整個六月份，日本海軍都在加緊備戰中渡過。
在外執行任務的鬆島、高千穗、高雄、大和等艦迅速歸隊，正在船塢修理的嚴島、橋立、扶桑、浪速、比睿等艦則被要求抓緊搶修。
至六月下旬，所有艦艇和官兵均已聚集於佐世保，開始進行緊張的訓練和實戰演習。其中常備艦隊重點演練了分進合擊的戰術。
七月上旬，在海軍軍令部長牟田倉之助的主持下，海軍編製進行了大規模調整。
牟田將海軍常備艦隊和西海艦隊合編為聯合艦隊，以伊東祐亨為聯合艦隊司令官，坪井航三為常備艦隊司令官，相浦紀道為西海艦隊司令官。
常備艦隊編成如下：
戰艦：大風、鳳翔、鬆島、嚴島、橋立、扶桑、浪速、高千穗、比睿、吉野、高砂、千代田、秋津洲；
通訊艦：八重山；
附屬艦：駐紫、愛宕、摩耶、鳥海、天城；
另有運輸船山城丸、近江丸，以及魚雷艇五艘。
西海艦隊主要由小型鐵甲艦金剛號以及數艘炮艦組成，負責日本近海防衛。
至此，日本海軍已經完成了對清作戰的組織準備工作。
在海軍戰略方麵，牟田主張采取攻勢，利用己方的優勢兵力奪取和掌握製海權。日本大本營采納了牟田的主張，並根據海軍的戰況和進展，製訂了相應的作戰方案。
7月22日，日本大本營向伊東司令官發出命令：貴司令官當率領聯合艦隊控製朝鮮西岸海麵，在豐島或安眠島海域附近的方便地區，占領臨時根據地。同時，日本政府還通過英國駐日本公使楚恩遲轉告清政府：如果中國派兵增援駐朝軍隊，應視為對日本表示敵意的行動，日本有權發起攻擊。
當時，海軍大臣西鄉從道提出質詢：此期間若遇中國艦隊，或中國有增派軍隊之事實，日本艦隊立即開戰，在外交上有無困難?
外交大臣陸奧宗光果斷地回答：“作為外交上的順序，沒有什麼問題。”這就賦予了日本海軍襲擊北洋艦隊的行動自由。
在這種情況下，曆史上的豐島海戰不可避免的重現了。
不過，自認為有英國的幫助和德國的“暗中支持”，李鴻章在思想上更為積極。
當時，牙山清軍已經處於險境，和日軍相比兵力大大不足，但是由於有良好的防禦工事，因此李鴻章決心大舉增援，以使日本不敢妄動。
7月22日早晨，丁汝昌命濟遠，廣乙、威遠三艦由威海出發，以副將濟遠管帶方伯謙為隊長，護衛愛仁、飛鯨等運兵船到牙山，並到大同江一帶遊巡。本來，丁汝昌準備率海軍大隊隨後接應，但李鴻章來電否定了丁妝昌的計劃，不過考慮再三，尤其是從德國回航的新式裝甲炮艦“寧遠”號和“撫遠”號已經抵達威海，正在緊張的安排人員和演練武備，所以本著持中而論的念頭，他下達了“以致、靖二艦負責接應”的命令。
由此，豐島海戰的麵貌被徹底改寫。
23日，濟遠等三艦抵達牙山。24日早晨4點，愛仁號到達牙山，8時，卸載完畢，即出牙山口返航．同日下午，飛鯨來到。因為威遠已在早晨送電報往仁川，此時尚未返回，隻有濟遠、廣乙兩艦協助卸船，再加上飛鯨裝兵雖然較少，但其他雜項較多，除四個營的糧米八百石，軍馬四十七匹外，還裝有大量的餘銀、炮械、子藥等件，所以卸船比較費時間。
此時，中國軍艦發現一日艦在白石浦口外遊弋。到下午5點，威遠由仁川回到牙山。威遠管帶林穎啟報告稱：接英國艦長羅哲土的消息，說日本大隊兵船明日即來。
方伯謙見情況緊急，考慮到威遠是木船，不能承受炮火，而且行駛遲緩，萬一出口遇敵，徒然損失一船，便令威遠於當天晚先行離開牙山。