在重用高允之後，文成帝統治下的北魏朝廷基本處於較為穩定的發展狀態，社會矛盾相對緩和。文成帝不因民族原因而分親疏，比如高允便是漢族出身，卻獲重用。在文成帝的帶動下，朝廷眾臣也與漢人逐漸和睦相處了。這一切馮氏看在眼裏，心中對文成帝的敬佩之情與日俱增，兩人的感情也是越來越好。同時，文成帝的這個治國特點也對馮氏在後來當政期間吸收漢法、重用漢人、推行漢化的措施產生了很明顯的影響，這也是北魏能夠有一段穩定時期的重要原因之一。
太安二年（456年），馮氏被立為皇後，當時她隻有十四歲。雖然年齡尚幼，但其聰明才智以及端莊的禮儀風範已經深得文成帝與朝廷眾臣的認可。
從死囚的女兒到宮女，後來到了貴人，最後再到皇後，馮氏的命運可謂是向著越來越好的方向發展。她十分感謝這種命運的轉折，因此十分珍惜自己現在所處的位置。她盡心盡力地處理著後宮的大小事務，同時一有機會便對朝廷之事給予一定的關心。雖然有幹政之嫌，但她的意圖是好的，文成帝也樂於擁有這個得力的助手，因此也便聽之任之了。
太安四年（458年），拓跋弘被立為太子。拓跋弘是文成帝與李氏所生之子。李氏因長得貌美，被拓跋濬帶入宮中封為貴人，並且為其生得一子，取名拓跋弘。北魏有條古怪的規矩，如果太子是後宮嬪妃所生，生母便要被賜死，以防母憑子貴，專權於朝廷。於是，李氏便已經確定了其難逃一死的命運。臨終前她心中掛念著許多人，尤其是自己的親生兒子拓跋弘。但她或許未料到，雖然開始時馮氏跟拓跋弘相處甚好，但數年後，馮氏卻與其成了仇敵，並且最終將其子殺死。這大概是李氏萬萬料想不到的了。不過這一切都源自於北魏如此古怪的一個規矩，有百害卻未必有利，難怪其他朝代無人用過。可歎李氏早亡，更歎後來的朝廷因此多了一些動蕩與不安。
作為皇後的馮氏的生活是無風無浪的，但她的丈夫拓跋濬則要不斷地出征，回到朝廷還要處理軍國大事，整日辛苦勞累。此時的馮氏擁有著女性特有的溫柔，她不斷地化解著文成帝的苦悶，往往讓文成帝忘掉勞苦，感受一段溫馨的時光。試想，如果一個男人能夠得到這樣的妻子，他的一生又會有什麼遺憾呢？
然而，意想不到的不幸還是到來了。而這一切，又一次改變了馮氏的生活，從而也將她推到了國家的風口浪尖上。和平六年（465年），年僅二十六歲的文成帝在北魏國都平城病故。一個如此的好皇帝去世，全國臣民皆陷於沉痛的悼念之中。
北魏有一慣例，國喪三天後要燒毀死者生前所用的衣服器物，群臣與後宮嬪妃皆要大哭來表示對死者的尊重與哀悼。當熊熊大火點燃之後，哭得如淚人一般的馮氏忽然撲向了大火，欲去追隨自己心愛的丈夫與其共赴黃泉。周圍諸人大吃一驚，立即對她施救。當她被救出來時已經昏厥，經過搶救才保得一命。
馮氏為了跟心愛的人在一起不惜撲向熊熊烈火，其愛情令人敬佩。若就此去了，北魏倒少了一段後來的風雲史，還好搶救及時，馮氏終於還是留在了世上。
當她醒過來後，回想著自己的命運又一次遭受了沉重的打擊，心中悲痛不已。但不久以後，她便重新振作了起來。她認為，或許這是上天對她的又一次考驗，如果能夠克服困難，說不定將來會有更重要的任務由她來做。於是，她堅毅的雙眼望向了前方。而這種毅然，卻正是她改變北魏曆史的一種預兆。
奪權弑帝
文成帝去世的第二天，十二歲的太子拓跋弘繼位，即北魏獻文帝。馮後便成為皇太後，即文明太後。
皇帝年幼，而太後也隻是一年齡不大的女人，侍中、車騎大將軍乙渾便盜用獻文帝的詔令犯上作亂，開始誅殺異己，連續殺了許多朝臣後，直接開始威脅獻文帝的皇帝之位。
充滿混亂與危機的局麵又一次出現了！馮太後雖然從小便已經習慣了這種殺戮紛爭，但如此親身經曆危在旦夕的境況還是第一次，她心中還是有些害怕，便讓獻文帝應允叛黨乙渾的要求，封他為太尉，後又封其為丞相。可是乙渾如此得意，豈能就此罷手？他準備繼續發動政變，以期一舉奪取帝位。
馮太後見局勢危急，便冷靜地對情況進行了分析，憑著她多年在宮中的磨礪與經驗，加上她個人的智慧，她開始果斷而周密地進行了部署。她命令拓跋丕、源賀、牛益得等人率領軍隊，秘密地前往乙渾府中。乙渾正為無人能夠與自己抗衡而得意，哪裏會料到朝廷會突然對他動手？於是誅殺乙渾的計劃一舉成功！這是馮太後第一次在朝中顯示了自己非凡的才能與果敢的膽識。接下來，她為避免朝廷再度出現危機，宣布臨朝聽政，由她處理一切事務；同時將中書令高允、中書侍郎高閭和賈秀叫到宮中，協助她處理政務。