全骨魚類
全骨魚類（Holostei）在進化階段上介於軟骨硬鱗類和真骨魚類之間的輻鰭魚類，在分類學上作為輻鰭魚亞綱的一個次綱，從晚二疊世開始出現，侏羅紀最繁盛，從白堊紀開始大為衰退，生存至今的僅有雀鱔（Lepisosteidae）和弓鰭魚（Amia）。前者生活在北美、中美及古巴淡水中；後者生活在北美各大湖及河流中。全骨魚類的主要特征是無後吻骨，有前眶骨，鼻骨不組成眼眶；上頜骨後部遊離，既不與外翼骨聯結，也不與前鰓蓋骨聯結；下頜骨有冠狀突；有間鰓蓋骨；所有鰭的鰭條僅在遠端部分分節；尾鰭為半歪型或正型。主要包括以下幾個目。
1半椎魚目
體紡錘形或高紡錘形；口裂短小；眶下骨數目多；牙齒通常為磨狀齒，有時為錐形齒；頭部骨片和鱗片頗厚；軀幹背緣在背鰭後急劇減低；所有鰭均具有很發達的棘鱗；鱗片通常為菱形。常見於三疊紀的有半椎魚（Semionotus），主要產於北美、南非及澳大利亞晚三疊世，南美早三疊世有可疑的紀錄。中國新疆烏魯木齊附近中三疊世產有中華半椎魚（Sinosemionotus）。繁盛於侏羅紀的鱗齒魚（Lepodotus）是半椎魚類的另一典型代表，有很多種，從晚三疊世開始出現，以侏羅紀最繁盛，到白堊紀晚期絕滅，其地理分布很廣，幾乎遍布全球。在中國西南地區特別是四川盆地的侏羅紀地層中所產鱗齒魚尤多。貴州興義中三疊世海相地層中產有與鱗齒魚相近的亞洲鱗齒魚（Asiatolepidotus）。
2硬齒魚目
體形很高而扁，側視幾成圓形；背、臀鰭的基線很長，尾鰭外形對稱；無棘鱗；口小；吻短；無下鰓蓋骨和間鰓蓋骨；齒骨和鋤骨生有磨狀齒。典型代表硬齒魚（Pycnodus）分布於歐洲早白堊世至始新世、西印度晚侏羅世、澳洲早白堊世、北美白堊紀、非洲和亞洲始新世。在我國西藏昌都地區侏羅紀地層中產有西藏硬齒魚（Tibetodus）。
3弓鰭魚目
體紡錘形；頰部通常寬大；前鰓蓋骨近平垂直，但一般下部向前延伸；通常有一塊輔上頜骨；下頜骨具有高的冠狀突；口緣齒通常為圓錐形；尾鰭為半歪型或正型；鱗片為方鱗或圓鱗。
4副半椎魚亞目
此類魚在某些方麵還殘存軟骨硬鱗類的性質，但在許多方麵具有全骨魚類的結構。有些學者把它作為一獨立的目，有些學者認為它與弓鰭魚類有親緣關係，列入弓鰭魚目中作為一個亞目。此類魚在三疊紀進化很快，頰部變異大。前鰓蓋骨的大小和形狀在不同的屬中變化很大。典型代表副半椎魚（Parasemionotus）產於馬達加斯加和格陵蘭早三疊世海相地層。
弓鰭魚亞目
主要包括以下兩個科：金尾魚科（Caturidae），通常被認為是弓鰭魚類的主幹和弓鰭魚科的祖先。體紡錘形或延長；頂骨小；前鰓蓋近乎垂直；頰部具有幾塊很發達的次眶骨；上頜骨略隆起；下頜骨很長；背鰭基短；胸鰭比腹鰭發達得多；所有鰭均具有棘鱗；鱗片菱形。主要代表為金尾魚（Caturus），分布在歐洲晚三疊世至早白堊世，西非晚侏羅世地層。中國貴州興義中三疊世海相地層中產有與此類魚相近的中華真顎魚（Sinoeunathus）。
弓鰭魚科，眼通常小；頰部很寬大，具有很發達的後眶骨；頂骨大；上頜骨較高；口裂大，上頜骨和下頜骨具有強大的錐形齒；咽板骨大；鰭條粗壯，間距大；無棘鱗；背鰭基通常很長；尾鰭後緣凸圓形；鱗片菱形或圓鱗。現生代表為弓鰭魚（AmiaCalva）生活在北美湖河中。此屬化石見於北美晚白堊世、始新世，歐洲古新世、中新世；也見於中國內蒙古、新疆及吉林等地的始新世地層。在中國中生代後期常見的有中華弓鰭魚，有些學者認為它代表一獨立科——中華弓鰭魚科（Sinamiidae），另一些學者將其列入弓鰭魚科。其形態特征與弓鰭魚屬相似，但尾鰭為半歪型，背鰭基較短些，頂骨愈合為一塊，眼眶後的兩塊眶後骨較小，鱗片為菱形。與中華弓鰭魚相近的另一個屬是伊克昭弓鰭魚（Ikechaoamia），分布於內蒙古鄂爾多斯市早白堊世地層，也見於浙江縉雲晚侏羅世地層。
6針吻魚目
身體長，吻部延長而尖；頂骨互相愈合；鰓條骨數目多；副蝶骨具有牙齒，偶鰭無棘鱗；尾鰭為正型；體背部鱗片菱形，體側鱗片相當高。其生存曆史從晚侏羅世到晚白堊世。典型的代表為針吻魚（Aspidorhynchiolae）分布於歐洲中、晚侏羅世，南非和澳洲白堊紀地層。