注意與傳染性胃腸炎、流行性腹瀉、輪狀病毒感染、仔豬黃、白痢等相鑒別。
確診可取病豬腸內容物，適當處理後給小鼠靜脈接種，同時設抗血清中和對照。
本病發生後療效不佳，主要靠平時的預防。
嚴格產房及豬體消毒工作，加強飼養管理，搞好預防保健。
免疫接種：滅活疫苗，第一、二胎妊娠母豬於分娩前四周及二周各接種一次疫苗，以使仔豬出生後吸吮母乳獲取較多的母源抗體。
必要時可用抗菌藥物對剛出生仔豬口服，每日2~3次，恩諾沙星、土黴素、微生態製劑等，作為緊急的藥物預防。
•鑒別診斷
①與仔豬黃痢的鑒別
二者均有精神沉鬱，體溫升高，食欲不振，腹瀉等臨床症狀。
但二者的區別在於：
仔豬黃痢的病原致病性大腸杆菌。
仔豬黃痢表現為腹瀉的糞便呈黃色，而仔豬紅痢腹瀉便一般為紅褐色；
仔豬黃痢表現為生後12小時突然有1~2頭發病，以後相繼發生腹瀉。
病變部位主要在十二指腸、空腸，腸壁變薄，嚴重的呈透明狀。
胃黏膜可見紅色出血斑。
仔豬紅痢一般在胃和十二指腸不見病變，空腸可見出血、呈暗紅色；
仔豬黃痢腸內容物多為黃色，而仔豬紅痢多為紅褐色。
細菌分離鑒定，仔豬黃痢可從糞便和腸內容物中分離到致病性大腸杆菌。
②與仔豬白痢的鑒別
二者均有精神沉鬱，體溫升高，食欲不振，腹瀉等臨床症狀。
但二者的區別在於：
仔豬白痢的病原為致病性大腸杆菌，主要以10~30日齡多發，以20日齡左右最常見。
病豬糞便的顏色為乳白色，有特異腥臭味。
剖檢病變主要在胃和小腸的前部，腸壁菲薄透明，不見出血表現。
細菌分離鑒定可見致病性大腸杆菌。
③與豬傳染性胃腸炎的鑒別
二者均有精神沉鬱，體溫升高，食欲不振，腹瀉等臨床症狀。
但二者的區別在於：
豬傳染性胃腸炎的病原為豬傳染性胃腸炎病毒，主要多發於冬、春寒冷季節，從出生的仔豬到成年豬均可發病。
仔豬紅痢主要是7日齡以內的仔豬，尤其以1~3日齡的發病更為嚴重。
傳染性胃腸炎有部分豬隻出現嘔吐，而仔豬紅痢不見嘔吐。
傳染性胃腸炎腹瀉糞便呈水樣，糞便黃色、綠色或白色，不見血樣便，偶見胃黏膜出血點，或胃底潮紅，胃黏膜潰瘍，十二指腸、空腸小腸段腸壁變薄透明。
抗生素、磺胺類藥物治療無效。
實驗室診斷可以通過直接免疫熒光、酶聯免疫吸附試驗等方法確診。
④與豬流行性腹瀉的鑒別
二者均有精神沉鬱，體溫升高，食欲不振，腹瀉等臨床症狀。
但二者的區別在於：
豬流行性腹瀉的病原為豬流行性腹瀉病毒，主要多發於冬、春寒冷季節，從出生的仔豬到成年豬均可發病。
仔豬紅痢主要是7日齡以內的仔豬，尤其以1~3日齡的發病更為嚴重。
流行性腹瀉有部分豬隻出現嘔吐，而仔豬紅痢不見嘔吐。
流行性腹瀉糞便呈水樣，糞便灰黃色、灰白色，不見血樣便，偶見胃黏膜出血點，胃黏膜潰瘍，十二指腸、空腸小腸段腸壁變薄透明。
抗生素、磺胺類藥物治療無效。
實驗室診斷可以通過直接免疫熒光、酶聯免疫吸附試驗等方法確診。
⑤與豬偽狂犬病的鑒別
二者均有精神沉鬱，體溫升高，食欲不振，腹瀉等臨床症狀。
但二者的區別在於：
豬偽狂犬病的病原為豬偽狂犬病病毒。
病豬體溫升高達41~41.5℃，發病後有嘔吐，同時表現出神經症狀，遇到聲音的刺激興奮尖叫，步態不穩，肌肉痙攣，角弓反張等。
同群或同場的懷孕母豬出現流產、死胎、木乃伊胎兒等症狀。
剖檢可見鼻出血性或化膿性炎症，肺水腫，胃底部大麵積出血，小腸黏膜充血。
抗生素、磺胺類藥物治療無效。