劉毅懸在樹上的屍體是第二天天大亮後，被路過的鄉民發現的。接到報告，原本因為劉毅逃脫而有些忐忑不安的王鎮惡這才放下心來。隨後，王鎮惡下令將劉毅的屍身拖回江陵，在城中的集市上斬首示眾，這次奇襲江陵的行動總算是圓滿成功了。
在交戰過程中，盡管王鎮惡的武藝差勁，可也身先士卒，帶頭拚殺，據說他用的長槊在戰鬥中折斷，自己更是身中五箭，不過可能是因為穿的盔甲比較好，沒受什麼大傷。取得的成果更驚人，僅用很少的兵力，進行了一天的交戰，就滅掉了名震天下的大藩鎮劉毅，留下了中國戰爭史上的一個經典戰例。王鎮惡從此異軍突起，成為劉裕手下最耀眼的將星之一。
當初劉裕曾對王鎮惡說過，如果行動不順利可以在江邊等著他，王鎮惡在巷戰中也讓人一個勁嚷嚷劉裕所率的主力馬上就到，但實際上，可能為了保障王鎮惡順利偷襲，避免過早驚動劉毅的探哨，劉裕進軍的速度並不快，直到劉毅上吊的二十天後，也就是十一月十三日，劉裕所率的四萬西征大軍主力才到達江陵。從這個數字上看，劉裕顯然是做了兩手準備的，一旦王鎮惡不成功，以這些兵力打一場大仗也綽綽有餘了。
不過，既然王鎮惡成功了，平定荊州已用不著打大仗，鬥誌昂揚的幾萬大軍如果就這麼空來一趟，一仗不打就回去，豈不是有點浪費國家財富？於是，劉裕決定趁熱打鐵，幹脆趁著這個機會，把譙蜀一並解決掉算了！因為巴蜀遠離建康，交通不太方便，現在留在建康城中負責後方事務的人又讓劉裕不太放心，所以對譙蜀的討伐，劉裕並不打算親征。經過一番盤算，劉裕決定任命資曆較淺，但文武全才的年輕將領朱齡石為益州刺史，擔任討伐軍統帥，率劉裕的妻弟寧朔將軍臧熹、龍驤將軍蒯恩、下邳太守劉鍾等將領，分出西征軍的一半，即兩萬人，前往伐蜀。除此之外，又像《三國演義》中描寫的諸葛亮一樣，他寫了一份詳細的作戰計劃密封起來交給朱齡石，讓他到了白帝城再打開，到時候按計劃行事。
除了安排朱齡石伐蜀，劉裕在江陵停留期間還做了幾件大事。首先當然是對劉毅集團殘餘人員的處理，這可是個技術活，就像做外科手術，高明的醫生會精確地割除病變的髒器，盡量不損傷其他身體組織：劉毅的主要謀士大士族出身南蠻校尉郗僧施，一向不買劉裕的賬，是劉毅最堅定的死黨，這種人留之無用，“哢嚓”了事；另一個重要助手毛修之，原先與劉裕和劉道規兄弟都有交情，而且劉裕也愛惜他的將才，因此赦免不問；另外多數非核心幕僚，如文學家謝靈運等人，都被劉裕赦免並留用；劉毅的堂兄江夏相劉粹大義滅親，有為西征大軍提供糧草的功績，加封灄陽縣男，食邑五百戶，其實等劉裕到達江夏的時候，劉毅早死數天了，傻瓜才會為他殉葬，給劉裕大軍提供糧草是理所當然的事。王鎮惡以此戰的功績也隻是封漢壽縣子，食邑五百戶，劉粹得到的賞格幾乎與其相當，劉裕的用意不問可知。安定人心的工作當然不能隻限於上層，所以劉裕又順勢大幅度減免了荊、江二州的捐稅，使兩地民心大悅。
其次，既然已把荊州許給了司馬休之，當然得說話算話。但讓司馬皇族無功受祿，憑空得這麼大一塊蛋糕，又覺得有點不妥。而且荊州過大過強，長期以來，荊州的掌控者常常成為左右朝政的權臣，本事差點的也能和朝廷分庭抗禮，儼然就是第二中央。如今的晉朝天下，劉裕即朝廷，朝廷即劉裕，他當然不希望荊州再次成為自己的掣肘，因此，削弱荊州的實力勢在必行。他采取的措施是調整晉朝的行政區劃，將荊州南半部十個郡，大致相當於今天湖南省的地方劃出來，以長沙郡為治所，建立一個新州——湘州，與原荊州並立，形成今天湖北與湖南兩省的雛形。
就在劉裕處理這些事物期間，有兩封書信送到江陵，帶來的不是什麼好消息：建康可能要出事！
事情還要從那個留在建康負責後方讓劉裕感到不放心的人說起。現任豫州刺史兼監太尉留府事諸葛長民，在聽到劉毅戰敗自殺的消息後，感到了一陣兔死狐悲的哀傷。雖然以他的眼光早料到劉裕遲早會和劉毅翻臉，但劉裕動手如此突然和下手如此之狠，以及劉毅的下場之慘，仍讓這位貪財好利的豫州刺史大為震驚。他簡直不敢相信意氣風發的劉希樂就這麼沒了！
如果粗略來看，劉毅的死和諸葛長民似乎沒多大關係，因為他並不是劉毅的同黨。實際上當初劉裕對付劉毅的挑戰時還拉諸葛長民當過幫手，他的為人和劉毅也沒多少相似之處，愛財但沒有太大的權力欲，隻想做一個快樂的貪官，好好享受到手的金銀財寶、美色嬌娃。原先諸葛大人以為，官到做時方恨小，賄到受時方恨少，貪婪是人類進步的階梯。但等他真正到了職高位顯、權傾一方的時候才發現，自己真是生不逢時，貪官也不是這麼好當的啊！