衛生信息標準的基礎研究的主要目的為。一是為衛生信息資源規劃提供科學的分類技術與框架；二是為衛生信息係統建設的頂層設計提供模型支持；三是為評價衛生服務提供規範的統計口徑和統一的指標內容；四是為衛生係統各業務部門應用係統的設計與開發提供基本數據元標準和數據規範化描述規則，促進區域衛生信息的有效交換和廣泛共享，為衛生信息係統建設的統一規劃、頂層設計、避免重複建設、降低開發成本、消除信息孤島、增進各係統間的互聯互通、協調運作、數據交換和有效共享提供標準化基礎。目前我國已頒布的標準如。《中國醫院信息係統標準代碼》，其中包含了國家標準、部頒標準55個；《全國衛生係統醫療器械儀器設備分類與代碼》是國家標準商品物資分類與代碼68類的延拓；《化學藥品分類與代碼》、《全國醫療服務價格項目規範》、《SNOMED中文版》以及《醫院信息係統軟件基本規範》等各類應用係統的衛生部建設規範指南。
1.社區衛生服務信息係統是為采集、加工、存儲、檢索、傳遞居民醫療、衛生信息及相關的管理信息而建立的人機係統。基礎數據的標準是未來該係統是否能夠實現與其他機構信息交換及在區域內信息實現的基礎。
2.數據字典編碼標準數據字典包括國家標準數據字典、行業標準數據字典、地方標準數據字典和用戶數據字典。為確保數據規範，信息分類編碼應符合我國法律、法規、規章及有關規定，對已有的國標、行業標準及部標的數據字典，應采用相應的有關標準，不得自定義。使用允許用戶擴充的標準，應嚴格按照該標準的編碼原則擴充。在標準出台後應立即改用標準編碼，如果技術限製導致已經使用的係統不能更換字典，必須建立自定義字典與標準編碼字典的對照表，並開發相應的檢索和數據轉換程序。
業務流程重組（businessprocessreengineering，BPR）是20世紀90年代得到迅速發展並被廣泛實施的一種新的管理思想，最初於1990年由美國的MichaelHammer提出，在上世紀90年代中期首次引入中國學術界，而後隨著我國ERP應用熱潮的興起而逐漸被國內所熟悉。根據哈默的定義。“BPR就是對企業的業務流程（process）進行根本性（fundamental）地再思考和徹底性（radical）地再設計，從而獲得在成本、質量、服務和速度等方麵業績的戲劇性地（dramatic）改善。”顯然，BPR強調以業務流程為改造對象和中心、以關心客戶的需求和滿意度為目標、對現有的業務流程進行根本的再思考和徹底的再設計，利用先進的信息技術以及現代化的管理手段、最大限度地實現技術上的功能集成和管理上的職能集成，以打破傳統的職能型組織結構（functionorganization），建立全新的過程型組織結構（processorientedorganization），從而實現機構經營在成本、質量、服務和速度等方麵的巨大改善。它的重組模式是。以作業流程為中心、打破金字塔狀的組織結構、使組織能適應信息社會的高效率和快節奏。要成功地實施BPR必須做好兩方麵的工作，一方麵重新設計組織結構框架、管理體係、業務流程等硬性因素；另一方麵轉變領導行為、組織文化、溝通方式等軟性因素。
在沒有數字化前，居民到社區衛生服務中心就診，醫生無法查看存放在健康檔案室的該居民健康檔案，也無法獲得該居民是否建立了檔案，數字化改造後，居民可持個人標識物（如市民卡、就診卡或號等）直接自助掛號或是掛號員刷卡掛號後。門診醫生可在門診醫生工作站上查詢該居民個人健康檔案及曆次就診記錄。如發現該居民需要建立個人健康檔案，可在門診醫生工作站上建立檔案。醫生開具電子處方、化驗單、檢查單後，居民可持卡到收費處直接交費。檢查完後，檢查檢驗結果自動傳回到醫生工作站並歸入該居民的個人健康檔案。
近些年來，英國、美國、加拿大、澳大利亞等一些國家先後投入巨資，開展了國家和地方級以電子健康檔案和電子病曆數據共享為核心的區域性衛生信息化建設。這些舉措的主要推動力來自於倫理上的需求——最大限度地保證公民的醫療質量和安全性，以提升整體醫療服務質量、提高醫療服務可及性、降低醫療費用、減少醫療風險。其成效可能需要一定的時間方能顯現。
通過衛生信息共享來提高醫療服務效率、提高醫療服務質量、提高醫療服務可及性、降低醫療成本以及降低醫療風險的作用已經得到充分驗證，並被公認是未來衛生信息化建設的發展方向。目前，越來越多的國家已經認識到開展國家級及地方級的區域衛生信息共享的核心內容是居民健康檔案。
在信息技術飛速發展的過程中，我國社區衛生信息化建設經曆了從無到有、從局部到全局、從醫療業務向其他各個業務領域不斷滲透的過程，信息化逐漸成為社區衛生服務體係不可或缺的部分。
我國社區衛生信息化建設具有明顯的階段性，可以將其分為三個階段，目前整體上處於第二階段，部分地區開始進入第三階段。第一個階段是在21世紀前的計算機技術應用階段，如社區衛生服務機構財務管理、收費管理、藥品管理等，將傳統業務管理模式計算機化，實現計算機技術在衛生係統的廣泛應用；第二個階段是進入21世紀後，依托計算機網絡技術加快業務領域的信息係統建設階段，如公共衛生、衛生監督、婦幼保健、新型農村合作醫療等信息係統建設。SARS危機以後，衛生部在幾年時間內，完成了覆蓋中央、省、市、縣、鄉五級的網絡直報係統，各級疾病預防控製機構和衛生行政部門可以同時在線報告信息，極大地提高了傳染病疫情等報告的及時性和準確性。同時，加強了國家和省兩級突發公共衛生應急指揮決策係統建設，極大地提高了突發公共衛生事件的應急反應和危機處置能力。在醫療衛生服務機構，信息化建設的重點轉移到臨床信息係統建設，如逐步推廣HIS、PACS、RIS、LIS等臨床信息係統。前兩個階段的信息化建設，主要依賴於計算機和網絡技術的發展，與其他行業相比，總體水平還很落後。