司空
漢光武帝即位，置大司空官，負責水利工程、城防建築、宮室營建等事務。與太尉、司徒共同討論皇帝交議的國政，定議後會銜上奏。參考：《後漢書·百官一》雲：“掌水土事。凡營城起邑，浚溝洫、修墳防之事，則議其利，建其功。凡四方水土功課，歲盡則奏其殿最而行賞罰。”建武二十七年（公元51年）去“大”，稱“司空”。漢獻帝建安十三年（公元208年），改司空為禦史大夫，職掌不變，不領禦史台，與前代禦史大夫僅僅是名稱相同而已。司空領宗正、少府、司農三卿。司空屬吏有長史一人、掾屬二十九人、令史及禦屬四十二人。
大司馬
漢武帝廢太尉設大司馬，加於大將軍、驃騎將軍、車騎將軍、衛將軍之上。東漢光武帝又廢大司馬為太尉，為掌管軍政和軍賦的最高官職，即全國最高軍事長官。東漢時太尉與司徒、司空並稱三公。東漢光武帝劉秀時削弱三公的權利，後來三公幾乎無實權隻是榮譽的象征。東漢末年，三公（太尉、司徒、司空）已成為虛職，在三公之外另設大司馬，大司馬和大將軍均位在三公之上，如劉虞、權臣李傕。三國時期，各國在三公之外另設大司馬，一般由大將軍升遷而來。如：魏國的大司馬曹仁、曹休、曹真；蜀漢的的大司馬蔣琬；吳國設有大司馬和左大司馬、右大司馬，一般由大將軍或者上大將軍升遷而來，如丁奉、呂岱、陸抗、施績、朱然。
九卿
東漢沿西漢製度，以太常、光祿勳、衛尉、太仆、大鴻臚、宗正、大司農、少府為九卿。與西漢不同的是，東漢九卿分隸屬三公。太常、光祿勳、衛尉三卿屬太尉；太仆、廷尉、大鴻臚三卿屬司徒；宗正、大司農、少府三卿屬司空。東漢九卿均於官稱上加“卿”字，如太常卿等，秩中二千石。除此之外，東漢九卿與西漢不同者還有：一、光祿勳除西漢的五官中郎將、左中郎將、右中郎將、虎賁中郎將、羽林中郎將之外，增置東中郎將、北中郎將、西中郎將、南中郎將。二、少府尚書改稱尚書台，由西漢的常侍曹、二千石曹、民曹、主客曹改為六曹：改常侍曹為吏曹，增三公曹，將主客曹分為南主客曹與北主客曹。尚書台增設左右丞二人，諸曹侍郎各六人，令史諸曹各三人，事務繁劇的曹增令史各三人。尚書台組織較西漢尚書要重要、龐大的多。
將軍
在秦代以前，武職將軍名號隻有大將軍、前、後、左、右將軍。漢代將軍不常設，主征伐。事畢則罷。漢文帝時始有車騎將軍、衛將軍。東漢的將軍也是中央政府的重要組成部分，有大將軍、驃騎將軍、車騎將軍、衛將軍、前將軍、後將軍、左將軍、右將軍。大將軍位在三公上，驃騎將軍、車騎將軍、衛將軍位次列於九卿，位在三公下。前、後、左、右將軍，位次列於九卿，不常置。東漢中期以後，太後臨朝稱製，外戚以大將軍執政，與太傅、三公合稱為五府。以上將軍均開府，府屬有長史、司馬各一人，從事中郎二人，掾屬二十九人，令史禦屬三十一人。將軍以本號領軍的，各有部曲、校尉。漢魏時期，有軍功者比比皆是，授予官職的難度加大。因此常在“將軍”前冠以某個名號以作為他的官職，這種名號並無一定，名號之間也無上下級關係，因此稱為雜號將軍。臨事設置，事畢即撤。如驍騎、樓船、材官、伏波、貳師、度遼、龍驤等，或以所領部隊（如驍騎、材官），或因奉行的任務（如李廣利攻貳師城）。唯度遼將軍因南匈奴所部時有內亂，自永平八年（65年）後常設。漢末以後，開始出現四征、四鎮、四平、四安等重號將軍。
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