是家奴武士是家臣，但其實也要看具體情況而定。由於忍者們幹的大都是涉及到上層權力爭鬥的秘密事件，而且危險性相當大，因此他們當中很多人的結局往往十分可悲。危險首先來自雇主。這些陰險毒辣的社會頭麵人物在不擇手段達到自己的目的後，怕事情內幕泄露，會將執行任務的忍者殺死滅口。
忍者最可怕的敵人是武士。武士在明處，忍者在暗處，防不勝防，故武士最憎恨忍者，忍者一旦被武士捕獲，必然受到最殘酷的刑罰處死。活剝皮就是酷刑的一種，皮膚被一片片剝下來，極其痛苦，而又不能立即死掉。所以忍者是絕對不肯讓武士活捉的。以前一位最富有傳奇性的忍者的遭遇便驗證了這個一點。這位忍者名叫猿飛，因為他有象猿猴一樣在樹上攀援飛躍的本領，來去無蹤；同時他徒手格鬥的武功也很好，人們根本無法捕捉他。有一次他被派去偵察住在某城堡中的一個將軍，偷聽到將軍和一位大臣的密談。可當他離開城堡時被守衛發現，他立即躍上城牆，巧妙地避開了追趕的人，但當他跳落花園時，踩上了一隻暗設的捕熊鋼夾，將他的腿緊緊夾住。這時將軍手下的衛士圍了上來，猿飛見狀，一刀將夾住的腿砍斷，單腳逃了很長一段距離。可終因失血過多，難以支持。猿飛見衛士越來越近，知道自己沒有希望逃脫，便索性站定、大聲辱罵了追趕他的衛士，用劍毀掉自己的麵容，使人無法辨認，然後揮劍砍斷自己的的脖子。一個聞名遐邇的忍者就這樣可悲地結束了自己的一生。