於是，廢除吳氏皇後變得順理成章了，明憲宗立刻就頒了一道廢後的詔書：“先帝為朕簡求賢淑，已定王氏，育於別宮待期。太監牛玉輒以選退吳氏於太後前複選。冊立禮成之後，朕見舉動輕佻，禮度率略，德不稱位，因察其實，始知非預立者。用是不得已，請命太後，廢吳氏別宮。”就這樣，吳氏結束了她為期不到一個月的皇後生涯。
走了一個吳氏，按照先王遺詔，理應由王氏頂上。而通過吳氏的慘痛經曆，王氏對自己的角色扮演也就很明白了——皇帝喜歡的人是萬貞兒，自己隻不過是一件封住悠悠眾口的擺設而已。
其實，王氏性情溫順，寬厚待人，與萬貞兒也鬧不出什麼矛盾，總算相安無事。就這樣平穩無波地過了兩年，37歲的萬貞兒喜得皇子，也是朱見深的第一個兒子。母因子貴，萬貞兒也就被封為了貴妃，而朱見深更是承諾孩子將來就是太子。而且，萬貞兒的家人也得以晉升，父親萬貴官至錦衣衛都指揮使，哥哥萬通封指揮使、萬喜官至都指揮同知，就連大學士萬安都跑來跟她套近乎，認她做姑媽。於是，萬家全因這小皇子而個個平步青雲，可謂一人得道，雞犬升天。
按理說，這樣萬貞兒也應該是再無他求了，因為家人全都官位顯赫，兒子也貴為太子，將來就是天子啊！但是，事情並非如此，她的小皇子連名字都還沒取，就夭折了。
萬貞兒痛苦難當，一是因為自己的孩子無緣喪命，更重要的是她已經半老徐娘，想再生也已是不可能的事了。但是，這一切還是阻擋不了明憲宗對她的迷戀，夜夜寵幸，不過她始終還是沒有生出來。
可不管皇帝再怎麼忠貞不二，就算立個“忠貞”牌坊給他，堂堂大明朝又怎能後繼無人啊！萬貴妃顯然已經生不出孩子，江山還是要有接班人的。於是，眾大臣紛紛上疏皇上“雨露均沾”，以防江山後繼無人。可這些“腐朽”老臣的話，又怎能勸得動明憲宗對於萬貴妃的那份依戀。
但是，後宮佳麗無數，這對於任何一個性欲正常的男人來說都會想著偷腥，何況是擺在眼前專等著你“享用”的呢？也許“忠貞”的明憲宗真是考慮到了子嗣問題，於是他忽然多寵幸了些形形色色的妃子，當然這其中也不乏懷孕的。這件事對已經生不出孩子的萬貞兒萬貴妃來說，可是不小的打擊。明憲宗多年來的千依百順，她又怎肯和其他的女人一起來分享。於是乎，她讓這些懷孕的女人都一個個地“流產”了。而幸運的是，和前後兩任皇後吳氏與王氏一起被選入宮的柏賢妃躲過了流產事件，順利產下了皇次子朱祐極，皇帝喜得皇子，萬分高興，馬上立了朱祐極為太子，可小太子在快到三歲時就忽然暴斃身亡了。
這下皇帝又愁眉不展了，已經要30歲了，卻膝下無子。這事兒，要是放在今天，可能沒什麼大驚小怪的。但是，在那個時代，而且身為天子，若沒有兒子，這絕對是稀有之事，也是不可以的。
一天，一個太監給朱見深梳頭。這太監名叫張敏，他看到明憲宗最近一直氣色很差，精神不好，就知道明憲宗又在苦惱沒有兒子這件事了。作為奴才總是善於揣測聖意的，尤其是皇帝的貼身奴才。而且有一句話叫“皇帝不急，急死太監”，況且皇帝已經急了。於是，這個太監撲通跪在了地上，告訴明憲宗說，其實他已經有兒子了，而且都已經6歲了。皇子的名字叫朱佑樘，是皇帝偶爾興起“臨幸”過的一個宮女紀氏所生。於是，掩藏了6年的小皇子被立為了新的太子。
這小皇子是怎麼逃過萬貴妃的呢？萬貴妃那“孩子一律死”的令牌怎麼就單對他不好使了呢？也許，這的確可以說是，深宮裏難得的一寸暖人光芒了。他們發揮集體的智慧把大明朝未來的儲君藏得滴水不漏，讓他慢慢長大，直到6歲。也許，是萬貴妃太過殘忍專利，讓身邊的很多人都看不下去了，才有了集體保護小皇子的行動吧！當然，說出此事的太監、朱佑樘的生母以及其他參與此事的人，就又全部犧牲了。
萬貞兒萬貴妃當然不會放過事件的主角——朱佑樘，可是朱佑樘日夜由周太後嚴加保護，她也很難得手。而且，其後，明憲宗的其他子女也先後出生了。萬貴妃意識到自己的時代即將逝去，不由鬱鬱寡歡，最終暴疾而死，享年59歲。
明憲宗為其罷朝七日，並且以皇後的禮儀將她下葬在天壽山西南，還給她封了一個上好的諡號——恭肅端慎榮靖皇貴妃。按照明朝的製度，隻有皇帝和皇後死後才能葬於天壽山陵區，像萬貞兒這樣的妃子隻能葬在西郊的金山，可是她卻被朱見深安葬在了十三陵陵區內。
今天在十三陵西南約兩公裏處的蘇山腳下，有一占地約兩萬平方米的陵園，即是萬貴妃安葬之處。墓碑雕雲鳳紋，中間一“卍”字，既表墓主“萬”姓，且寄吉祥之意。