駐紮在浙江鎮海金雞山，設防備戰。他巡視沿海大小島嶼、碼頭和工事，發現甬江入海口的北岸，招寶山頂上的威遠城修得太高，炮台過於暴露，一旦被圍，孤立無援，難於旋轉。
歐陽利見立刻將部屬召來，命令他們在招寶山後山與前山連接處增設月城炮台，充當威遠城的前衝，另外增修隱蔽的小道，直通內地，以便被圍時可以從小道得到增援。
六十八歲的彭玉麟出任兵部尚書，奉旨趕赴廣東，會同當地官
員籌劃防務。彭玉麟調集四千名湘軍，包括王永章的四個振字營，從海路開向廣東，自己率領隨從走陸路抵達廣州。六十三歲的平江人李元度應彭玉麟之邀，與他同行。
湘軍在廣東集結後，王永章的振字營駐守大縶。這裏是虎門右邊的屏障，王永章率領勇丁開山劈石，營建炮台。
彭玉麟察看地形，巡視炮台和營壘，整理虎門要塞。李元度率部堵塞虎門海口。
彭玉麟下令在沙角設防，開鑿山石，修建炮洞，以便掩護士卒。他還下令編組沙戶漁船，分守橫門、磨刀門和崖門等入海口。他約見兩廣總督張樹聲和廣東巡撫裕寬等人，協商就地舉辦團練，按照陸軍規製，慎重挑選營官，勤加操練，在短期內訓練出一支守土禦侮的兵力。
閩浙總督何璟認為自己不懂軍事，請求解職，清廷便任命楊昌濬為閩浙總督。
楊昌濬還沒到達軍營，李鴻章的女婿張佩綸便已逃遁。清廷將此事下發左宗棠和楊昌濬議處。楊昌濬依舊息事寧人，清廷責怪他袒護張佩綸，將他調任陝甘總督，加太子太保。
楊昌濬在閩浙總督任上，幫辦福建軍務，為台灣軍民抗法籌款籌兵，不辭辛勞。
清廷還任命在湖南養病的楊嶽斌到福建幫助左宗棠辦理軍務。
9月20日，湖南提督鮑超受命奔赴雲南會辦軍務。
左宗棠與曾國荃商量軍事和糧餉，將駐防兩江的原左宗棠舊部
恪靖營，加上另撥的兩營，由左宗棠帶往福建。 五十五歲的道州人何紹采統領恪靖親軍營、浙江楚軍寅字營，
還兼統楚軍後營，辦理福建海防事務。
法國海軍封鎖台灣各海口以後，內地與台灣文電不通，援台的
交通也中斷了。左宗棠密電劉銘傳在台灣招募兵勇一萬人，以資防
備，但劉銘傳卻消極辦理。 左宗棠在金陵調集舊部商籌餉項，然後起程，取道江西湖口前往福建。他又在江西抽調三營軍隊進入福建，並派員在九江、湖口和崇安等處設立轉運站，負責糧餉軍械的轉運。
他從南平乘船抵達福州，在距福州十多裏的水口登岸，福州官方為他舉行了隆重的入城儀式。他所經過的街坊和店鋪，都排設香案迎接，全城的士民扶老攜幼出迎“左相侯”，並在他的行館大廳上張貼了一副楹聯：
數千裏蕩節複臨，水複山重，半壁東南資保障； 億萬姓軺車爭擁，風清霜肅，十閩上下仰聲威。
老百姓之所以如此隆重地歡迎左宗棠，是因為他曾任閩浙總督三年多，在福建進行了一係列革新，施行了許多善政，老百姓對他有感情。他們對軟弱昏庸的官吏極其反感。法國軍艦進泊閩江突襲中國艦船時，總督何璟每天躲在總督府內拜佛念經；欽差大臣張佩綸英豪自負，非三品以上的官吏都不放在眼裏，但一聽到炮響就會暈倒在地；船政大臣何如璋每天設宴喝酒，嚴令“戰期未至，各艦不準配發子彈，不準無令自行起錨啟動”。因此，法國的軍艦可以逞威，炮擊毫無準備的清軍艦艇和福州市區，致使中方損失慘重。
左宗棠抵達福建以後，扭轉了危險的情勢。他這次到達福州之後，便再也沒有離開了。