將藥用植物，依其用途而加以大別，大概可分類為下列的三種：——
A.醫藥
B.漢方藥
C.民間藥
A是用於現代的醫術的醫藥，許多是收載在日本藥局方裏的。其未經收載者，也作為新藥，在被應用。
B是用於漢方醫術的藥，在現下，漢方衰微了，而賣藥之內，漢方藥還很多，那消費量也很大。在日本，賣藥的年產額為二億圓內外，其中約五成是用漢方藥的。近年由藥學及醫學兩方麵，漢方藥之研究非常盛行，從漢方藥中陸續發見有價值的醫藥，為現代的醫術所采用者，也已經不少。所以A與B的區別，漸次有了撤廢的可能性了。
C是包含著自古相傳，俗間用以為藥的植物的，然而凡所謂藥，幾乎全是靠了俗間的經驗，這才知道藥效的，所以C和A以及和B之間，也難於加以劃然的區別。在這裏，所取的意義，是民間所用的藥草中，那藥效成分等，未經學術底研究的東西。