1972年2月10日，《南昌日報》報道：9日下午，省市春節擁軍慰問團在省委常委、省革委副主任黃先、省委常委、市委書記於德馨等率領下，慰問了省市各部隊單位。這是在去年“九·一三”事件後，第一次在本地報紙上出現省領導的名字。
該報2月27日又報道：最近南昌市委、市革委召開深入開展“工業學大慶、農業學大寨”動員大會，省委書記、省革委主任程世清出席了會議並講話。這是“九·一三”事件後，他首次在報紙上出現名字。
在中國，很長時問裏，從中央到地方，所謂講政治，在某種層麵上就是講究官員們名字的排列。如果媒體上官員往常排位的順序發生了變化，那麼，多半是有些什麼關係或玄機在起作用；倘若媒體上某個重要官員的名字，突然消失了一段時問，這其後必將如魯迅先生所言：不在沉默中死亡，就在沉默中爆發……
可惜程世清在本地報紙上露個臉，並不意味著“爆發”。
整整四個月後，6月27日《南昌日報》在第二版上，發表市塑料二廠黨總支的文章《不能圖虛名去搞新產品》，說有一時期，由於劉少奇一類騙子形“左”實右的反動路線的幹擾，出現了大搞形式主義，搞“報喜”，搞“花樣”，今天搞這種產品“突破”，明天搞那樣產品“獻禮”，完全置國家計劃不顧。三十多種產品生產出來，“報喜”後就一個個被擱置一邊，無法投產，造成極大的浪費。
同一版上還發表了署名為“織紅球”的短評《善於辨別真偽》，稱：要提高路線覺悟，識別政治上的騙子，在一段時問亂提口號、瞎作規定，要搞什麼“第二次工業革命”的時候，我市不少單位作了抵製……
從報紙上透出的信息裏，起初對程世清還比較低調、模糊，讀者難琢磨出這是在說程世清是“劉少奇一類騙子”，還是他被“劉少奇一類騙子”給騙了。到了1974年的“批林批孔”運動，對程世清的火力就顯得猛烈、而且集中了——
1974年6月15日，《江兩日報》發表署名為紅長城的《評反動文章（作客）》。即1967年8、9月問發表在《人民日報》上的《親切的關懷，光輝的榜樣——記程世清同誌到林副主席家裏作客》。在此前後江西的報紙上，程已被稱為“林彪反革命集團在江西的代理人”。
同年11月4日，《南昌日報》發表署名為孫國山的文章《沿著毛主席的革命路線，建設社會主義的新型城市——批判林彪及其死黨破壞城市建設的罪行》：
1949年剛解放時，全市五十至一百人的工廠隻有六個……現在全市工廠林立……僅從1949年到1968年的二十年中工業總產值就增加了三十多倍。職工隊伍從兩萬多人增加到了二十多萬人。新建房屋道路麵積也比解放前夕增加了近兩倍……
然而林彪及其死黨大罵：“南昌市敵情嚴重”，“基本上是資本主義的”，並叫嚷：要讓南昌市“一把火燒掉”“漲大水衝掉”“衝到鄱陽湖去喂王八才高興”。林彪及其死黨破壞南昌城市建設的卑鄙手法是打著戰備的幌子，大搞“城市搬遷”，要把南昌市“一分為三”，工廠“一分為二”，肆意大拆民房，大遷工廠，並采取法西斯手段強令“企業關門，工廠停工，大小廠一起搬”，“搬機關遷學校，一個區要全盤搬”，“先拆，後搬，再建”，“要二十四小時不停拆，三更半夜也要搬”，“要趕鴨子一樣往外趕”……把一個社會主義的南昌市搞得千瘡百孔，損失很大……
其實到了這時，程世清已失去自由之身兩年多了，他是1972年6月28日被中央隔離審查的。據說，中央先通知免除程在江西的職務，要其速來北京。那天上火車時，他還是包廂，有秘書、警衛員陪著。一出北京站，一輛北京吉普迅速靠了過來，下來幾個軍人，其中一個說：程世清就交給我們了，你們可以回去。程世清因為精血飽滿一向如上了釉彩的臉，一下暗成千年的陶器。
因與“林彪反革命集團”有牽連，1978年10月23日，程世清被正式逮捕，關押於北京秦城監獄。他曾與姚文元、劉豐、王秉璋同居秦城監獄一室。他說起姚文元：“隻知道看書，有時也下下棋，但什麼話也不說。他是個書生，不是搞政治的人，主要是聽了康生、江青的話。”（吳東峰博客《野半廬主程世清》）