成吉思汗率領軍隊回到了居庸關，駐紮了下來。那年已經是1212年春天了。也就是元太祖六年。蒙古大軍在居庸關駐紮幾十天，因為天氣已經進入盛夏時節，由於長期征戰，水土不服，難免人馬疲乏，成吉思汗就留下部分軍隊把守關口，自己帶領著三個兒子以及其他將領回到國內，等待時機，再起兵進攻。至此，成吉思汗第一次攻打金國的戰爭宣告結束，這一次可謂戰果累累，不僅掠取了大批財物，而且從金國各地搶走了戰馬幾百萬匹，使金國重建騎兵隊伍的可能化為泡影。
當時，蒙古軍隊誌在擄掠，每攻占一座城市後，並不留兵鎮守，搶掠一番就放棄了，因此無論是西京、東京以及昌、桓、撫等地，蒙古軍撤走後，又先後被金軍奪回了。
1212年秋，成吉思汗再次率兵向金朝進攻。這次進攻的目標是得而複失的西京城。出兵之前，成吉思汗召集將領及其智囊團開會，對出兵路線有兩種意見：一派認為集中兵力圍困金朝的都城中都，然後進行強攻，決心把中都攻下來。另一派人認為，先留下中都不圍，也不打，而攻其兩翼，以分散消耗其全國的兵力，為以後進攻中都創造有利條件。成吉思汗采用了第二種意見，他對群臣道：“現在還不是滅亡金國的時候。”因為他從第一次攻金戰爭中，已經得到了一條經驗，不必去占領金國的城市和土地，隻需大量地掠取財物和人口，把這個中原大國一次次地掏空，直至無力抵抗，隻有束手就擒。
成吉思汗無疑做出了一個明智的選擇，因為他很清楚，如果此時貿然和金國決一死戰，最好的結果也不過是兩敗俱傷！所以他選擇了一步步地蠶食金國的策略。
成吉思汗親率蒙古大軍，越過陰山山脈，一路打去，再次攻進桓、昌、撫各州縣，再次包圍西京。長子術赤兩次請求攻城，均遭成吉思汗的訓斥，當著眾將的麵教育他道：“用兵打仗，要靠謀略，不能仗著血氣之勇，去硬拚兵力。”說完之後，成吉思汗隻留一部分兵力圍城，仍然是圍而不打，卻把主力埋伏於西京東北方向的一座被稱為密穀山的山林中。果然，在西京被蒙古軍隊包圍之後，金國元帥左都監奧屯襄帶領兩萬人馬前來援助西京，恰好經過密穀山口。
成吉思汗一聲令下，他的四萬騎兵如神兵天將一般，自山林中衝出來，把奧屯襄的兩萬人馬團團圍住，經過不到一個時辰的拚殺，將這支援軍全部殲滅，僅奧屯襄帶數十人逃出，回到中都去了。在將領們紛紛提出攻城的請求之後，成吉思汗才開始命令軍隊攻城，可是麵對高大而堅固的城牆，蒙古軍中又缺乏攻城的器械，金左副元帥兼西京留守抹撚盡忠率軍堅守，蒙古軍隊一時無法攻下。成吉思汗正在城下督戰，反被流矢射中左臂，由於成吉思汗受傷，蒙古軍未再深入，撤回陰山附近駐守。二次伐金戰爭就此草草結束。
金主完顏永濟以抹撚盡忠保衛西京有功，進官三階，賜金百兩、銀千兩，進拜尚書右丞，行省西京。
招降納叛
成吉思汗當然知道金國國力強大，絕非一朝一夕可以製伏的，所以也不著急進攻，而是逐步殘破，待到金朝內憂外患、無法自拔之時就不攻自破了。果然成吉思汗的連續進攻，導致了金朝內外矛盾的迅速激化。首先，女真統治者與契丹、漢族地主階級的矛盾進一步激化，大量契丹、漢族將領和地主階級代表人物叛金降蒙，其中包括郭寶玉、石天應、史秉直和史天澤父子、劉伯林、夾穀長哥、移剌捏兒等，這些人後來都成為蒙古的重臣和將帥。早在野狐嶺之戰後，金軍統帥派去質問成吉思汗的使者石抹明安就投降了蒙古，成吉思汗問他為什麼投降，他回答道：“臣素有歸誌。”契丹族與女真族的矛盾在第一次伐金戰爭中就暴露無遺了。成吉思汗放手任用契丹降將，立即讓他們領蒙古軍，撫定雲中東西兩路。
郭寶玉是華州鄭縣人，唐朝名將郭子儀的後裔。他雖身為金朝“汾陽郡公，兼猛安”，但對金人並不真心擁護，時刻希望“天改姓”。野狐嶺之戰後，木華黎率軍追擊金軍，郭寶玉率全軍降蒙。當成吉思汗向他詢問取中原之策時，郭寶玉道：“中原勢大，不可忽也。西南諸蕃勇悍可用，宜先取之，借以圖金，必得誌焉。”建議成吉思汗先征服西南地區，再征服中原。正是根據他的建議，成吉思汗“頒條畫五章”，對蒙古征服漢地起了重大作用。
石天應是永德縣（遼寧錦縣西北）人，“善騎射，頗知書”，一向是地方領袖。他住在永德縣所隸屬的“興中府”（府城是今天的遼寧朝陽）。木華黎從中都派了一個代表進城來勸降。這個代表被金朝的興中府同知兀裏卜殺了，城裏的老百姓很怕蒙古軍會因而報仇，屠城，於是大家商量好，出其不意，把兀裏卜殺了，公舉石天應為帥，向木華黎投降。木華黎不僅不屠城，而且還任命石天應為興中府的知府，兼“兵馬都提控”。不久，叫石天應跟隨他南征。石天應立了若幹功勞，木華黎把他逐漸提拔為“龍虎衛上將軍、元帥、左監軍”；其後又升他為“右副元帥”。洺州打下以後，石天應奉命守葭州，守了相當時候，在壬午年九月襲取河中府於金將侯小叔之手。侯小叔在除夕反攻，石天應被自己的一個部下吳澤所耽誤，城破，巷戰，死在癸未年春節的正午。