三十一年（1905年），盛宣懷與上海紳董創設紅十字會，加入瑞士總會，中國遂擁有紅十字會主權。十一月，電奏將上海鐵路總公司裁撤，並歸鐵路總局唐紹儀督辦，以專事權。鐵路大權遂轉入袁世凱的親信、以唐紹儀為首的交通係。
三十三年（1907年）三月，盛宣懷奉命與呂海寰趕緊商定加稅免厘一事，呂海寰旋任外務部尚書，清廷即命盛宣懷會商袁世凱、張之洞妥速籌議。十一月，奉旨入京，慈禧召見，對盛宣懷說，蘇杭甬路事發生風潮，或言英國要下旗撤使，或言百姓要抗糧拒官，特召汝來，解此一結。命盛宣懷隨同外務部妥籌辦理。
三十四年（1908年）二月，盛宣懷出任郵傳部右侍郎。該部主管鐵路、電報、航運、郵政，前三項皆為盛宣懷創辦。乃命下三日，仍以商約原差又令前往上海，他向慈禧陛辭，慈禧問他何故又要離京，盛宣懷知道支他往上海不是慈禧的意思，不敢多言，唯唯而已。慈禧還說：我有物賞汝。但退朝之後，並無賞物。他認為這也是因為有阻撓者。盛宣懷將漢陽鐵廠、大冶鐵礦、萍鄉煤礦合並為漢冶萍煤鐵廠礦有限公司，奏折上後，慈禧對他說：藏富於商，乃是正辦。盛宣懷於四月赴日本就醫，考察廠、礦、銀行，並與日本元老伊藤博文、鬆方正義等研求憲政、幣製，參觀公、私圖書館。十月，在神戶知道慈禧與光緒帝先後病死，隨即起程回上海。
宣統元年（1909年）六月，輪船招商局董事會成立，選舉盛宣懷為會長。盛宣懷認為備員郵傳部而歸商選，似於體製非宜，電郵傳部婉卻。郵傳部尚書徐世昌等勸他擔任。
二年（1910年）正月，清廷派盛宣懷為中國紅十字會會長。攝政王載灃罷黜軍機大臣外務部尚書袁世凱後，逐漸起用盛宣懷。七月初十日，盛宣懷到達北京，赴郵傳部本任，並幫辦度支部幣製事宜。十九日，浙路總理開缺，江西提學使湯壽潛電稱盛宣懷為蘇浙路罪魁禍首，不應令其回任，請收回成命，或調離路事以謝天下。清政府將湯壽潛即行革職，不準幹預路事。十二月初六日，盛宣懷替代袁世凱的親信唐紹儀為郵傳部尚書。李鴻章之子李經方為左侍郎，吳鬱生為右侍郎。三年（1911年）四月，內閣改製，各部行政長官同負國務責，盛宣懷由本官簡授郵傳大臣。