但這樣的人物在日本民間聲望極高，他的“明知不可為而為之“的精神廣受世代傳誦。這也使得幕府被推翻後，鬆平家雖不再是貴族，卻依然擁有極大的勢力。鬆平家雖被稱為逆賊，但鬆平節子卻能嫁入皇室的緣由。清仁把自己的曾外祖父作為偶像，年少時就離職，建立一個屬於自己的，比新選組更強大的組織。鬆平家族作為自己的後盾，逐步將觸角深入日本的政界和商界。
時機成熟之後，清仁成立了以自己為核心的組織。組織本身沒有名字，不過外界知曉它存在的人，通常稱其為“黑衣組織”。所有成員都用酒名作為自己的代號，清仁的代號是貝裏昂，代表酒中之王的意思。不過這個代號幾乎沒有人直接使用，組織中的人通常稱他為BOSS、或者那位先生。
組織一直以隱秘的方式擴充實力。清仁很有戰略頭腦，他認為在現代社會，知識就是力量。因此秘密讚助了不少頭腦聰明家境貧寒的少年，讓他們去國外學習，以此培養組織後背力量。這群少年裏有一個重要人物叫岡本十三郎，稍後再提。而組織真正發展壯大是在1989年金融危機之後。當時的日本陷入了大蕭條時代，經濟大幅倒退。一些少壯派的政治家對此極度不滿，認為這是日本政府不作為的原因，又覺得是美國擔心日本強大而從中作梗。因此這些政治家提出了自己的主張，認為日本應該建立強有力的政府，並且擺脫對美國的依賴。他們還從日本的曆史中得出結論，凡是日本強盛時期往往都是中央集權時代，尤其是強有力的天皇掌權的時代。清仁迅速掌握了這些人的心理動態，順勢出擊，將這些人納入麾下。並且用自己常年積攢下來的人脈和財力，大力扶植這些年輕的政治家，幫助他們在仕途上有所建樹，從而得到了這些人的衷心擁護。兩者相互勾結，采用包括暗殺等手段打擊異己勢力。在其後的幾十年裏，組織的勢力膨脹起來，全麵滲透在日本的政治、軍事、經濟、外交等領域。甚至在某種程度上，組織可以稱為日本的影子政府。
但是清仁並沒有因此滿意。他很清楚，組織是以自己的能力和威望一手打造而成的。而隨著年歲的增長，他開始擔心自己去世之後，組織也會土崩瓦解。而組織一旦瓦解，而他個人站在日本頂點的野心，以及希望日本成為世界最強大國家的野心就會付之東流。這樣的擔憂，促使他希望用現代科技的手段，使自己得以長生不老，這個想法最終演變為潘多拉計劃。