當初王直沒名沒份地就進了京，因此他在北京城為所欲為都隻是胡鬧，他控製了京城各衙門大小官員的性命，卻沒法發揮各大小衙門的權力，以至於北京城在他手中成了一部癱瘓的機器。
成熟的文官政治就是如此，你要想充分地發揮它的力量，就得依足了它的規則來辦事。既有規矩，便有約束，盡管李彥直已與徐階裏應外合，一將一相，又得到了朱載垕的充分信任，名分與權勢都很足了，可辦起事情來還是得考慮到各方麵的反應。
蔣逸凡擬那個條陳隻花了不到半個時辰，經過李彥直與徐階的兩輪修改，然後內閣呈上，朱載垕命掌印太監蓋印發回來，跟著兵部、戶部、禮部三部複議，同時發了邸報，由朝廷大臣公論。
幾個來回下來，三天就過去了。
東海的事情雖急，可李彥直也沒辦法。你要享受中央集權政府的好處，就得忍受它的壞處！心急或者蠻幹隻會讓事情適得其反！在大明，無論是皇帝還是首輔都沒法獨裁專斷，更別說李彥直了。這些國家大事，並非李彥直說一句好，徐階支持，朱載垕讚成就能馬上執行的。
複議和公論的這三天裏，有大臣上書讚成的，也有大臣上書反對的，最後徐階才召集內閣大臣，並吏部、兵部、戶部、禮部尚書侍郎，以及督察院左都禦史，兵科給事中、戶科給事中等，以及這幾日裏上書的臣工裏言之有物者，在朱載垕麵前廷議。
這時兵部、戶部、都察院都和徐階、李彥直同心，吏部尚書李默也算識時務，何況派李彥直南下平寇，卻也是人盡其才！最後徐階強勢拍板，這事就這麼定了！
按大明兵製，軍隊係統設有兵部以下和五軍都督府，兵部與五軍都督府都聽命於皇帝，五軍都督府有統兵權而無調兵權，兵部擁有調兵權而無統兵權，兩大部門相互節製又互不統屬。
此次廷議乃是決定在五軍都督府之外再設立權海軍都督府——在都督府前麵再加一個“權”字，那實在還是有些底氣不足。五軍都督府有左右都督，都是正一品銜，都督同知為從一品。這海軍都督府衙門的最高長官則隻是從一品，比五軍都督府左右都督矮了半級。
雖然在議定開府之前，群臣就已經知道這個海軍都督是要讓李彥直做的，這時卻還是按規矩來，經過一輪廷推，最後才把李彥直給推了出來，由魏國公徐鵬舉在京為左都督，李彥直出外為右都督，統領南北海軍，迎聖剿匪期間，轄天津、上海、金州、威海、平壤、濟州、寧波、琉球、澎湖、南海等十衛，主管上海、寧波、泉州三市舶司，籌組南北海軍，一切海關事務、海外事務，許便宜行事。
除軍職之外，李彥直又領右都禦使銜，負責清點南直隸（今江蘇安徽）以及浙江、福建、江西三省商稅。都禦史為監察部門首腦，一出京城那就是欽差大人了。原來新任戶部尚書方鈍怕市舶司“那點”收入沒法支撐李彥直的建軍、養軍費用，因此建議把南直隸以及南方三省的商稅也都輸往海軍都督衙門，供李彥直使用！
明朝的商稅，輕得讓後人沒法相信！整個大明帝國的商業稅收常例不過十幾萬兩！所以南直隸加上浙閩贛三省的那“幾萬兩銀子”的商稅方鈍說要輸往海軍都督府衙門做建軍之用，不但內閣沒有反對，就連言官們也沒多大的意見！
李彥直受命之後便第一時間趕到天津，開衙點將，並過問所轄諸衛所的近況，諸衛所都報平安，內中卻有金州衛道：“近來似有倭寇犯境，駐紮在長生島一帶。” 這句話他本來不想說，但聽說這個新任的都督精通海情，又即將出海，恐怕這事瞞不過，就隻好先報上了。
李彥直眉頭一皺，怒道：“倭寇犯境，有就是有，沒有就是沒有！什麼叫似有！”