最後，為了徹底解放被暗魔吞食的全部光明分子，大明尊又作第三次召喚。這一召喚出來的是惠明使。惠明使以其美妙的像出現在男女暗魔之前，在男暗魔之前現女像，在女暗魔之前現男像使他們和她們因貪愛而吐出所有的光明分子。惠明使開動日月二大“明船”。由光明之柱運載“善子”回到光明的本界。但暗魔吐出光明分子時，還隨著吐出了“罪惡”，那黑暗的東西落在大地上：一半在濕地（海洋）上，生出一個凶惡的妖怪，被殺死；一半在幹地上，生出五樹。是為一切植物的起源。原已懷孕的女暗魔的胎兒流產，落在大地上，產生陸海空中的各種動物。鬥爭至此尚未完結。黑暗之王和他的配偶仿照惠明使的形象生下亞當。亞當身上集中了被黑暗囚禁的光明分子的大部分。隨後，夏娃也生下來，她的光明分子少些。就是由黑暗惡魔生下來的亞當和夏娃，他倆成為人類的祖先。亞當和夏娃有光明分子形成聖潔的靈魂，卻被禁閉在不聖潔的**內。因此，大明尊派遣夷數（耶穌）下界喚醒沉睡中的亞當，使他認識他自己的光明本性和宇宙的由來。夷數叫亞當嚐生命樹（知識樹）的果實。亞當於是徹悟，悲痛呼號道：“願災害降給創造我身的妖魔，願災害降給將我靈魂囚禁在**裏的妖魔，願災害降給那使我成為奴隸的反叛者！”
亞當雖然痛楚**囚禁了他的靈魂，因而決定恢複純潔的本性，但後來終於忘卻自製，又與夏娃生了悉特。人類是悉特的後裔，於是光明又遭囚禁。摩尼以為，人必須克製**，拋棄物質享受，鍛煉純潔的本性，成為“新人”，以便上升永遠光明境界，永享極樂。
但上升並不是一件簡單的事。依照摩尼的教義，人有三類：第一類是他的教團中的僧眾“電忽那”，那“虔誠信教者”，嚴守戒律。不婚，不擁有私產，“平一易衣，日受一食”，不肉食，不殺生，不能采摘果實乃至種植穀物。因為這一切都有礙於解放光明。為此。他們常被稱為“清靜電那勿”，他們死後，還由“光明三柱”引向明界。第二類是摩尼教的一般教士，那所謂“聽者”。他們雖然也遵守某些戒律，但仍過著一般的世俗生活，死後要經過多少次輪回，等到完全淨化，才得上升。第三類是惡人，他們死後隻有在淒慘絕望中飄蕩，直到世界末日，到那時，一切光明分子重返明界。惡人墮入無明深坑。宇宙崩潰，熊熊烈火，無邊無際，延燒1468年。這就是中際的最後結局，也是後際這最後一個時代的開端。
後際實際上是初際的重現，光明與黑暗永遠分離。光明與黑暗在中際的多次反複鬥爭，結果隻是恢複到初際兩者並存的狀態。光明畢竟不能照亮黑暗，使無明世界出現光明。
總的來看，摩尼的教義是極端的二元論神學和悲觀主義的世界觀。它在本質上反映伊朗奴隸製危機時期被壓迫被奴役的人民大眾對現實的不滿。當然，這種寄希望於虛幻的明界天堂的宗教不可能給人民大眾指引擺脫壓迫和奴役的出路。但在教人忍受殘酷的現實的同時，它也指出了一個消極抵抗現實的原則。那就是對生育和生產概予否定，這一點確為摩尼教義所獨有，而也就是由於這一點，使得它不能長久見容於薩珊朝的統治者。
摩尼被關進伊朗西南部恭德沙卜爾城的監獄，受盡酷刑，於公元277年2月27日死在獄中。