軟的、硬的都不行，葡萄牙就開始做起了小醜。而葡萄牙人和台灣，也就是在這時期扯上了關係。葡萄牙人做“小醜”的方式，就是收買中國沿海的“奸民”，以及和倭寇聯合，一道在中國沿海搶掠。他們相繼在福建走馬溪和浙江雙嶼島建立了貿易據點。但是好景不長，這些據點被明軍給拔掉了。值得一提的是，就是在他們占有雙嶼島期間，一次葡萄牙船隊路過台灣，看到了這個美麗的島嶼，有了“福摩薩”的稱呼。那艘船上，恰好有當時葡萄牙在馬六甲的總司令佩雷斯。根據葡萄牙有關史料記錄，當時的葡萄牙人確實曾經有過動議，是否要在台灣建立殖民地。後來，葡萄牙船隊曾經從雙嶼出發，嚐試對台灣島進行考察，不料卻遇上了風暴。這次旅程，反而讓他們看上了毗鄰福建的澎湖列島。當時的葡萄牙馬六甲總督在聽到屬下的彙報後，曾經由衷的感歎說：“如果能夠在澎湖得到一塊自由土地，那將會是我們財富的源泉。”殖民者們有時候也“強盜所見略同”。後來的西班牙人、荷蘭人都是這麼想的。
雖然想的一樣，但葡萄牙人沒這麼大的膽子。當年被中國海軍在屯門揍得頭破血流的情景至今曆曆在目，何況這時候的葡萄牙也已經實現了他們的目的。他們夥同倭寇以及海盜李光頭、林三等人盤踞的雙嶼島，在後來日本人的曆史記錄中，被稱為“十六世紀東方的上海”。那裏被葡萄牙人搞成了貿易集中地，每天出入雙嶼島的商船就有上百艘之多。不但貿易利潤驚人，葡萄牙人還在島上設立教堂、建立總督府，實現了直接統治。如此局麵下，葡萄牙人當然不願意再找麻煩。但是好景不長，明朝嘉靖二十七年（1548年），明王軍由浙閩提督朱紈發動雙嶼島之戰，一舉摧毀了這個“走私集散地”。之後明軍又在福建走馬溪大破葡萄牙人，兩場戰鬥的結果，就是把葡萄牙人之前幾十年的辛苦全都打包收了。葡萄牙人依然兩手空空，無法在中國得到一塊土地。