軍方建議首選地點為京都，其理由是在明治維新之前，皇室在京都一氣住了一千多年，該市有皇宮舊址、寺院、神宮達一千餘處。京都在日本人心目中的地位，就像羅馬在歐洲人心中一樣神聖，它對日本人有非常重要的曆史價值與宗教價值。猶如打蛇需打七寸，基於日本人對這座城市的特殊感情，正是美軍轟炸它的原因。
杜魯門將自己一個人關在房間裏考慮了一會。出來後，他簽署了軍方可以視戰局隨時在日本投擲原子彈的命令，但他在那個報告上勾去了京都，他說：“這樣做，是為了安慰我的靈魂，而不是讓日本人逃脫不幸。”
然後，他如釋重負，回到自己房間，像一個嬰兒一樣在床上睡著了……
1945年8月6日，星期一早上，正好是大家剛上班的時間，美國在日本廣島扔下了第一顆原子彈。廣島駐有陸軍第二軍總部，該軍擔負了整個南日本的防禦。
突然間，天空閃出一團藍白色的強烈亮光，廣島所有的時鍾從此永遠停在8點16分2秒上。這顆叫“小男孩”、其威力相當於1.25萬噸梯恩梯炸藥的原子彈，在離地麵1900英尺（約580米）的高度爆炸，一個大火球衝天而起。幸免於難的人隻記得原子彈爆炸的最初一刻，滿眼是光，強烈無比的光，使人睜不開眼，好像一個碩大無比的閃光燈泡在廣島市上空爆裂。
火球發射出來的熱隻延續幾分之一秒，但30萬攝氏度的高熱使爆心半徑一公裏內的花崗岩都溶化了。爆炸中心投影點附近的溫度急劇上升到3000—4000攝氏度；距離1500米處的物體表麵溫度，也達到540攝氏度。片刻之後出現一股可怕的衝擊波，三公裏內所有建築物，除了少數幾幢堅固的、防地震的建築物，全部被摧毀。全市76000座建築中，隻剩下6000座大體殘存。燃燒的房子像多米諾骨牌一樣接連不斷地轟然倒塌。
漸漸地，在充滿濃煙和焦土的城市裏，大量從廢墟中掙紮出來的人出現了，他們靈魂出竅，如出自一個模子，盲目地在倒塌的電話杆、斷牆和瓦礫堆周圍轉悠，耷拉著眼睛，或直直地往前走，一言不發。而且，許多人一絲不掛，身體僵直。原子彈爆炸後產生的熱已經燒掉了人們身上的大部分服飾，隨後的衝擊波又剝光了他們服飾的殘留部分。身穿吸熱的黑色衣服的人，燒傷最為嚴重，乍看上去就像一塊在移動的焦碳。穿白色或淺色衣服的人要幸運些，但身上也烙上了衣服上的圖案……