這時雲貴前線戰事也亦有了明顯進展。繼安親王嶽樂為定遠平寇大將軍的貝子章泰等各路平叛大軍，浩浩蕩蕩開進滇黔。章泰用西洋人南懷仁鑄造的大炮轟陷了胡國往據守的貴陽，胡國柱棄城逃跑。清軍又接連攻下遵義、安順、都勻等城。接著乘勝率軍西進，在平遠火焚夏國相的象陣，殺得吳軍丟魂落魄逃出黔境。自此，吳世藩小朝廷隻剩下雲南一省了。
章泰領軍進得雲南，賴塔和趙良棟亦各率軍趕到。清軍所到之處，吳軍望風披靡。清軍很快進到距昆明三十裏的歸化寺。困守雲南的小皇帝吳世藩驚恐異常，急令郭壯圖應戰。章泰和賴塔複用火攻破了郭壯圖的象軍，趙良棟亦擊饋了夏國相、胡國柱企圖攔截他們的防線，並切斷了吳軍水上運糧通道，於是清軍便將昆明重重圍住。吳世藩嚇得躲進城中五華山宮城，嚴令心腹“分門守禦，負固抗拒”。並秘密派人持函赴藏，向達賴喇嘛求救，允許事後割地回報。不料這人走不多遠，即被趙良棟捕獲，吳世藩那最後一點指望也成了泡影。到了這時，夏國相等雖已看出吳家小朝廷必亡無疑，但因其反動本性所驅，仍在負隅頑抗。清軍圍困昆明數月，城中彈僅糧絕，吳軍軍心遂變，南門守將首先打開城門，放清軍進入城內。清軍邀功心切，人人奮勇，個個爭先，揮槍舞刀，殺向四城。那夏國相、胡國柱竟還夢想兵士抵抗，怎奈兵丁紛紛倒戈，幫助清軍攻打進來。夏國相，胡國柱被手下兵士捉住，獻給清軍。等到清軍部隊趕到五華山時，郭壯圖已經舉火自焚而死，小皇帝穿戴著皇帝的龍袍懸梁自盡。康熙皇弟得到保潔的奏折，心裏高興異常，感慨萬千詩興大發，揮筆寫就《滇平》詩一首：“洱海昆池道路難，捷書夜半到長安。末矜幹羽三苗格，乍喜征輸六詔寬。天末遠收金馬隘，軍中新解鐵衣寒。回思幾載焦勞意，此日方同萬國歡”。
第二天，康熙發布喻旨，命將吳三桂骸骨分發各省，昭示中外。並將吳世藩的首級懸掛示眾，夏國相等人淩遲處死。已被逮到京城的尚之信也因被人告發種種罪行處了死刑。從此，曆經八載，蔓延十省的三藩之亂宣告平定，這是康熙二十年，此時的康熙皇帝年僅十二七歲。康熙皇帝頒詔大赦天下，減免各種賦稅，“恤兵養民，與天下休息。”不久，大清王朝出現了康乾盛世的繁榮局麵。
三 康熙收複台灣
1 寸土不讓——台灣問題成為康熙的一塊心病
三藩之亂時，台灣鄭經以為可以渾水摸魚，便會同耿精忠去攻廣東，占了汀州、泉州、漳州等地，時時襲擾內地，康熙調兵遣將、厲兵秣馬正與收複台灣時，卻天降彗星。
七月的京城，正是盛夏季節，天氣十分炎熱。世界似乎變成了紅羅炭燃燒正旺的大薰籠。康熙二十年的這日清晨，康熙皇帝正在乾清宮進行禦門聽政，雖然屋子裏放著冰塊，康熙皇帝還是感到一陣陣的熱浪不停地向他襲來。這時內閣學士李光地出班奏道：“福建總督姚啟聖有奏折一道，恭請聖覽。”
康熙聽說奏折來自福建，忙問：“姚啟聖所奏何事？”“台灣內亂不息，所立新主年幼，收複台灣，此其時也。”李光第說到這裏又看了一眼奏折接著說道，“他還保舉內大臣施琅當此重任。”聽到此言，康熙皇帝從龍椅上站起來，在地上來回踱著步子。康熙的目光注視著殿外四周和殿前的庭院裏，數不清挺拔蒼勁青鬆，他的記憶回到了多年以前。
康熙七年，施琅向康熙上疏，提議收複台灣。康熙覽畢甚喜，立召施琅進京，親自向他垂詢攻台方略。施琅便向康熙麵陳雙方形勢：鄭經其人“智勇俱無”，鄭兵不滿數萬，戰船不過數百，“若先取澎湖以扼其喉，賊勢立絀，徜後複固，則重師泊台灣港口，而以奇兵分襲南北二路，則台灣計日可平。”可惜由於當時鼇拜未除，施琅攻台主張未能實現，反免了他的水師提督官職，將他改授內大臣，隸鑲黃旗漢軍，不許回海防前線了。康熙那樣做也是為日後收複台灣埋下了一個伏筆。台灣在康熙的心裏，有如一塊美玉，卻被鄭經那雙肮髒的雙手占據著。康熙一想到這裏，便覺食不甘味，夜不安寢。他想，大清天下一統，可台灣不服大清命令，自立為王，長此下去如何得了？
鄭成功死後，被人譏為“頑童”的鄭經繼位。當時鄭軍內部矛盾重重，“每聞風聲，慌亂不堪”。台灣，猶如失去母親的孩子，孤懸海外，風雨相兼，惶惶不安。在此情況下，清帝康熙果斷地決定促使台灣回歸。
康熙的政策是“寓剿於撫”，將作戰與招撫做統一部署。清軍一麵在金門不斷打擊鄭軍，一麵展開大規模的政治攻勢。攻心奪氣的結果，