本年正月初三日醜時，各營官兵進攻本城，至黎明始止，死傷多少，……似不及二十五日之多。
初四日……經理令步兵先退……李如梅、楊登山、擺賽等馬兵，自領為殿，賊不敢追躡。路遇傷兵，令給標馬載來，各營官兵別無損傷。
但據本國別將韓明璉說稱：箭灘堵截，官兵與賊交鋒，殺傷相當，該被殺傷之數，亦不得的知。
臣(李德馨)回到安康，訪問得先後陣亡官兵，共該八百餘員名，被傷官兵，共該三千餘員名。其後到安東路上，多見被傷官兵，因傷物故，該數想過一千餘員名。官兵死傷之數，大約如此……(《朝鮮李朝宣祖實錄》)
綜合各種相關史料，整個戰役明軍陣亡約五千人，朝鮮軍陣亡一千餘人。
明軍歿於此役的將官極多，遊擊楊萬金中丸身亡。遊擊陳寅、陳愚聞身受重傷。千總麻來、李洞賓、郭安民、周道繼、王子和、錢應太，以及哨總湯文瓚、真定營中張應元、陳觀策等十多位軍官陣亡。
至於日本人的損失，絕對超過明軍。加藤清正所部一萬六七千餘人，戰到最後，隻剩下六千餘人。其中戰死、病死、餓死高達一萬人。加藤清正雖然保住了島山城，但所部傷亡殆盡，幾乎失去戰鬥力。
所以，蔚山之役並非大敗，隻是加藤清正趁雨天反攻，令明軍進攻失利。朝鮮對此雖有惋惜，但也沒有歸罪於楊鎬。
5.拯救大兵楊鎬
楊鎬兵敗之後，退到慶州，每日精神恍惚，悔恨、苦澀、羞恥，嚐盡了敗軍之將所有的滋味。
更令楊鎬發瘋的事還在後頭。
正月二十三日，島山戰後半個月，吳惟忠抓到一個日軍細作。楊鎬拿來仔細審問，細作說：“前日倭賊援救島山之兵並非真正的倭子，隻是數千朝鮮人，協同數百倭子，多樹旗幟，虛張聲勢。而船上的倭子，大船所載隻有五六個，其餘的都是高麗人。”
楊鎬簡直不敢相信自己的耳朵，又反複審訊了好幾回，最後罵道：“高麗可惡。”楊鎬心有不甘，對寧國胤說：“我準備今天催促各營，再攻島山。”
寧國胤和所有人一樣，清醒得很，如今人困馬乏，怎麼可以再戰呢？
楊鎬失去理智，吼叫道：“將官沒有一個人了，連你也這麼說？”
麻貴畢竟久經沙場，目前最急迫的是趕緊分派兵馬駐防各個要地，以遏止日軍乘勝襲擊。於是，他於二月初三下令：副總兵李芳春、遊擊牛伯英、盧得功，各率原部兵馬，駐屯安東；遊擊葉邦榮駐守龍宮；總兵吳惟忠駐守忠州；遊擊陳愚聞駐屯水原；遊擊藍芳威分住稷山；參將李寧守公州；遊擊董正誼、柴登科、秦得貴駐防全州；遊擊擺賽駐守安城。遊擊季金率原部兵馬回營，另聽調遣，等藍芳威、李寧、擺賽兵到，才能歸營。
二月初八，麻貴回到王京。八天後，楊鎬也回到王京。
朝鮮國王李昖親自到銅雀江頭慰勞，世子光海君李琿也派遣李尚信問安。傍晚，楊鎬行經銅雀江。此時的楊鎬萬分羞愧，無臉去見李昖。他對隨從說：“我穿著素服而去，不適宜相見。”李昖再派人去請楊鎬，楊鎬還是拒絕會麵，李昖隻得回宮。
楊鎬回到王京之後，怕朝廷問罪，與經略邢玠上疏明神宗，隱去島山潰敗，謊報取得蔚山大捷，不料很快東窗事發。
島山之戰時，遊擊陳寅、周升得罪了楊鎬，被楊鎬重責，於是陳、周二人懷恨在心，便向軍門主事丁應泰彙報：“島山之戰，遺棄軍資、糧草、器械不可勝數，士卒死者甚眾。楊鎬把軍中雜役、買賣的人拿來充數，以補缺失亡人員。又私吞糧草、軍餉，不分給各營，導致軍馬斷糧一個月。”
丁應泰眼睛一亮，原來楊鎬還有這些齷齪事。之前沈惟敬在平壤被捕時，丁應泰同蕭應宮相互勾結，一起寫信要求楊鎬袒護沈惟敬；朝中趙誌皋和石星也親筆書信，要楊鎬救沈惟敬一命，但都被楊鎬嚴詞拒絕。丁應泰懷恨在心，一心要致楊鎬於死地，決定參他一本。
於是，丁應泰假裝不知情，跑去問楊鎬：“島山慘敗，應如何善後？”
楊鎬一言不發，從袖中抖出內閣兩大輔臣張位、沈一貫的親筆信，還有張位票擬①未下的聖旨，若無其事地展現在丁應泰麵前。票簽上寫著：
島山之戰，盛推經理功多，閣老欲為奧援，俾得褒寵。
朝中有如此強硬的台柱，楊鎬可謂安如泰山了。
丁應泰既忌且恨，本來隻想釣一條小魚，沒想到竟拖出兩條大魚。既然都上鉤了，那就一鍋兒煮吧。
丁應泰一回去，就馬上擬定參劾楊鎬等人的奏章，大意寫道：