科舉製度在多年的施行後，得到進一步的完善。大量的官學辦起來，因官學收費低廉，寒門子弟基本都可以入學，這也使得民間識字人口大幅地增長，一批飽學之士有機會通過科舉被朝廷選拔，“朝為田舍郎，暮登子堂”成為許多讀書人相互激勵的話語。
隻是到了這年，李世民的身體每況愈下。
貞觀二十五年三月後，李世民的病情進一步加重，已經無法起身，長孫皇後也整日服侍在身邊，寸步不離，為李世民端水送藥，太子李承乾也日夜守護在李世民前麵，責令太醫署的太醫們一定要醫治好皇帝的病。孫思邈也多次被召進宮，隻是李世民已經病入膏肓，太醫們束手無策，孫思邈也是一籌莫展。
在拖延了兩個月後，李世民病情急劇惡化，五月十九日，這位打造了強盛大唐帝國的一代名君在避暑地翠微宮含風殿去逝，享受五十三歲。
因李世民在位的這二十五年，大唐國力空前的強大，人口大幅度地增長，農業、商業迅速發展，國庫殷實，百姓富足，對外戰爭無往不勝，四夷臣服，被一些好學之士冠之以貞“貞觀盛世，”並稱之貞觀盛世比之漢時候的“文景之治，”不知要強上幾倍。
李世民在臨終前擬遺詔，以國事托付李世績和李業詡，令其輔佐太子李承乾，以李世績為尚書左仆射，太子太師，同中書門下三品，以李業詡為兵部尚書兼領檢校吏部尚書，太子太傅，並同中書門下三品，以太子左庶子於誌寧為侍中，檢校刑部尚書高季甫為中書令，張行成為兼侍中。
李世民駕崩七日後，太子率群臣護送著李世民的靈柩返回長安。
貞觀二十五年五月二十八日，百官聚集在太極殿內，朝廷正式發布了李世民的喪告，李世績當著百官的麵宣讀了李世民的遺詔，太子李承乾即位，軍國大事，不可停闕；平常細務，委之有司。
李世民病逝的消息傳出後，一時間，舉國皆哀，大量的官宦和百姓知道皇帝駕崩的消息後，都忍不住痛哭失聲。
對老百姓而言，能給他們帶來安樂生活的皇帝，那就是好皇帝，好皇帝死了，自是感覺到悲痛的，他們唯一擔心的是，繼位皇帝會不會延續貞觀遺風。
六月初一，李承乾在太極宮正式繼位，成為大唐的第三位皇帝，並宣布大赦下，罷諸地兵事。
李承乾即位後，立長子李象為太子，以李績為尚書左仆射，開府儀同三司，同中書門下三品，太子太師，兼檢校中書令；李業詡為檢校尚書右仆射，兼領兵部尚書、檢校吏部尚書，開府儀同三司，同中書門下三品，太子太傅；於誌寧為侍中，兼太子少師，高季甫為中書令，兼太子少保，張行成為兼侍中並領太子少傅職，高士廉子高履行為戶部尚書並守禮部尚書職，召回李道宗任禮部尚書職，侯君集也被複起，領檢校刑部尚書職，軍器監大匠閻立德為工部尚書，宇文節為黃門侍郎，柳奭為中書侍郎，參預朝政，蘇定芳為大唐軍事學院祭酒，閻立本為軍器監大匠。
李世績因避李世民的諱，在李世民去逝後，改名為李績。
一大通的官員任命下來，諸部的主官都已經到位。雖然李世民在去逝給大唐帶來了不的震動，但因有眾官員兢兢業業忠於職守地行使著他們的使命，大唐的國家機器還是照樣在有序地運轉著。
八月底，在停靈三個月後，李世民正式下葬於昭陵，諡號文武大聖，廟號太宗，阿史那社爾、契苾何力等歸附的胡將請求自殺殉葬，李承乾以李世民遺詔示，不允，隻是命人刻這些歸附的胡將雕像，列於昭陵北司馬門兩側!
李世民去逝後，晉州發生地震，死五千人，長安自五月開始後，持續了三個月的連綿陰雨，直到李世民下葬後，才放晴!
大地為之震動，山河嗚咽!
長孫皇後因李世民的去逝，飽受打擊，身體日漸差，並拒絕服藥，也終於在同一年的十一月於立政殿去逝，剛剛即位的李承乾再次大赦下，將其母親封諡號為“文德皇後”，與李世民一道葬於昭陵。
第二年，李承乾發布詔令，改年號為永貞，以示永續貞觀之道之意。
南方諸軍在因李世民去逝罷兵事一年後，繼續掃蕩那些反叛的部落，滅驃國、彌國、直塘、羅穀哥等國，並將其國王掠回長安，李承乾下詔，在新置地上設立州縣，派官員治理，中南半島大部地方都歸於大唐治下。
同年，兵部發布了多部由尚書李業詡製定的軍中製度，包括武將的任職，解職，輪換及征兵，戰時動員，退役，後勤保障，武器研製，裝備軍隊等等一係列的條例，因這些製度的施行，大唐軍隊進一步朝著正規化的方向發展，軍中將領不得幹涉地方事務，地方官員不得插手軍務，使得軍政得到分離，皇帝通過兵部更有效地掌管軍隊。
李業詡的兒子李征和李衡也進入大唐軍事學院學習。
永貞二年，因遭到阿拉伯大食的攻擊，波斯王子俾路斯來到長安，請求內附，希望得到強盛的大唐的保護。
李承乾接受了俾路斯內附的請示，下詔在原波斯地設置波斯大都督府，歸於安西大都護府治下，以時任特衛將軍的席君賣為波斯撫慰使，並領波斯都督府大都督職，率軍隊兩萬五千人，進入波斯境內，以抗大食人的入侵，大食人迫於大唐軍隊的介入，暫時不敢東進，往西撤退。
永貞三年初，時任安東大都督府大都督的薛仁貴奉命出征平定東北方向契丹、靺鞨、室韋人的叛亂，五萬大唐軍隊所向披靡，契丹、靺鞨、室韋先後臣服，第二年，李承乾下發詔令，在其是設置渤海都督府、黑水都督府、室韋都督府，歸於安東大都護府治下，我大軍進駐所有新置的都督府，重要官員皆由我漢人及歸降的胡人一道擔任。